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生物鐘是怎樣設定的2015/06/27

*，為了適應地球自轉引起的晝夜改變（尤其是光強和溫度），地球生物會通過生物鐘調控自己的活動。生物鐘周期與地球自轉周期相符，大約是24小時。那么，這個周期到底是怎樣決定并執行下來的呢？日本分子科學研究所(IMS)的科學家們發現，地球的自轉周期（24小時）銘刻在生物鐘蛋白KaiC的原子結構上。這種蛋白在藍藻中表達，是直徑10nm的小分子。這項研究于六月二十五日發表在Science雜志上，不僅有助于深入理解生物鐘的基礎機制，還可以幫助人們治療與異常晝夜節律有關的疾病。生物鐘一直是生物學研究的熱點領域，

NEJM：基因檢測的監管引發口水戰2015/05/30

隨著基因組測序逐漸步入臨床，相應的監管也成了熱門話題。*醫學期刊《NewEnglandJournalofMedicine》近日發表了一系列文章，強調了臨床基因組檢測的承諾與挑戰，特別是美國食品藥品監督管理局（FDA）對這些檢測的監管。休斯頓大學法律中心的BarbaraEvans聯合華盛頓大學的兩名研究人員發表了題為“TheFDAａndGenomicTests—GettingRegulationRight”的文章，批評了FDA對基因檢測的監管。不過，她們的言論立即得到了FDA代表的回應。作者認為，

Nature：除了抗生素人類還能靠什么2015/05/30

自亞歷山大·弗萊明發現青霉素以來，已經過去了八十多年。當年一鳴驚人的抗生素如今已經陷入困境，抗生素濫用導致的抗性問題成為了*難題。近年來，抗生素的效力在不斷降低，新抗生素的開發嚴重滯后。“我們需要做出改變，”葛蘭素史克的StephenBaker說。那么，除了抗生素人們還能夠用什么對抗感染呢？細菌界的殺手捕食性細菌是細菌世界的殺手，它們以其他細菌為食。人們希望利用這些細菌來治療感染，一些研究團隊已經開始在動物模型和體外培養的細胞中進行測試。食菌蛭孤菌（Bdellovibriobacteriovor

“博士后被遣返”背后的反智魅影2015/05/09

近日，一篇題為《留美博士后找不到工作流浪街頭，被遣返回國》的文章在朋友圈瘋轉。文章講述的是一位留美博士后被遣返，我國公務人員費盡周折為她尋找家人的故事。從社會管理的角度看，這是一篇充滿正能量的文章。但這樣一篇文章，細讀起來卻怎么都不是滋味。文章描述的故事并不復雜。作者將這位博士后的經歷描述得跌宕起伏，在美國的流浪經歷令人唏噓。然而，讓人感到不安的是文章中流露出的反智情緒。雖然故事的真實性尚無法考證，但相信公務人員費盡周折為遣返者尋找親人的案例并不少見。之所以對這一事件大書特書，原因不僅在于主人公

加州大學博士因數據造假撤銷其《細胞代謝》論文2015/05/09

由于論文數據造假，美國加州大學舊金山分校（UniversityofCalifornia,SanFrancisco）JamesPWarne博士撤銷其發表在《細胞代謝》（CellMetabolism）上的一篇論文。該論文主要研究肝臟中瘦素的作用，《細胞代謝》發布通告稱，美國科研誠信辦公室（theOfficeofResearchIntegrity）認定論文中部分數據造假，同時JamesPWarne博士承認為造假的數據負責。鑒于此，論文的作者們要求撤稿并對此引起的不良影響表示歉意。該論文的作者提出，盡管

罕見病診斷的新思路2015/04/11

罕見病的診斷和治療一直都是難題，而測序技術的出現則帶來了一絲曙光。一般來說，患者出現一些癥狀后，通常先看醫生，然后開展外顯子組測序，并借助研究人員，找到分子機制。然而，根據《美國醫學會雜志》（JAMA）上的一篇文章，這個順序現在反過來了。文章講述了一個荷蘭男孩的故事。他叫VincentPieterse，出生在2002年底。在嬰兒時期，他似乎很健康，不過隨著他漸漸長大，出現了學習障礙、輕微自閉癥、肌張力低下等癥狀，這表明他可能患有遺傳綜合征。不過，神經系統疾病和染色體異常的檢測結果均為陰性，而家族

指揮癌細胞的復雜信號網絡2015/04/11

zui近，美國耶魯大學和約翰霍普金斯大學帶領的一個研究小組，采用先進的技術和一種將工程學和醫學合并的方法，編制了關于“指導高侵襲性癌細胞的復雜信號網絡”的一些zui詳細的數據。耶魯大學系統生物學家和生物醫學工程師、耶魯大學系統生物學研究所主任AndreLevchenko說：“這是一組非常復雜的相互作用和過程。系統生物學方法通過分析癌細胞如何遷移到一起，以及如何單獨響應復雜信號，確定了這種復雜性。”四月八日在《自然通訊》（NatureCommunications）雜志上發表的一項研究中，Levch

NIBS、北大繪制線蟲RNA編輯圖譜2015/02/26

近期，由北京生命科學研究所和北京大學共同完成的學術成果“ProfilingtheRNAeditomesofwild-typeC.elegansａndADARmutants”在《GenomeResearch》雜志上公開發表。在這項研究中，研究人員采用鏈特異性RNA測序（RNA-seq）和全基因組DNA測序，繪制了BristolN2野生型線蟲和三個ADAR突變體不同發育階段的RNA編輯圖譜。本文共同通訊作者分別是北京大學生命科學學院生物信息中心魏麗萍教授和北京生命科學研究所研究員董夢秋博士。RNA編

Z全面的人類表觀基因組圖譜2015/02/26

，《自然》（Nature）雜志及其旗下相關的六大期刊同時在線發表24篇科技論文，發布涉及100多種人類細胞和組織的*張表觀基因組（Epigenome）綜合圖譜。表觀基因組指的是附著在基因組上的化學標記模式，其決定了哪些基因會被激活以及它們激活的方式及時間。由于表觀基因組調控了人體的正常發育，*表觀遺傳調控失常與從癌癥、自閉癥到心臟病等廣泛的疾病相關聯，這一巨大的數據寶庫預計將提供有關人類健康和疾病生物學大量新見解（延伸閱讀：4篇Nature文章公布重大成果：三大物種表觀基因組圖譜）。這24篇論文

同濟大學科學家PNAS解析致癌信號通路2015/01/15

來自同濟大學、南開大學等處的研究人員在新研究中證實，受損的Hipp信號可促進Rho1–JNK依賴性的生長。這一研究發現發表在1月12日的《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上。同濟大學生命科學與技術學院教授、科學家薛雷（LeiXue）是這篇論文的通訊作者。其主要研究方向包括腫瘤發生的分子遺傳學機制,細胞凋亡的分子生物學機制,阿爾茨海默病的分子生物學機制,Pax基因對胚胎發育和器官形成的調控作用及機制,以及治療腫瘤遷移和神經退行性疾病的中藥篩選。大量的研究證實，Hippo和JNK信號通路在生長調

新年癌癥研究激起巨大爭議2015/01/15

新年的伊始，一條有關大多數的癌癥病例都是由于壞運氣所致的爆炸性新聞，便占據了各大媒體的頭版頭條。那自那時起，便有許多人對這一新聞報道提出了批評意見，還有些人甚至將矛頭指向了Science雜志。*的頭條記者和新聞編輯都沒有充分地理解這項發表在1月2日Science雜志上的新研究。大多數的媒體都是以“三分之二的癌癥歸因于壞運氣”（Twothirdsofcancersareduetobadluck）或類似的標題來進行了新聞報道（延伸閱讀：患癌癥是運氣差？專家：是的）。一些人對報道這一統計數值的方式提出

吸煙引起的大腦反應男女有別2014/12/12

zui近，耶魯大學的研究人員使用一種新的大腦成像分析方法證實，吸煙可激活一種多巴胺驅動的滿意和快感反應，而這種反應在男女之間是不同的。相關研究結果發表在zui近的神經科學主流期刊《神經科學雜志》（TheJournalofNeuroscience），該研究使用一種PET（正電子發射斷層攝影術）掃描分析的新方法，創建了吸煙過程中多巴胺反應的“電影”，證明吸煙誘導的多巴胺激活發生在男女不同的腦區，男性的尼古丁依賴要比女性更快。實際上，通過確定男女尼古丁依賴性的*“多巴胺信號”，來識別和理解吸煙行為性別

兩篇Nature三篇子刊：細胞重編程的那些事2014/12/12

加拿大Lunenfeld-Tanenbaum研究所牽頭的研究團隊，日前以兩篇Nature三篇NatureCommunications的形式公布了細胞重編程研究ProjectGrandiose的成果。賽默飛蛋白生物學與分子生物學產品精彩*+免費試用*篇Nature文章描述了體細胞重編程得到的一種新型小鼠多能干細胞，F-class細胞。F-class細胞不論是形態還是分子都與之前的iPSC大不相同，能夠分化成為所有三種胚胎前體組織。在體外，F-class細胞比其他干細胞增殖得更快，而且具有低附著的特

Nature驚人發現：誰可媲美微生物組2014/11/20

來自紐約大學Langone醫學中心的微生物學家說，他們獲得了*個強有力的證據證實，天然存在于腸道中的病毒（他們將其稱作為“病毒組”（virome））像居住在腸道中、構成“微生物組”（microbiome）的細菌一樣發揮了維持健康以及對抗感染的作用（延伸閱讀：Cell驚人發現：可遺傳的微生物組）。在歷時兩年完成的一系列小鼠試驗中，該研究小組發現感染常見小鼠諾如病毒(murinenorovirus,MNV)可幫助小鼠修復炎癥造成的腸組織損傷，在抗生素治療消滅微生物組后幫助恢復腸道的免疫防御。在發表于

Nature子刊：鐵死亡，細胞死亡的新模式2014/11/20

細胞死亡是一個重要的生命過程，在整個機體的生長和發育中起到了基礎性的作用。鐵死亡（ferroptosis）是一種新發現的細胞死亡模式，在形態學、生物化學和遺傳學等方面與凋亡、壞死和自噬有較大差別。鐵是人體內含量zui高的微量元素，廣泛存在于各個組織和器官中。鐵死亡主要由鐵依賴的氧化損傷引起，涉及一系列復雜的生化反應、基因表達和信號傳導。這種細胞死亡模式與小分子誘導的RAS腫瘤細胞死亡有關，不過人們并不清楚鐵死亡與非癌變的細胞有什么關系。NatureCellBiology雜志十一月十七日發表的一項

清華大學Cell子刊發表CRISPR新文章2014/10/27

來自清華大學、哈佛醫學院和斯坦福大學等機構的研究人員，通過優化sgRNA的參數提高了CRISPR/Cas9系統在果蠅中的特異性和效率。研究結果發布在10月23日的《CellReports》雜志上。清華大學醫學院的倪建泉（Jian-QuanNi）博士和斯坦福大學的JinBillyLi教授是這篇論文的共同通訊作者。倪建泉的主要研究方向包括干細胞增殖與分化機制、細胞信號的調控與協同、細胞信號與表觀遺傳學，以及分子和遺傳工具的研發。在過去的幾年里，人們見證了序列特異性的DNA核酸內切酶技術的驚人發展，其

Nature：身體抵抗有害菌的新方法2014/10/27

對于正在接受治療的癌癥和其他疾病患者來說，細菌感染可引起一些主要問題。在住院期間問題尤為嚴重，因為此時患者的免疫功能往往變弱。更復雜的是，緩解或防止感染的抗生素，可能對生活在體內的健康有益菌（主要在腸道內）產生負面影響。如果微生物群——意指棲居于體內的所有微生物——失去平衡，就會使有害細菌處于支配地位，并產生抗生素耐藥菌株。鑒于此，對于澄清“身體如何對抗病原菌而不消滅良性細菌”的興趣在持續增長。這一理解可能會帶來增強這一自然防御的方法。zui近，美國SloanKettering紀念癌癥中心的研究

復旦生科院院長Nature子刊文章2014/09/27

被子植物（Angiosperms）即開花植物，是世界上zui成功生物群體之一。它們支持著人類的生存和整個生態系統。被子植物的系統發育（phylogeny）是基因功能研究、表型進化研究、分歧時間估算和生物地理學研究的基礎。主要被子植物（Mesangiospermae）大約占現存被子植物的99.95%，盡管文獻中提出了許多假說，但人們還未能明確五類主要被子植物之間的親緣關系。為此，復旦大學生命科學學院的研究團隊進行了深入研究。他們用保守的核基因對被子植物的系統發育進行了深入分析，并估算了它們的分歧時

三篇Science公布表觀遺傳對免疫的影響2014/09/27

發表在Science雜志上的三篇文章解析了表觀遺傳效應，如何影響血細胞發育成為免疫系統中眾多組成元件的分子機制，這些研究均屬于歐盟BLUEPRINT項目內容，分別由來自荷蘭內梅亨大學，麻省理工，Sanger研究院等處的研究人員完成。2011年歐盟委員會衛生研究部門啟動了有史以來規模zui大的投資項目，投資3000萬歐元（約合4100萬美元）進行人類表觀基因組學的研究，希望能找出所有影響基因表達的DNA修飾位點。這個項目就是BLUEPRINT藍圖項目，項目的主要目的是進一步了解表觀遺傳如何影響健康

研究稱肉毒素可遏制胃癌發展2014/08/28

一份研究報告20日指出，注射美容院用于抗皺的肉毒素可阻止胃癌病灶周圍的神經沖動，這或可成為有希望的抗癌療法。從事該研究的蒂莫西·王（音）教授和杜安·陳（音）教授分別來自紐約哥倫比亞大學醫學院和挪威科技大學，他們表示，已在實驗鼠身上進行的試驗zui近證實了對病人的觀察，即“表明神經控制著癌癥干細胞”。王教授解釋說：“阻斷神經信號使得癌細胞變得更脆弱，等于去除了其保持生長的一個關鍵因素。”研究人員指出，肉毒素治療癌癥的效果或可解釋為，它阻礙了乙酰膽堿的生成，而乙酰膽堿是刺激細胞分裂的重要的神經沖動傳