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多肽測序技術解析:挑戰與突破檢測技術服務詳情介紹
一、什么是多肽測序?為何如此關鍵?
多肽是由2~50個氨基酸殘基組成的短鏈蛋白片段,既可能是dànbáizhì降解產物,也可能是功能性信號分子、生物活性藥物,甚至是疫苗抗原表位或TCR肽段。
多肽測序的主要目的包括:
抗體CDR區的氨基酸順序確認
內源性活性肽(如激素、細胞因子)的鑒定
生物制劑降解產物的結構確認
多肽藥物的質量控制與雜質檢測
表位篩選與T細胞識別位點研究
由于多肽結構短小,傳統dànbáizhì測序流程在此面前顯得捉襟見肘,催生了針對多肽特性的專用測序方案。
二、多肽測序的主流技術路線
當前多肽測序技術主要可分為兩大類:基于質譜的序列分析(MS/MS)和化學降解法(如Edman)。
1、LC-MS/MS串聯質譜測序
(1)主要流程包括:
樣本純化 → 去除高背景鹽離子及雜質
離子化(ESI或MALDI)→ 將肽段轉為帶電粒子
一級質譜篩選母離子 → jīngzhǔn挑選目標肽段
二級質譜碎裂(CID/HCD/ETD) → 獲取碎片圖譜
序列分析:通過數據庫搜索或de novo算法重構序列
(2)適用優勢:
快速、高通量、分辨率高
可結合修飾識別和定量分析
2、Edman降解法
Edman降解是zuì經典的化學測序方法,通過循環性剝離N端氨基酸殘基并逐一鑒定,獲取序列。
(1)適用優勢:
jīngquè度高,適用于純多肽樣品
對短肽段(<30 aa)解析能力較強
(2)限制:
不適用于N端封閉或修飾肽
通量低,難以自動化
隨著質譜靈敏度與生信算法的進步,現代多肽測序更偏向質譜+AI輔助序列重構的方向發展。
三、多肽測序中的關鍵挑戰
盡管技術手段日益成熟,但在實際應用中,多肽測序仍面臨多個技術瓶頸:
1、修飾種類復雜,影響碎裂模式
天然或合成多肽中常見多種翻譯后修飾(PTMs),如磷酸化、羥púānsuān、N端乙?;?,這些修飾可能影響質譜碎裂效率,干擾序列推斷。
2、同分異構肽難以區分
多肽中存在大量同分異構體(如Leu/Ile,Gln/Lys)無法通過質譜直接區分,需要額外的化學驗證或AI輔助建模。
3、信號弱、背景高
多肽相較于完整蛋白更易丟失信號,尤其在復雜背景樣本中(如血漿、細胞裂解液),測序難度大幅上升。
4、N端修飾與封閉問題
某些生物樣本中的多肽具有阻斷性修飾,導致N端Edman降解失效,也會影響數據庫匹配算法的有效性。
四、技術突破與前沿發展
為應對上述挑戰,科研界與產業界已在多個維度取得重要進展:
1、高分辨率質譜系統的應用
如Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2 等gāoduān平臺可提供更高質量的MS/MS譜圖,提升異構體區分能力與低豐度信號檢測率。
2、多酶酶切與分段合成策略
通過使用多種特異性酶(如Trypsin + Glu-C + Chymotrypsin)對肽段進行補充切割,擴大測序窗口,提升序列覆蓋率。
3、AI賦能的de novo序列重建算法
深度學習模型(如DeepNovo、PointNovo、pNovo+)能夠根據碎片模式重建氨基酸順序,尤其適用于數據庫外序列或高度修飾肽段。
4、聯合結構建模與修飾預測
結合AlphaFold結構預測與修飾位點數據庫(如Unimod、dbPTM)輔助識別關鍵功能肽段并進行結構確認,提升生物學解釋力。
五、百泰派克生物科技的多肽測序解決方案
在實際科研和項目開發中,多肽測序不僅要求技術精度,更需要從樣本制備到數據解讀的整體方案設計。百泰派克生物科技構建了一套針對不同應用場景的多肽測序服務平臺,具備以下核心優勢:
1、高靈敏度平臺:搭載Orbitrap Eclipse、timsTOF等高分辨率質譜系統
2、多重酶切策略:根據肽段特性定制酶解方案,zuì大化覆蓋率
3、AI輔助分析引擎:結合數據庫比對與de novo預測,準確識別未知肽段
4、修飾位點識別能力強:支持磷酸化、乙?;?、糖基化等常見PTM識別
5、可視化報告交付:提供序列圖譜、修飾注釋、結構預測等直觀結果
隨著質譜儀器的性能升級和AI算法的不斷成熟,多肽測序正在從“序列獲取”向“功能解讀”躍遷。未來的多肽測序不僅要“測得準”,更要“懂得多”——包括功能區域、修飾模式、結構信息和生物活性。而生物信息學平臺與實驗平臺的深度融合,也將進一步推動多肽測序在藥物發現、免疫療法、分子機制研究中的價值釋放。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!