通過串聯質譜法進行肽從頭測序檢測技術服務詳情介紹

在dànbáizhì組學研究中，基于數據庫的質譜數據分析（Database Search）已成為主流。然而，隨著科研深入非模式物種、天然產物、抗體工程、新肽藥物等前沿領域，數據庫本身的缺失或不完整，限制了傳統方法的有效性。這時，一種不依賴數據庫、直接從質譜數據中還原肽段氨基酸序列的方法——肽從頭測序（De novo peptide sequencing）顯得尤為關鍵。肽從頭測序的核心在于高質量的串聯質譜（MS/MS）數據采集與解讀。本文將圍繞“如何通過串聯質譜進行肽從頭測序”這一主題，深入探討相關技術原理及應用場景等。

一、什么是肽從頭測序？為什么要用MS/MS？

肽從頭測序（De novo peptide sequencing）指在無數據庫依賴的前提下，通過分析肽段的MS/MS碎裂譜圖，逐個推斷氨基酸組成及其排列順序。這一過程wánquán基于質譜數據中b離子與y離子系列的質量差異。

而實現這一目標的基礎，是高分辨率、高靈敏度的串聯質譜技術（MS/MS）。通過對預先選擇的肽離子進行碎裂并分析其產物離子，可以獲得高度特異性的片段信息，是目前進行從頭測序zuì可靠的實驗方式。

二、串聯質譜法的原理與步驟

1、肽段獲得與離子化

樣本經蛋白酶（如yídànbáiméi、LysC等）酶切后，得到短肽段，進入質譜進行電噴霧離子化（ESI），轉化為帶電粒子。

2、一級質譜篩選（MS1）

MS1用于檢測所有帶電肽段的質量/電荷比（m/z），選擇目標肽段進入下一步碎裂分析。

3、碎裂與二級質譜采集（MS/MS）

目標肽段經碰撞誘導解離（CID）、高能碰撞解離（HCD）或電子轉移解離（ETD）等方式碎裂，產生一系列b離子與y離子。這些碎片離子的m/z構成了“碎裂圖譜”，是肽從頭測序的基礎數據。

4、譜圖解釋與序列重建

利用算法對碎片譜圖進行分析，根據相鄰離子的m/z差值推斷每個氨基酸，逐步構建出完整肽段序列。

三、串聯質譜在肽從頭測序中的優勢

1、高通量：一次進樣即可分析上千個肽段，適合復雜樣品。

2、高特異性：碎裂圖譜具有結構特異性，適用于結構未知的肽段。

3、兼容多種修飾：可識別磷酸化、乙酰化、氧化等翻譯后修飾（PTMs）。

4、支持低豐度分析：借助高靈敏儀器（如Orbitrap、timsTOF Pro），可解析低豐度信號。

四、典型應用場景：從基礎研究到藥物開發

1、單克隆抗體序列測定

許多雜交瘤細胞產生的抗體并無已知序列，從頭測序可用于解析輕鏈與重鏈CDR區域，為抗體人源化、藥物設計提供參考。

2、天然活性肽鑒定

在抗菌肽、神經肽、植物防御肽等研究中，從頭測序有助于發現新型天然多肽藥物候選物。

3、非模式物種研究

對植物、昆蟲、海洋生物等無完整蛋白數據庫的樣本，從頭測序是wéiyī的dànbáizhì序列還原手段。

4、新翻譯肽段發現（sORF）

從頭測序結合轉錄組數據，可發現傳統注釋未涵蓋的短肽編碼區，推動新機制研究。

百泰派克生物科技基于多年的dànbáizhì組平臺建設，已建立高通量、可驗證、面向產業化的肽從頭測序解決方案，具體優勢包括：

（1）gāoduān儀器平臺：配備Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2等zuì新設備，確保高質量MS/MS數據采集；

（2）智能化算法整合：引入DeepNovo、PEAKS與自研深度學習模型，提升識別準確率；

（3）多酶策略與修飾識別：支持定制化多酶方案，適配各類復雜樣本與修飾類型；

（4）驗證支持：可結合合成肽驗證、功能測試等手段確認序列正確性。

肽從頭測序，尤其是基于高分辨串聯質譜法的策略，正成為揭示未知蛋白與功能肽段的關鍵手段。它不僅*數據庫搜索的空白，更在藥物研發、結構生物學、合成生物等領域展現廣闊應用潛力。

百泰派克生物科技將持續投入智能化蛋白組技術平臺建設，為科研客戶與生物醫藥企業提供更jīngzhǔn、高效的從頭測序服務。如您正在尋找zhuānyè的肽從頭測序方案，歡迎隨時聯系我們獲取技術咨詢與定制化解決方案。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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