AI在蛋白質(zhì)測(cè)序中的最新應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在生命科學(xué)進(jìn)入AI驅(qū)動(dòng)時(shí)代的jīntiān，人工智能（AI）正在重塑dànbáizhì測(cè)序的技術(shù)版圖。從結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)到de novo測(cè)序、從修飾位點(diǎn)識(shí)別到序列重構(gòu)，AI正逐步滲透到dànbáizhì分析的各個(gè)層面，提升效率、降低錯(cuò)誤率，并助力科研人員應(yīng)對(duì)大規(guī)模復(fù)雜樣本帶來的挑戰(zhàn)。本文將帶你系統(tǒng)了解AI在dànbáizhì測(cè)序中的zuì新應(yīng)用方向、技術(shù)原理與主流算法，實(shí)現(xiàn)更高質(zhì)量的蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)交付。

一、AI正在改寫的dànbáizhì測(cè)序三大核心環(huán)節(jié)

在傳統(tǒng)dànbáizhì測(cè)序流程中，主要挑戰(zhàn)集中在以下三個(gè)環(huán)節(jié)，而AI技術(shù)的引入正好在這些關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)發(fā)揮出巨大優(yōu)勢(shì)：

1、De novo序列預(yù)測(cè)

基于質(zhì)譜的dànbáizhì測(cè)序高度依賴數(shù)據(jù)庫(kù)檢索，而AI模型的引入，特別是深度學(xué)習(xí)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，使得無需參考數(shù)據(jù)庫(kù)即可進(jìn)行高置信度de novo預(yù)測(cè)成為可能。

（1）代表算法：

• DeepNovo：基于LSTM模型的de novo肽段預(yù)測(cè)工具，可自動(dòng)學(xué)習(xí)碎裂離子的組合模式。

• PointNovo：利用transformer架構(gòu)提升預(yù)測(cè)精度，在高復(fù)雜背景中仍能保持>80%的氨基酸準(zhǔn)確率。

（2）應(yīng)用價(jià)值：

• 用于未知物種、新蛋白、抗體輕重鏈的序列解析

• 彌補(bǔ)傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)無法涵蓋全部變異的不足

2、翻譯后修飾（PTM）識(shí)別與預(yù)測(cè)

AI模型可訓(xùn)練質(zhì)譜碎片圖譜與特定修飾之間的關(guān)聯(lián)，從而提高修飾位點(diǎn)的識(shí)別準(zhǔn)確度，尤其在多種修飾共存或信號(hào)弱的樣本中表現(xiàn)尤為突出。

（1）代表算法：

• pDeep/PTM-Shepherd：利用CNN模型識(shí)別磷酸化、乙酰化、糖基化等修飾特征圖譜；

• DeepPhospho：可直接預(yù)測(cè)磷酸化位點(diǎn)并輸出保守性評(píng)分。

（2）應(yīng)用價(jià)值：

• 在抗體藥、信號(hào)通路研究中jīngzhǔn解析修飾位點(diǎn)

• 縮短修飾鑒定時(shí)間，提高自動(dòng)化程度

3、dànbáizhì序列重構(gòu)與功能注釋

AI不僅能預(yù)測(cè)氨基酸排列，還能輔助構(gòu)建dànbáizhì全長(zhǎng)序列，并在結(jié)構(gòu)層面進(jìn)行功能推斷，特別適用于蛋白異構(gòu)體識(shí)別、單體聚合物追蹤等復(fù)雜任務(wù)。

（1）代表算法：

• AlphaPept：自動(dòng)化質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理平臺(tái)，集成序列識(shí)別、定量與注釋

• Prosit：利用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)肽段碎裂圖譜，提高鑒定準(zhǔn)確率和定量一致性

（2）應(yīng)用價(jià)值：

• jīngzhǔn識(shí)別抗體CDR區(qū)、蛋白突變位點(diǎn)

• 加速蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)自動(dòng)注釋流程

二、AI在蛋白測(cè)序中的核心優(yōu)勢(shì)

AI不僅提升了分析性能，更重要的是推動(dòng)dànbáizhì組學(xué)邁向智能化、高通量、自動(dòng)化的未來。

三、AI + 質(zhì)譜平臺(tái)：百泰派克的智能dànbáizhì測(cè)序?qū)嵺`

作為優(yōu)質(zhì)的dànbáizhì組學(xué)服務(wù)商，百泰派克生物科技前瞻性地將AI技術(shù)融入蛋白測(cè)序全流程，打造出更高置信度、更快交付速度的智能化測(cè)序平臺(tái)，廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)科研、抗體藥物開發(fā)、疫苗研發(fā)及生物標(biāo)志物挖掘等項(xiàng)目中。我們的AI賦能策略包括：

1、自研AI數(shù)據(jù)分析管線：基于Prosit、DeepNovo和AlphaPept算法優(yōu)化碎裂圖譜解讀與肽段重建流程；

2、多模型集成判斷機(jī)制：融合傳統(tǒng)打分機(jī)制與AI預(yù)測(cè)評(píng)分，提高鑒定置信度，尤其適用于低豐度蛋白或異構(gòu)體；

3、抗體測(cè)序?qū)Ｓ肁I模塊：專為CDR區(qū)識(shí)別與輕重鏈配對(duì)開發(fā)的模型，適配雜交瘤與人源化抗體；

4、全流程自動(dòng)化系統(tǒng)對(duì)接：從原始RAW文件上傳到報(bào)告生成全程智能監(jiān)控，節(jié)省>60%分析時(shí)間。

AI在dànbáizhì測(cè)序領(lǐng)域的發(fā)展才剛剛開始，未來將呈現(xiàn)以下幾大趨勢(shì)：

1、端到端dànbáizhì結(jié)構(gòu)解析：AlphaFold等工具的推廣將與質(zhì)譜數(shù)據(jù)深度融合，實(shí)現(xiàn)從序列到三維結(jié)構(gòu)的自動(dòng)建模。

2、跨組學(xué)智能整合：AI將成為蛋白組+轉(zhuǎn)錄組+代謝組等多組學(xué)數(shù)據(jù)融合的核心引擎，推動(dòng)系統(tǒng)生物學(xué)研究。

3、單細(xì)胞dànbáizhì測(cè)序突破：隨著AI算法優(yōu)化與信號(hào)放大技術(shù)進(jìn)步，單細(xì)胞水平蛋白組分析將成為現(xiàn)實(shí)。

4、個(gè)性化藥物開發(fā)提速：基于患者特異蛋白圖譜的AI分析，將助力靶點(diǎn)篩選、免疫原性預(yù)測(cè)和新藥設(shè)計(jì)。

AI并非要替代傳統(tǒng)質(zhì)譜分析方法，而是在保留實(shí)驗(yàn)科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)性的基礎(chǔ)上，提升數(shù)據(jù)的可解釋性、處理速度與分析深度。對(duì)于科研人員而言，AI的價(jià)值在于更快、更準(zhǔn)、更系統(tǒng)地還原dànbáizhì的真實(shí)世界。在百泰派克生物科技，我們不僅掌握前沿dànbáizhì測(cè)序技術(shù)，更致力于將AI能力切實(shí)落地，為客戶提供可信賴的科研支持。如果你正計(jì)劃開展dànbáizhì序列測(cè)定、修飾識(shí)別或抗體序列確認(rèn)項(xiàng)目，歡迎聯(lián)系我們開啟AI賦能的jīngzhǔn測(cè)序之旅。

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百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

AI在蛋白質(zhì)測(cè)序中的最新應(yīng)用檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹