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蛋白質測序:技術方法和應用檢測技術服務詳情介紹
dànbáizhì是細胞活動的執行者,其功能取決于jīngquè的氨基酸序列。一旦序列發生改變,蛋白的結構、相互作用和生物學功能都可能受到顯著影響。dànbáizhì測序(Protein Sequencing)不僅有助于解析蛋白功能機制,更在疾病研究、抗體開發、新藥靶點篩選等方面發揮著基礎性作用。自20世紀中期以來,dànbáizhì測序技術不斷進化,從Edman降解法走向高通量質譜平臺,覆蓋能力與數據精度顯著提升,正逐漸成為現代dànbáizhì組學研究的核心手段。
一、dànbáizhì測序的主流技術方法
1、Edman降解
Edman降解是一種順序性地從N-末端逐個切割氨基酸的化學測序法,適用于小肽或純化蛋白。反應原理是利用苯異硫氰酸(PITC)選擇性標記并釋放N端氨基酸殘基,然后通過色譜手段進行鑒定。
??技術優點:
高精度
單一序列解析,適合dànbáizhìN端驗證
??主要局限:
不能處理復雜混合樣本
jǐnxiàn于N端分析,無法揭示翻譯后修飾
通量低,已不適合大規模蛋白組研究
盡管在高通量質譜出現后應用大幅減少,Edman降解仍被用于某些N端封閉驗證或重組蛋白鑒定場景中。
2、質譜法
當前dànbáizhì測序主要依賴質譜法(Mass Spectrometry, MS),通過對蛋白樣本進行酶解后,在高分辨質譜平臺上分析其肽段碎片譜圖,推斷出蛋白的一級結構信息。
??常用質譜測序策略:
(1)基于數據庫的測序(Database-dependent sequencing)
這是通過將MS/MS譜圖與已知蛋白數據庫中理論肽段匹配,從而確定蛋白序列的方法。
?流程特點:
高效、自動化程度高
依賴高質量數據庫(如UniProt、NR、Swiss-Prot)
可結合肽段定量(如TMT/iTRAQ)
常用算法工具包括:Mascot、Sequest、MaxQuant、Proteome Discoverer。
(2)De novo測序(無數據庫依賴)
當研究對象缺乏可靠參考數據庫,或希望發現未知突變、變異肽段時,de novo測序成為shǒuxuǎn方法。該方法直接從MS/MS譜圖推斷氨基酸序列,不依賴已有數據庫。當前主流的de novo工具包括:PEAKS、Novor、pNovo、DeepNovo等。
(3)頂端下游整合策略(Top-down vs. Bottom-up)
質譜測序常按分析方式分為:
Bottom-up(自下而上):將蛋白酶解成肽段后進行質譜分析,是目前zuì主流方式。優點是靈敏度高、通量大,適合復雜樣本。
Top-down(自上而下):直接分析完整蛋白分子的質譜行為,可提供更豐富的結構修飾信息,但對儀器分辨率要求更高,適用于結構蛋白、變體蛋白等。
二、dànbáizhì測序的應用場景
1、生物標志物發現
通過比較不同狀態(如健康與疾病、處理組與對照組)樣本中dànbáizhì序列的變化,可識別出疾病相關突變肽段、新抗原、剪接變體等潛在生物標志物。
2、疾病機制研究
dànbáizhì序列的變異或翻譯后修飾是多種疾病發生發展的核心因素。通過dànbáizhì測序可揭示:
激酶調控網絡中的磷酸化位點
組蛋白修飾(乙酰化、甲基化)與基因表達關系
RNA剪接變異引發的結構功能異常
3、抗體測序與生物藥開發
dànbáizhì測序在抗體類生物藥研發中扮演關鍵角色,主要應用于:
抗體序列確認(重鏈/輕鏈識別)
穩定性分析(序列微差識別、點突變檢測)
雜質蛋白檢測(免疫原性控制)
4、非模式生物和新物種研究
對于缺乏基因組信息的非模式生物,質譜結合de novo測序可直接獲取關鍵蛋白序列信息。典型應用包括:
農業生物種質資源篩選
海洋生物功能蛋白發掘
昆蟲、微生物天然產物酶活研究
5、PTM位點識別與功能研究
翻譯后修飾(Post-Translational Modifications)是調控蛋白功能的核心機制。常見修飾包括:
磷酸化(Phosphorylation)
乙酰化(Acetylation)
泛素化(Ubiquitination)
糖基化(Glycosylation)
通過特異富集策略結合質譜測序,研究者可在全蛋白水平上定位修飾位點、定量修飾程度,從而揭示復雜調控網絡。
dànbáizhì測序作為連接基因信息與蛋白功能的橋梁,了解其包含的技術方法和應用領域是bìbùkěshǎo的。百泰派克生物科技致力于打造“從樣本到數據”的一站式蛋白測序解決方案,依托優良儀器平臺與經驗豐富的質譜團隊,為科研與產業客戶提供高質量、可溯源的測序服務,助力每一個生物發現更進一步。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!