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肽序列測定全解析:從原理到應用檢測技術服務詳情介紹
肽序列測定(Peptide Sequencing)基于高分辨質譜(MS)技術,通過對蛋白酶解產物的肽段進行質量分析、碎片解析與生物信息學比對,推導肽段氨基酸序列,從而揭示dànbáizhì(或多肽)中各氨基酸殘基的線性順序,從而解析dànbáizhì的一級結構。肽序列測定不僅可以揭示dànbáizhì的組成與結構,還可定位翻譯后修飾(PTMs)位點,幫助科研人員研究dànbáizhì的功能、相互作用及其在生命活動中的作用,推動蛋白zhìzǔxué、藥物開發、疾病機制研究。故從原理到應用,掌握肽序列測定是蛋白組學研究、生命科學探索與生物醫藥開發中的重要一步。
一、肽序列測定核心原理
1、 蛋白酶解
使用yídànbáiméi、Lys-C、Glu-C等特異性酶將蛋白切割成適合質譜分析的肽段。酶解反應控制溫度、pH、酶量及時間,確保生成理想長度和覆蓋度的肽段。
2、離子化與質譜檢測
肽段通過電噴霧(ESI)或基質輔助激光解吸(MALDI)技術離子化。高分辨質譜(如Orbitrap、FTICR)對肽段分子離子進行質荷比(m/z)檢測,獲得肽段的整體質量信息。
3、母離子選擇與碎片化(MS/MS)
選定特定母離子(前體肽段),在碰撞室中通過碰撞誘導解離(CID)、高能碰撞解離(HCD)或電子轉移解離(ETD)生成b、y離子系列,解析肽段序列信息。
4、數據分析與序列推導
結合數據庫搜索(如Mascot、MaxQuant)或de novo測序算法,解析碎片圖譜,推導肽段氨基酸序列,并定位翻譯后修飾(PTMs)位點。
二、肽序列測定的完整實驗流程
肽測序的實驗步驟主要包括以下八個環節:
1、樣品制備與蛋白提取
(1)使用含緩沖鹽、去垢劑和還原劑的裂解液,結合超聲、機械破碎等方法提取蛋白。
(2)還原(DTT)與烷基化(IAA)處理破壞二硫鍵,確保蛋白wánquán展開。
(3) jīngquè定量(BCA/Bradford/紫外法),控制蛋白濃度。
2、 蛋白酶解
(1) 單酶(Trypsin)或多酶(Trypsin+Lys-C、Glu-C)組合。
(2)反應條件:37°C,pH 7.8–8.0,12–16小時。
3、多肽純化與脫鹽
(1)使用C18固相萃取(SPE)去除鹽離子和雜質。
(2)對復雜樣品采用凝膠切割或SDS-PAGE純化。
4、液相色譜分離(LC)
(1) 采用納流LC(nano-LC)結合C18反相柱,基于疏水性分離肽段。
(2) 梯度優化(流動相水-乙腈+酸),提高分辨率和檢測靈敏度。
5、 離子化與質譜檢測
(1)在線LC-ESI-MS/MS(液相色譜-電噴霧串聯質譜)。
(2) 高分辨質譜(Orbitrap、FTICR)提供亞ppm質量精度。
6、母離子選擇與碎片生成
(1)動態排除與自動增益控制(AGC),確保檢測低豐度肽段。
(2) 碎片模式:CID(適合常規碎片)、HCD(豐富碎片)、ETD(保護修飾信息)。
7、數據采集與序列解析
(1)數據庫搜索:匹配理論碎片譜(質量偏差MS1:±10 ppm,MS2:±0.02 Da)。
(2)de novo測序:直接從碎片譜推導未知序列。
(3)多引擎(Mascot、MaxQuant、Byonic)與AI輔助(如Prosit)提高解析效率。
8、修飾定位與多維驗證
結合保留時間、碎片圖譜、同位素分布,定位磷酸化、糖基化等修飾位點。
三、肽序列測定的應用領域與前沿趨勢
1、應用領域
(1) 蛋白zhìzǔxué研究:系統解析細胞、組織、血漿等樣品蛋白組。
(2)翻譯后修飾研究:定位磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等關鍵修飾位點,揭示功能調控機制。
(3)新抗原發現:在腫瘤miǎnyìzhìliáo、疫苗研發中發現新抗原肽段。
(4)生物標志物開發:篩選疾病相關肽段,用于早篩、診斷和療效預測。
(5)生物制藥質量控制:驗證蛋白藥物純度與批次一致性。
2、前沿趨勢
(1) 單細胞與空間層次肽測序:推動單細胞、組織空間維度蛋白組學研究。
(2) 多技術融合:結合MS/MS、質譜成像(MSI)、原位質譜(DESI-MS),實現全景蛋白組解析。
(3) AI與深度學習輔助:提升復雜樣本中肽段鑒定和修飾定位的精度與效率。
作為蛋白組學和多肽測序領域的lǐngxiān服務商,百泰派克生物科技依托*的高分辨質譜平臺(Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X、MALDI-TOF/TOF)、自主開發的樣品制備和數據分析流程,為全球科研人員和企業客戶提供:從樣品到結果的全鏈路多肽測序解決方案; jīngzhǔn檢測低豐度、多修飾肽段,提升數據質量;AI與多引擎算法(MaxQuant、Byonic、Mascot)提高解析準確率與效率; zhuānyè團隊定制化支持,解決復雜樣本中的多肽測序難題。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白zhìzǔxué
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!