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氨基酸序列分析:技術與挑戰檢測技術服務詳情介紹
氨基酸序列是dànbáizhì功能的基石,亦是理解生物體調控機制、疾病發展與分子藥物作用的關鍵入口。隨著蛋白組學的迅速發展,氨基酸序列分析已經從傳統化學測定拓展至高通量、可修飾、多維度的數據整合階段,成為連接基因組與表型功能的重要橋梁。本文將探討當前主流的氨基酸序列分析技術路徑、常見挑戰。
一、氨基酸序列分析的核心技術
1、串聯質譜(LC-MS/MS)
當前zuì常用的氨基酸序列分析方法是基于LC-MS/MS的質譜測序技術。該方法以以下幾個步驟為核心:
(1)酶解處理:將目標蛋白用yídànbáiméi等特異性酶切為多肽段。
(2)液相色譜分離:對復雜肽段進行高效液相色譜分離,提升分辨率。
(3)一級質譜(MS1):檢測母離子的m/z,初步篩選多肽段。
(4)二級質譜(MS2):通過碰撞誘導解離形成b、y離子系列,根據碎片差值推斷氨基酸序列。
(5)數據庫比對與序列識別:借助MaxQuant、PEAKS、Byonic等平臺還原肽段序列并映射到蛋白數據庫。
2、De novo測序
在無數據庫參考或未知蛋白研究中,使用de novo算法可根據碎裂譜圖直接重建氨基酸順序,適用于新物種研究或抗體可變區解析。
3、Edman降解
通過逐步化學切除N端氨基酸并進行鑒定,可獲得短肽的序列信息。盡管該方法準確性高,但已因通量與適應性限制逐漸被質譜法取代。
二、氨基酸序列分析中面臨的挑戰
1、蛋白復雜性
dànbáizhì經過剪接變異、翻譯后修飾(PTMs)后,形成多種異構體,顯著增加序列解析的復雜性。
2、修飾位點不確定性
如磷酸化、乙酰化、甲基化等PTMs常導致質量偏移或碎裂路徑變化,對修飾定位精度提出挑戰。
3、樣本處理差異
蛋白的提取、酶解、純化等步驟若控制不當,可能造成測序效率低、背景干擾高、序列中斷等問題。
4、數據分析壓力
面對大量碎片譜圖,如何高效、準確進行數據庫匹配與人工干預驗證,是影響序列還原質量的關鍵因素。
三、百泰派克的氨基酸序列分析平臺
為應對上述挑戰,百泰派克生物科技構建了一體化蛋白序列解析平臺,具備以下特色能力:
高精度質譜平臺(Orbitrap Exploris、Fusion Lumos)支持完整蛋白肽段的測序與修飾識別
標準化樣本預處理流程(還原、烷基化、自動化酶解)保障樣本質量
多策略數據分析管線(數據庫匹配 + de novo并行)提升序列還原率
支持序列比對、突變檢測、PTM標注與可視化展示
跨平臺聯動:支持蛋白測序、功能組學、抗體驗證等多場景應用
氨基酸序列分析不僅是對dànbáizhì本體的理解,更是揭示其功能狀態、疾病機制與藥物作用的核心前提。在質譜平臺不斷升級與算法能力持續拓展的背景下,jīngzhǔn、高通量、可修飾識別的氨基酸序列解析將成為未來dànbáizhì研究的常規需求。百泰派克生物科技將持續提供前沿平臺與zhuānyè服務,賦能生命科學研究與生物技術創新。如您有蛋白測序、抗體驗證、修飾分析等需求,歡迎聯系我們獲取定制方案。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!