一文看懂多肽組學在癌癥檢測中的潛力
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- 公司名稱 北京百泰派克生物科技有限公司
- 品牌 百泰派克
- 型號
- 產(chǎn)地 中國
- 廠商性質(zhì) 其他
- 更新時間 2025/7/21 12:38:12
- 訪問次數(shù) 16
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業(yè)務范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務,為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務。
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一文看懂多肽組學在癌癥檢測中的潛力檢測技術(shù)服務詳情介紹
多肽組學(peptidomics)作為質(zhì)譜(mass spectrometry)驅(qū)動的生命科學分支,能全面分析體內(nèi)天然存在的短肽或多肽片段。這些片段往往攜帶疾病特異性信息,是癌癥早期診斷和療效監(jiān)測的新興生物標志物來源。本文將從技術(shù)基礎、應用前沿和發(fā)展趨勢三方面系統(tǒng)解析多肽組學在癌癥檢測中的潛力,并軟性植入 百泰派克生物科技 在該領(lǐng)域的優(yōu)勢能力。
一、什么是多肽組學?
1、技術(shù)定位
。多肽組學研究的是未經(jīng)酶切的內(nèi)源短肽(約8–30?aa),與dànbáizhì組學(proteomics)相比,無需yídànbáiméi消化,能直接捕捉生理/病理生成的肽段
2、分離與檢測方法
。多肽組學通常采用液相色譜(LC)或基質(zhì)輔助雷射解吸/電離(MALDI-TOF-MS)進行肽段分離和高分辨質(zhì)譜分析
3、數(shù)據(jù)處理與識別
。利用 MS/MS 數(shù)據(jù)庫對接,配合生物信息學算法(如 DDA/DIA、深度學習),實現(xiàn)多肽序列的定性定量鑒定
二、多肽組學在癌癥檢測中的主要應用
1、早期癌癥篩查
(1)非小細胞肺癌(NSCLC): 血清多肽指紋圖譜有助于區(qū)分早期 NSCLC 與良性病變,以及健康對照。
(2)口腔癌預測: 通過口腔唾液或血清多肽組學發(fā)現(xiàn)與預后相關(guān)的候選多肽。
2、huàliáo療效與耐藥監(jiān)測
肺鱗癌人群: 利用 MALDI-TOF-MS 分析huàliáo敏感組與耐藥組的血清多肽差異,建立療效預測模型。
3、miǎnyìzhìliáo靶點探索
(1)免疫多肽組學(Immunopeptidomics): 分析腫瘤細胞通過 MHC-I/II 遞呈的突變多肽(neoantigens),揭示腫瘤“暗物質(zhì)”,為個性化腫瘤疫苗與 T?細胞療法提供靶點。
(2)生物信息聯(lián)動: 結(jié)合 WES、RNA-seq、in silico MHC 配對和 MS 數(shù)據(jù),jīngzhǔn篩選具免疫原性的突變多肽。
4、抗腫瘤功能肽發(fā)現(xiàn)
。通過噬菌體展示、AI 篩選等策略,從毒液肽、天然生理肽庫中篩選具有腫瘤靶向或細胞毒性的功能多肽
三、優(yōu)勢與挑戰(zhàn)
1、相比傳統(tǒng)生物標志物的優(yōu)勢
(1)高靈敏性:可檢測低豐度肽段,反應早期病理變化。
(2)源于體內(nèi)生成:無需酶切處理,保留了生理狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)和修飾。
(3)標志物通用性強:多肽指紋可適用于不同樣本來源,如血液、唾液、尿液。
2、當前挑戰(zhàn)
(1)樣本處理標準化不足,易影響肽譜穩(wěn)定性和可重復性。
(2)高豐度肽遮蔽低豐度肽信號,需要豐富策略解決。
(3)臨床驗證不夠深入,多數(shù)研究仍處于候選驗證階段,缺少臨床試驗支撐。
(4)免疫肽識別算法仍需改進,MS 數(shù)據(jù)量大,需更準、更快的深度學習模型。
四、多肽組學典型流程
多肽組學的實驗流程需高度jīngzhǔn與標準化,以確保分析結(jié)果的重復性和生物學意義。以下是從樣本采集到生物標志物驗證的標準操作流程:
1、樣本采集與預處理
(1)樣本類型:多肽可來源于多種生物基質(zhì),如血清、血漿、尿液、腦脊液(CSF)、唾液及組織勻漿。
(2)關(guān)鍵考量:避免蛋白降解、肽段失活和預分析變化是核心,例如使用蛋白酶抑制劑、防凍劑,并快速凍存于 ?80?°C。
(3)標準化策略:統(tǒng)一采樣時間點、處理溫度與離心條件,以減少組間變異性。
2、多肽提取與富集
(1)蛋白沉淀去除:使用三lǜyǐsuān(TCA)、乙腈/甲醇沉淀或熱處理快速去除高豐度大分子蛋白,釋放內(nèi)源多肽。
(2)固相萃取(SPE):C18 或強陽離子交換(SCX)柱常用于富集多肽,去除鹽類、小分子干擾物。
(3)高通量策略:自動化 SPE 平臺和磁珠富集技術(shù)提升處理效率并減少批間差異。
3、分離分析
(1)液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS/MS):以納升級 LC(nanoLC)結(jié)合高分辨率質(zhì)譜(如 Orbitrap、TOF)進行肽段分離與檢測。
(2)MALDI-TOF-MS 分析:用于快速指紋分析與初篩,適合大樣本量、多組別研究。
(3)離子遷移譜(IMS)等新興技術(shù):進一步提升肽段結(jié)構(gòu)識別能力,分辨異構(gòu)肽。
4、數(shù)據(jù)采集與定性定量
(1)數(shù)據(jù)采集模式:
DDA(Data-Dependent Acquisition):常用于探索性研究,捕捉信號zuì強的肽段進行 MS/MS。
DIA(Data-Independent Acquisition):全譜段掃描,適合大樣本、穩(wěn)定性分析。
(2)定量方式:
標簽法(TMT/iTRAQ)用于多組比較。
無標記法(Label-Free)適合大規(guī)模隊列,簡化操作。
靶向法(MRM/PRM)用于生物標志物驗證。
5、生物信息學分析
(1)多肽識別:使用數(shù)據(jù)庫搜索引擎(如 Mascot、PEAKS、MaxQuant)結(jié)合深度學習模型輔助序列匹配。
(2)差異分析:結(jié)合統(tǒng)計學方法(如 t 檢驗、ANOVA)和多變量分析(如 PCA、PLS-DA),挖掘具有顯著差異的候選肽段。
(3)功能注釋與通路富集:對差異多肽進行 KEGG/GO 富集分析,揭示其潛在生物學功能。
(4)肽段溯源:將鑒定肽段追溯到上游蛋白及剪切機制,探索病理狀態(tài)下的蛋白水解調(diào)控網(wǎng)絡。
6、生物標志物驗證與臨床轉(zhuǎn)化
(1)靶向定量驗證:通過 MRM/PRM 質(zhì)譜平臺,驗證候選肽在獨立隊列中的表達趨勢。
(2)免疫學方法融合:若開發(fā)抗體成功,可結(jié)合 ELISA、Western Blot 等手段進行臨床可轉(zhuǎn)化驗證。
(3)模型構(gòu)建:通過機器學習(如 SVM、XGBoost)整合多個標志物,建立預測模型并評估其敏感性、特異性(AUC、ROC 分析)。
百泰派克生物科技在“多肽組學+癌癥檢測”領(lǐng)域,具備以下優(yōu)勢:
1、gāoduān質(zhì)譜平臺:采用 Orbitrap Fusion Lumos、Q?EQ96 等高分辨儀器,具備高通量電離能力。
2、zhuānyè技術(shù)團隊:SCI 出版及臨床項目背景團隊,熟練 LC-MS/MS、MALDI 和免疫多肽組學方法。
3、標準化流程與質(zhì)量控制:從采樣、提取、檢測到數(shù)據(jù)管理,均可根據(jù)客戶需求設計并滿足 GLP/GCLP 標準。
4、定制開發(fā)能力強:支持多肽指紋庫構(gòu)建、突變肽篩選與功能性驗證。
5、賦能客戶落地轉(zhuǎn)化:結(jié)合 MRM/PRM/ELISA 平臺,助力體外診斷試劑和臨床驗證的快速推進。
多肽組學是癌癥檢測中的科研前沿,具備高靈敏、結(jié)構(gòu)保真、疾病特異性強的優(yōu)勢,正逐步走向臨床應用。隨著免疫多肽組學與人工智能技術(shù)進步,多肽生物標志物的發(fā)現(xiàn)與驗證將更高效、更jīngzhǔn。百泰派克生物科技憑借*質(zhì)譜平臺和zhuānyè研發(fā)能力,可為客戶提供“一站式”多肽組學服務,助力腫瘤標志物研究與體外診斷開發(fā)。如果您關(guān)注多肽組學在癌癥檢測的落地應用,歡迎聯(lián)系我們,共同探索jīngzhǔn醫(yī)學的未來。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優(yōu)勢:
1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。
三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務優(yōu)勢:
1.技術(shù)*,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;
3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!