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如何識別一級序列中的C和N末端?檢測技術服務詳情介紹
dànbáizhì的一級序列是由氨基酸按照特定順序通過肽鍵連接而成的線性結構,在這條多肽鏈的兩端,分別存在N端(氨基末端,N-terminal)和C端(羧基末端,C-terminal)。正確識別N端和C端對于dànbáizhì鑒定、功能解析、翻譯后修飾(PTMs)研究以及生物制藥質量控制至關重要。在實驗研究和生物信息學分析中,通常通過化學特性、實驗測序方法以及數據庫搜索等策略來識別dànbáizhì序列的N端和C端。
一、通過化學結構識別N端和C端
在所有dànbáizhì分子中,N端和C端具有不同的化學特性,這使得它們在一級序列中可被明確區分:
1、N-端(N-terminal)
是dànbáizhì序列的起始點,其zuì前端的氨基酸具有一個游離的α-氨基(-NH?),除非經過修飾(如乙酰化)。
2、C-端(C-terminal)
是dànbáizhì序列的終止端,其zuì后一個氨基酸的羧基(-COOH)通常游離,或可能被修飾(如酰胺化)。
二、通過實驗方法識別N端和C端
實驗上,可以利用多種方法來測定和確認dànbáizhì的N-端和C-端。
(1)Edman降解(Edman Degradation):該方法通過異硫氰酸苯酯(PITC)選擇性地標記N-端氨基酸,并通過化學降解逐步切割N-端殘基,逐步解析其序列。Edman降解可直接確認N-端的氨基酸序列,但對乙酰化、甲酰化等修飾的N-端無效。
(2)質譜分析(LC-MS/MS):高分辨率質譜結合特定蛋白酶(如Lys-N)酶解,可檢測到N-端肽段,從而推斷N-端序列及其修飾狀態。
(3)化學標記:Dansyl chloride 或 Dabsyl chloride 可用于N-端特異性標記,隨后進行光譜檢測。
(1)羧肽酶降解(Carboxypeptidase Digestion):使用特定的羧肽酶逐步水解C-端的氨基酸,并通過色譜或質譜檢測釋放的殘基,以推測C-端序列。
(2)質譜分析(LC-MS/MS):利用特定C-端蛋白酶(如Asp-N、Glu-C)進行定向酶切,然后通過LC-MS/MS鑒定C-端肽段,進一步確認C-端的氨基酸序列。
(3)化學標記:利用C-端羧基特異性標記試劑(如Click Chemistry),結合質譜或熒光檢測,實現C-端的jīngzhǔn識別。
三、通過數據庫和生物信息學方法識別N端和C端
在dànbáizhì組學研究中,生物信息學工具和數據庫比對可以幫助識別N-端和C-端:
1、數據庫比對(Database Search)
已知蛋白的一級序列存儲于dànbáizhì數據庫(如UniProt、PDB、NCBI),可以直接比對推測N-端和C-端的氨基酸序列。
2、翻譯起始位點預測
通過基因序列翻譯軟件(如ExPASy Translate)分析mRNA序列,可以推測dànbáizhì的起始氨基酸(通常是jiǎliúānsuān,Met)。
3、C-端信號預測
某些蛋白的C-端具有特征性信號序列,如泛素化位點、跨膜錨定序列等,可通過生物信息學工具(如SignalP、NetPhos)預測C-端功能和修飾。
dànbáizhì的N-端和C-端可以通過其化學特性直接識別,N-端具有游離氨基(-NH?),而C-端具有游離羧基(-COOH)。實驗上,Edman降解和質譜分析是識別N-端的主要方法,而C-端則常通過羧肽酶降解或質譜技術解析。此外,化學標記和生物信息學工具也可用于輔助識別。在dànbáizhì組學研究中,高分辨率質譜結合數據庫搜索已成為zuì常見的N-端和C-duāncèxù方法。未來,隨著新型化學修飾策略和人工智能數據分析的發展,N-端和C-端的識別將更加jīngzhǔn和高效,為dànbáizhì功能解析、疾病研究和生物制藥提供更加可靠的工具。百泰派克生物科技為廣大客戶提供dànbáizhìN/Cduāncèxù服務。我們的“一站式”服務能為您節省時間和精力,幫助您更高效地開展相關研究。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!