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基于iTRAQ的肽組學技術在炎癥研究中的應用檢測技術服務詳情介紹
iTRAQ同位素標記技術,可對樣本中的肽段 N 端與賴氨酸側鏈進行共價標記,通過 4-plex 或 8-plex 多重標記,實現多樣品同時定量。在質譜二級圖譜(MS/MS)中,這些同質異構的標簽裂解產生特征 reporter 離子,可用于jīngquè比較不同處理組的肽豐度。基于 iTRAQ 技術的肽組學在炎癥研究中應用廣泛,涵蓋機制探索、藥物反應監測與生物標志物發現,結合 PRM/ELISA 可實現科研與臨床的有效對接。
一、基于iTRAQ的肽組學技術為何適用于炎癥研究?
1、高通量比較能力:多樣本可在單次 LC-MS/MS 中同時分析,減少實驗偏差;
2、靈敏度與定量重現性高:相比標簽前方法,iTRAQ 可同時兼具定性與半定量能力;
3、對炎癥標志物探測高效:炎癥反應中,細胞因子、補體、炎癥相關酶和受體等成分動態變化顯著,iTRAQ 可捕捉這些低豐度變化。
二、基于iTRAQ的肽組學技術在炎癥研究中的應用
炎癥作為機體對感染、損傷或免疫刺激的高度復雜反應過程,涉及大量可溶性因子(如細胞因子、趨化因子、補體蛋白)、受體和信號轉導通路的動態調控。傳統手段難以全面捕捉這些多維動態變化,而 iTRAQ 技術結合高分辨質譜,為炎癥過程的系統性研究提供了強有力的技術支持。
1、揭示炎癥介質的表達變化
通過對不同處理組肽段進行等摩爾標記,在一次 LC-MS/MS 分析中實現多樣本平行定量,大幅提升了通量和比較效率。在炎癥研究中,該技術可廣泛應用于分析以下炎癥相關因子:基于iTRAQ的肽組學技術
(1)急性期蛋白(如 C-反應蛋白、血清淀粉樣蛋白等):其表達動態變化可被jīngquè量化,用于判斷炎癥程度。
(2)細胞因子調控蛋白:包括IL-1/6調節因子、NF-κB信號調控因子、STAT相關通路蛋白等,可揭示免疫信號轉導異常機制。
(3)細胞凋亡與自噬相關因子:炎癥狀態下細胞命運變化的重要調節蛋白(如 caspase、Beclin-1)也可通過 iTRAQ 分析其豐度變化。
2、炎癥通路富集與網絡建模
通過 iTRAQ 數據結合生物信息學分析,可識別在炎癥狀態下顯著上調或下調的多肽,并進一步進行功能注釋與通路富集(如 KEGG/GO 分析):
(1)識別激活通路:如 TNF-α/NF-κB、JAK/STAT、MAPK、NLRP3 炎癥小體等關鍵炎癥反應通路。
(2)調控模塊重構:通過蛋白互作網絡(PPI)分析構建炎癥調控網絡,挖掘關鍵 hub 蛋白。
(3)靶點預篩:依據表達趨勢與網絡中心度,鎖定潛在治療干預靶點。
3、疾病狀態分型與分期
iTRAQ 肽組學還可用于炎癥性疾病的分型研究,例如:
(1)輕度與重度炎癥對比:通過定量差異分析,找出病程早期與進展期關鍵表達變化分子;
(2)治療響應預測:基于 iTRAQ 數據構建生物標志物組合,預測個體對抗炎藥物、免疫抑制劑等療效;
(3)慢性與急性炎癥鑒別:識別特異分子模式(molecular signature),用于疾病類型分類或分期參考。
4、聯合多組學揭示炎癥網絡
在當前精密醫學趨勢下,iTRAQ 肽組學常與其他組學數據(如轉錄組、代謝組、磷酸化組等)聯合分析:
(1)蛋白–mRNA 協同表達分析:判定蛋白豐度變化是否由轉錄水平驅動,篩選轉錄后調控目標;
(2)蛋白–代謝通路聯動:揭示炎癥狀態下的能量代謝重編程(如乳酸代謝、脂肪酸氧化);
(3)與表觀修飾組協同:結合乙?;?磷酸化組學,闡明炎癥信號傳導蛋白的修飾調控網絡。
5、炎癥標志物發現與轉化應用
通過 iTRAQ 篩選出的差異表達多肽,可進一步通過靶向質譜(如 PRM/MRM)或免疫學手段(如 ELISA)進行驗證,推動以下轉化應用:
(1)炎癥診斷標志物開發:挖掘可用于血液、尿液等樣本中檢測的非侵入性炎癥生物標志物;
(2)個體化治療靶點發現:識別疾病亞群的特異性調控因子,指導靶向治療;
(3)藥效學評價指標建立:作為藥物作用機制確認與療效監測的可靠定量指標。
三、基于iTRAQ的肽組學技術實驗流程詳解
1、樣本處理:提取血清、組織或細胞裂解液。
2、蛋白酶解:使用yídànbáiméi消化,生成可標記肽段。
3、iTRAQ 標記:分別將不同處理組肽段用各通道標簽標記,如 113–118。
4、樣本混合與預分離:混樣后通過 HILIC 或 SCX 分級,減少樣本復雜度。
5、LC-MS/MS 檢測:選用高分辨 Orbitrap 聯盟 MS 進行多輪數據收集。
6、數據分析:利用 Mascot、MaxQuant 等平臺進行賴氨酸肽識別與 reporter 離子峰定量。
7、差異蛋白篩選:選取 fold change ≥1.2 或 ≤0.83,結合 P 值和 FDR 校正。
8、通路富集分析:應用 GO 與 KEGG 注釋解析炎癥相關通路。
9、靶向驗證:使用 PRM 或 ELISA 對關鍵炎癥蛋白進行驗證與二次鑒定。
百泰派克生物科技助力炎癥研究
百泰派克生物科技擁有完善的 iTRAQ 標記與 LC-MS/MS 平臺能力:高通量方案,適應多樣本對比;豐富數據處理與生信分析經驗,提供通路富集與靶點挖掘報告;提供驗證性 PRM/ELISA 服務,支撐臨床轉化;完整 QC 流程,符合 GLP/GCLP 標準,確保臨床級數據質量。
基于iTRAQ的肽組學技術在炎癥研究中應用廣泛,涵蓋機制探索、藥物反應監測與生物標志物發現,結合 PRM/ELISA 可實現科研與臨床的有效對接。百泰派克生物科技憑借成熟平臺和zhuānyè團隊,可為客戶提供 iTRAQ 全流程解決方案,助力精密炎癥分析、標志物開發與診斷轉化。如果您有炎癥相關研究需求,歡迎聯系我們,共同推動炎癥科研與臨床應用創新。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術*,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!