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單細胞分選要考慮的問題及優(yōu)勢介紹2022/10/18
單細胞分選通過細胞識別、細胞挑取和細胞轉(zhuǎn)移、跟蹤實時分析四個步驟可以實現(xiàn)對懸浮體系中任何單一類型細胞或稀有細胞(如循環(huán)腫瘤細胞、內(nèi)皮細胞、干細胞以及血液、骨髓中相關(guān)細胞等)的抓取分離、分析,細胞可以轉(zhuǎn)移到PCR管等后續(xù)實驗裝置。利用流式細胞分選技術(shù)進行的單細胞分選,具有精度高、通量大、分選參數(shù)多,成本相對低等優(yōu)點,通過流式分選出足夠多的符合要求的單細胞進行下游實驗并沒有那么容易。一、下面三方面是要考慮的問題:1、活性細胞活性狀態(tài)對后續(xù)實驗而言很重要,就拿轉(zhuǎn)錄組分析為例,無論是RNA-Seq還是高
單細胞分離分的好,才能做得好!2022/10/13
單細胞測序的難點在于如何把不同類型的組織解離成單細胞懸液。目前,主要的單細胞分離方法有口吸法、顯微操作法、流式細胞法、微流控。顯微操作法是一種能夠直接觀察到單細胞分離的方法。這一方法能夠準確控制單個細胞的吸取與釋放,但是對實驗操作的要求較高,不利于規(guī)模化操作,F(xiàn)ACS則能夠大規(guī)模獲得單細胞樣本,該方法是利用流式細胞儀,借助于細胞表面標記分選出特定群體的細胞或單個細胞。雖然這一方法需要專門的設(shè)備,且細胞的消化和分選過程會對細胞狀態(tài)產(chǎn)生一定的影響,但是該方法的效率和準確率較高,標準統(tǒng)一,有利于不同實
單細胞DNA甲基化的發(fā)展歷程及研究目的2022/09/21
由于技術(shù)進步,目前單細胞DNA測序現(xiàn)在可以作為常規(guī)實驗,并且研究人員可通過該技術(shù)詳細描述細胞群體中的異質(zhì)性。細胞間差異有可能對應(yīng)表現(xiàn)在表觀遺傳標記的差異,進而與基因表達有關(guān)。因此,具有測量單細胞水平上的全基因組DNAme的能力將有助于深入了解轉(zhuǎn)錄調(diào)控和細胞異質(zhì)性,以及完善對DNAme模式在細胞分裂過程中建立并遺傳了特定的基因座的理解。基于亞硫酸氫鹽的全基因組甲基化測序是*用于DNAme研究的金標準,達到單堿基分辨率。亞硫酸氫鹽處理后使未甲基化的胞嘧啶殘基脫氨基變成尿嘧啶,發(fā)生了甲基化的胞嘧啶受到
單細胞鋪板時如何鋪出合格的板子?2022/09/09
單細胞鋪板是將一個孔加入少量無血清培養(yǎng)基,晃動浸潤整個孔底,然后用移液槍吸至第二孔,同樣方法浸潤孔底,其它孔依此類推,這樣整個孔底都是濕潤的,細胞懸液會平鋪在整個孔底。單細胞鋪板的好壞決定了后續(xù)實驗的成敗,這個實驗看似簡單,其實也不是那么好做,其中關(guān)鍵是要鋪得均勻鋪得平整,其中的操作蘊含著豐富技巧。要鋪出一個好的板子,必須要做到一下幾點:1、單細胞重懸貼壁細胞培養(yǎng)完成后需要將細胞消化收集,并獲得單細胞懸液,但這時候即便消化下來也會連在一起了。這時我們需要注意:消化細胞需要選擇適用的消化液、適當(dāng)?shù)?
單細胞分離的方法和技術(shù)亮點介紹2022/09/09
單細胞分離提取系統(tǒng)用于各種類型的單細胞分離培養(yǎng)、純化、檢測;獲得單克隆細胞;用于單細胞基因擴增,用于單細胞測序等。一、單細胞的分離方法:1.機械法首先輕輕地研碎葉片組織,然后再通過過濾以及離心純化細胞。相比于酶解法,機械法對細胞進行分離有如下2個特點,分別是質(zhì)壁分離的情況不會發(fā)生與不會有酶對細胞造成傷害。2.酶解法利用果膠酶對植物的葉片進行處理,使得細胞間的中膠層發(fā)生降解,從而使具有代謝活性的細胞被分離出來。用來分離細胞的果膠酶不但可以使中膠層發(fā)生降解,還可以使細胞壁軟化。所以在使用酶解法對細胞
這樣進行單細胞分離實際操作更有效2022/09/08
目前,單細胞多組學(xué)分析正在如火如荼地進行著,在各大雜志上發(fā)表了一些重磅的研究成果。也許你也很想嘗試一下,但是在那之前,你需要把單細胞分離出來。理想狀態(tài)下的單細胞分離速度快、效率高,而實際操作可能效率低、時間長。從異質(zhì)細胞群體中分離單細胞主要有人工分離、熒光激活細胞分選和微流控技術(shù)三種方法。當(dāng)然,除了成熟的方法外,還不斷涌現(xiàn)出新的精確度和特異度分離的新方法。如果您想要的細胞在懸浮狀態(tài)中含量相對較高,流式分選是您理想的選擇。如果樣本為實體組織,則可將膠原蛋白及其它細胞外蛋白質(zhì)分解。但是酶消化對細胞的
單細胞分離不理想,您需要了解新的技術(shù)和技巧2022/08/18
如今,單細胞多組學(xué)分析正在如火如荼地開展,各大雜志上不斷有重磅的新成果發(fā)表。也許您也躍躍欲試,不過在此之前,您需要分離出單細胞。您理想中的單細胞分離是不是快速而高效的,而現(xiàn)實中的過程也許是低效而漫長的。在此,我們將介紹一些新的細胞分離技術(shù)并分享一些操作時的小技巧。細胞分離的挑戰(zhàn):準備分離單細胞的研究人員必須克服許多挑戰(zhàn)。他們希望獲得純正的目標細胞群,且細胞的各種特征都保持不變。如何才算不錯的分離方法?它應(yīng)當(dāng)保持細胞活力,提供足夠數(shù)量的細胞,并且可根據(jù)未來的需求而擴展。它還能夠防止細胞聚集,并且操
單細胞轉(zhuǎn)錄組對于疾病研究的應(yīng)用說明2022/08/09
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是近年來生物學(xué)領(lǐng)域比較火的技術(shù)之一,憑借著其分辨率能夠精準的剖析樣本細胞組成信息。隨著細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展,在多個應(yīng)用領(lǐng)域都有巨大的應(yīng)用潛力。總體來說,目前細胞轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用主要有:腫瘤具有很強的異質(zhì)性,這種異質(zhì)性對于腫瘤的疾病進展和藥物療效都有至關(guān)重要的影響。了解腫瘤微環(huán)境及免疫微環(huán)境的組成有助于我們對腫瘤更清晰的了解,從而發(fā)現(xiàn)潛在的治療靶點。目前,單細胞測序已廣泛應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境的研究中。該研究繪制了從非萎縮性胃炎-萎縮性胃炎-腸上皮化生-早期胃癌患者胃黏膜的單細胞圖譜,研
淺析單細胞測序的作用與意義所在2022/07/20
單細胞測序是指獲取單個細胞遺傳信息的測序技術(shù),即對單個細胞水平上,對基因組或轉(zhuǎn)錄組進行提取擴增和高通量測序分析。該技術(shù)能夠揭示單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),包括結(jié)構(gòu)變異、拷貝數(shù)變異、RNA表達水平等數(shù)據(jù),使不同細胞類型得以精確區(qū)分,并有助于科學(xué)家在但細胞水平進行分子機制的研究。為什么要做單細胞測序?對于多細胞生物來說,在細胞的分裂和分化過程中,必然會逐漸產(chǎn)生或大或小的差異,即遺傳信息的異質(zhì)性。例如,同一腫瘤組織中的不同細胞內(nèi)涵不同基因組和轉(zhuǎn)錄組等遺傳信息,就臨床利用上而言,這種差異或能影響某
單細胞RNA測序的技術(shù)流程及應(yīng)用2022/07/11
單細胞RNA測序是指在單細胞水平上對轉(zhuǎn)錄組進行測序的方法,是目前生物學(xué)研究領(lǐng)域的一項熱點技術(shù)。與普通高通量RNA測序相比,單細胞RNA測序可以分辨單個細胞間的生物學(xué)差異,識別出易被忽視的罕見細胞群體和細胞亞群。測序技術(shù)與其他RNA測序的基本原理相似,流程包括細胞制備、文庫構(gòu)建、測序和數(shù)據(jù)分析。其中單細胞制備和單細胞文庫構(gòu)建是重要的環(huán)節(jié),決定了數(shù)據(jù)質(zhì)量、測序通量、精確度、靈敏度和可重復(fù)性。單細胞的分離制備技術(shù)目前主要有流式細胞分選術(shù)、免疫磁珠細胞分選技術(shù)、顯微操作法、微流控技術(shù)等。單細胞RNA測序
單細胞轉(zhuǎn)錄組的基本概念,一起來了解下 2022/06/23
單細胞轉(zhuǎn)錄組就是某一時刻單個細胞內(nèi)所有mRNA總表達量,其表達量反映該細胞的總體特征。單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的出現(xiàn)使得我們可以把研究的精度從組織多細胞層面精確到單個細胞領(lǐng)域,可以單獨研究某個細胞或者某群細胞具體的特征,特別是對于細胞發(fā)育、腫瘤微環(huán)境、單細胞圖譜繪制方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。普通轉(zhuǎn)錄組的思路也可以應(yīng)用到單細胞轉(zhuǎn)錄組。普通轉(zhuǎn)錄組相當(dāng)于把一群細胞或一個器官混合到一起去提取RNA,獲得的是每個細胞中RNA表達量的平均值。單細胞是把每個細胞單獨分出來去提取RNA,然后建庫測序,獲得是是單個細胞的表達值
一文帶你詳細了解一下單細胞分析2022/06/20
單細胞分析能夠準確的提供出細胞內(nèi)物質(zhì)及細胞內(nèi)生化反應(yīng)的準確信息,能夠反應(yīng)出細胞的功能與化學(xué)組分間的特定關(guān)系,以及某些細胞在生命體內(nèi)的特殊作用。在對單細胞分析研究中,主要涉及單細胞進樣、溶膜、衍生及檢測技術(shù)。單細胞分析中如何取樣是該方法研究的關(guān)鍵之一。單個全細胞進樣可以用電遷移或流體動力學(xué)進樣。由于以上方法需要對毛細管的進樣端口進樣腐蝕,并且需要一些精密微操縱系統(tǒng),所以操作比較復(fù)雜。細胞在進入毛細管通道后,一般需要對細胞進行溶膜以便進行細胞內(nèi)物質(zhì)的分析分離檢測。通常使用表面活性劑或者用低滲溶液達到
單克隆分離的原理及正確操作方法2022/05/27
單克隆分離是由單個細胞進行分裂、增殖,形成具有相同遺傳性狀的細胞群體。由于來源于同一個祖先細胞,擴增形成的細胞群還具有十分相近的形態(tài)特征和基本一致的生理、生化特性。是建立穩(wěn)定細胞系的重要環(huán)節(jié),因而在現(xiàn)代生物技術(shù)和醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域中應(yīng)用廣泛。構(gòu)建穩(wěn)定細胞系的常用方法有質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法和病毒侵染法,兩種方法都需要借助抗生素篩選,通過單細胞克隆分離最終獲得表型穩(wěn)定、遺傳特性一致的細胞群。質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法是通過轉(zhuǎn)染試劑將質(zhì)粒dna導(dǎo)入細胞,其中極少部分dna會整合到基因組,通過單細胞克隆分離和抗生素篩選,獲得表達效率高
單細胞鋪板的特點及工作原理如下所示2022/05/24
單細胞鋪板采用最新的微流體技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)快速,高效,準確的細胞鋪板工作。并且分離過程輕柔,不會影響細胞的后續(xù)生長。能廣泛應(yīng)用于單抗開發(fā)中的CLD環(huán)節(jié),以及單細胞測序等。特點:快速---一塊96孔板1min。高效---單細胞鋪板比例近90%。活性---無損分選,高復(fù)蘇比例。無菌---一次性無菌芯片,可保證無菌分選,并且避免樣本交叉污染。原理如下:將細胞通過一次性的芯片上端加樣孔,注入到芯片腔體中。單細胞流在微流控通道中流過激光檢測區(qū)域,機器能對細胞進行識別,去除掉細胞碎片,死細胞以及狀態(tài)較差的細胞,
單細胞分離法能提供實時結(jié)果與分析2022/05/17
單細胞分離采用微流體技術(shù)分選細胞,對細胞無傷害,大于90%細胞培養(yǎng)活性率;同時具有高解析攝像,細胞克隆挑選可追溯的功能,并符合藥物監(jiān)管要求;采用微流體技術(shù),僅80μl珍貴樣本,即可獲取單細胞分選;5~10分鐘完成96孔板分選,同時適用384孔板分選;細胞分選用單細胞自動化挑選分注系統(tǒng)。細胞分離以數(shù)字方式記錄單細胞和匯合度的證據(jù),以供審查和提交至監(jiān)管機構(gòu),在多個時間點以非侵入的方式對細胞進行成像,以監(jiān)測克隆形成,使用高分辨率白光成像進行篩選,提供實時結(jié)果與實時分析,自動化和集成準備。從異質(zhì)性的細胞
單細胞挑選滿足不同類型細胞的挑選需求2022/05/17
單細胞挑選系統(tǒng)主要用于識別、挑取和轉(zhuǎn)移懸液中單細胞或單一類型細胞,借助高清晰度的CCD成像,操作者可以直觀地看到目的細胞,隨后通過操控軟件控制毛細管高效地完成對懸浮細胞或半貼壁細胞的挑取和轉(zhuǎn)移,比如挑選CTC、干細胞等。整個過程可視化、操作簡單、挑取準確,對各種類型的單細胞挑選游刃有余。單細胞挑選是全自動檢測分析、無損傷分離、精確轉(zhuǎn)移細胞克隆、單細胞或組織的操作系統(tǒng);需分選的細胞可被分離到50nl-12ul帶有培養(yǎng)基或基底膜的獨立環(huán)境。細胞克隆或組織片段可以被金屬刮取毛細管通過刮取移動模式從細胞
單克隆分離的方法及具體介紹2022/05/06
單克隆分離是建立穩(wěn)定細胞系的重要環(huán)節(jié),因而在現(xiàn)代生物技術(shù)和醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域中應(yīng)用廣泛,構(gòu)建穩(wěn)定細胞系的常用方法有質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法和病毒侵染法,兩種方法都需要借助抗生素篩選,通過單細胞克隆分離獲得穩(wěn)定、遺傳特性一致的細胞群。通過單細胞克隆分離和抗生素篩選,獲得表達效率高、整合穩(wěn)定的細胞群,最終構(gòu)建成穩(wěn)定細胞系;而病毒侵染法則是通過將攜帶目的片段的病毒,常用的如慢病毒,轉(zhuǎn)導(dǎo)入細胞,再通過單細胞克隆和抗生素篩選,獲得穩(wěn)定細胞系。目前常規(guī)的單克隆分離技術(shù)主要包括有限稀釋法、克隆環(huán)法和顯微操作法。有限稀釋法是通過將
淺談單克隆篩選的特點和篩選方法2022/05/06
單克隆篩選是根據(jù)細胞所具有的特性將單個細胞從混合的細胞樣品中分離出來的?種技術(shù),是抗體制備細胞株優(yōu)化、穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞株構(gòu)建、藥物靶點篩選等應(yīng)?中重要的?環(huán),能夠更好地為不同鄰域科學(xué)研究和藥物研發(fā)提供支持。一、特點:1、通用性篩選:適用于多種細胞,無需攜帶抗性熒光標簽。2、單列線性模式:適用于高價值細胞。3、提供克隆性證據(jù):可為每個克隆提供克隆形成圖像。4-溫和的微流控技術(shù):更高存活率,更低損失率。二、單克隆篩選的方法1、有限稀釋法:克隆/亞克隆:分離單個細胞置入多孔培養(yǎng)板的每個孔中培養(yǎng)。然后,用ELI
單細胞基因組主要具備以下這些優(yōu)勢2022/05/05
單細胞基因組是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術(shù)。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增,獲得高覆蓋率的完整的基因組后進行高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關(guān)系。從方法學(xué)角度來看,獲得高覆蓋率高保真性的全基因組擴增產(chǎn)物是準確全面的測序結(jié)果的保障。多重置換擴增(multipledisplacementamplification,MDA)利用隨機引物和等溫擴增可以獲得高保真的DNA大片段,但該方法的主要缺陷在于非平衡的基因組覆蓋率、擴增偏倚、嵌合序列及非特異擴增等。
淺析單克隆分離的三種分離技術(shù)2022/04/25
單克隆分離技術(shù)主要包括有限稀釋法、克隆環(huán)法和顯微操作法。有限稀釋法是通過將細胞懸液連續(xù)梯度稀釋,使最終在細胞培養(yǎng)板的一個孔中僅有1個細胞,再經(jīng)過兩周左右時間增殖,形成細胞群,再經(jīng)過驗證獲得穩(wěn)定克隆;克隆環(huán)法是通過在10-15cm的細胞培養(yǎng)皿中,將細胞接種低密度,使分散的單個細胞各自增殖成細胞群,用克隆環(huán)方式與周圍的細胞隔離開,通過胰酶消化,轉(zhuǎn)到新的孔板中繼續(xù)培養(yǎng)擴增,并檢測驗證而獲得穩(wěn)定克隆;顯微操作法是借助顯微鏡,在放大的視野下挑取單細胞,再轉(zhuǎn)至培養(yǎng)孔中,逐漸擴增獲得單克隆。這三種方法有各自一
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