什么是De Novo測序？檢測技術服務詳情介紹

De Novo測序是指在沒有任何已知序列信息或參考數據庫的情況下，通過實驗數據直接推斷出一段生物分子（如DNA、RNA、dànbáizhì）的原始一級結構的技術。它是研究全新物種、新突變體、未知抗體、天然蛋白等生物樣本時的關鍵方法。在dànbáizhì組學領域，De Novo測序是利用高分辨率質譜（MS/MS）對酶解后的多肽片段進行碎片離子分析，通過軟件算法解析離子峰圖譜，從而逐個推斷氨基酸序列，再拼接出完整蛋白序列的過程。與傳統依賴數據庫比對的方法不同，De Novo測序是真正的結構推斷技術，能發現數據庫中不存在的新蛋白、突變形式或翻譯后修飾。

一、De Novo測序與數據庫測序有何不同？

二、De Novo測序的應用價值

De Novo測序不再只是前沿實驗室的探索性技術，而正在成為抗體藥物研發、非模式物種研究、生物信息挖掘和生物制藥質量控制中的剛性需求。

1、抗體結構重建與表達模板設計

抗體是當前zuì重要的治療性蛋白藥物之一，但在實際應用中，科研人員和企業手中常常只有抗體的蛋白樣品，卻無法獲得其原始基因序列或來源細胞。在這種情況下，De Novo測序技術可直接對抗體蛋白進行酶解與質譜分析，還原出重鏈與輕鏈的完整氨基酸序列，特別是CDR區域，進而可用于后續cDNA反向設計、表達系統構建及功能驗證。這項技術正在幫助科研人員復現老抗體、開發生物類似藥、優化親和力突變設計等，顯著提升抗體工程效率。

2、疫苗誘導抗體譜圖分析與臨床免疫研究

在疫苗開發和免疫評估中，研究者越來越關注疫苗誘導產生的多克隆抗體是否具備高親和性和中和能力。傳統BCR測序無法反映抗體翻譯后修飾與真實構象，而De Novo測序可以直接對血清或組織液中的抗體蛋白進行結構解析，捕捉其真實表達形式與修飾狀態，實現抗體克隆譜圖的重建與功能富集。特別是在腫瘤疫苗、HIV、中和抗體研發等領域，這項技術正成為理解免疫反應的關鍵工具。

3、非模式生物和未知物種蛋白解析

在植物、微生物、海洋生物、中藥活性成分等非模式生物研究中，dànbáizhì組數據庫普遍存在缺失或注釋不全的情況。De Novo測序無需參考基因組或已知蛋白序列，適用于新物種、新組織、新狀態下的dànbáizhì表達探索。例如：在研究中藥成分中蛋白類活性物質時，De Novo測序可直接從提取物中識別出生物活性蛋白，從而推進天然藥物開發。

4、生物藥一致性驗證與質量控制

在生物藥生產過程中，不同批次、不同表達系統（如CHO與HEK293）可能會引入微小的結構差異，甚至改變翻譯后修飾模式。De Novo測序能夠實現對表達產物的全長結構還原與比對，不僅能識別顯著突變，還能標注糖基化、氧化、異構體等微觀修飾，有效支持藥品一致性評估、仿制藥開發及申報材料撰寫。

5、癌癥新抗原（Neoantigen）發現與個性化miǎnyìzhìliáo

癌細胞中常常會產生dútè的突變肽段，即“新抗原”。這些Neoantigen是當前癌癥疫苗、T細胞治療的核心靶標。傳統蛋白組分析方式常因序列突變與修飾錯過這些低豐度新肽段，而De Novo測序可以識別數據庫中從未注釋的、僅在病灶表達的新肽段，配合免疫原性預測工具，為個體化治療提供jīngzhǔn標靶。

6、蛋白修飾圖譜構建與結構功能關聯研究

許多蛋白的生物學功能受其翻譯后修飾調控（如糖基化、乙酰化、磷酸化等）。De Novo測序不僅能還原蛋白本體序列，還能在高分辨質譜數據中同步解析修飾類型、修飾位點和修飾占比。這為探索蛋白功能狀態、構象變化、相互作用機制提供了可靠數據支撐，是結構生物學、信號轉導研究等方向的重要工具。

百泰派克生物科技的De Novo測序服務

在百泰派克，我們為抗體研究、蛋白藥研發、疾病機制研究等提供高精度、高覆蓋、高復現性的De Novo測序解決方案。技術特色包括：

* 多酶消化 + 高分辨質譜（Orbitrap Fusion Lumos）

• 自研De Novo拼接算法 + 人工復核機制

• 支持修飾識別、CDR覆蓋、序列建模與表達驗證

• 適用于抗體、融合蛋白、重組酶、突變蛋白等多種類型

無論您是科研人員還是生物醫藥從業者，只需提供抗體或蛋白樣本，我們可在3~4周內為您還原出可重組、可表達、可用于zhuānlì設計的完整結構信息。在信息高度依賴數據庫的jīntiān，De Novo測序代表著另一種能力——不依賴他人、從零開始、解讀未知。它不是替代數據庫方法，而是在面對全新課題、復雜樣本、未知抗體時，zuì可靠、zuì靈活、zuì具探索性的策略。百泰派克生物科技將持續以zhuānyè的實驗平臺與計算能力，幫助更多客戶走出數據庫的“舒適區”，走進蛋白結構的“真實世界”。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

什么是De Novo測序？檢測技術服務詳情介紹