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SILAC質譜檢測技術服務詳情介紹
SILAC質譜技術是一種基于質譜的高通量定量分析方法,通過使用穩定同位素標記氨基酸,能夠jīngquè地對比不同樣品中dànbáizhì的表達差異。隨著質譜技術的發展,SILAC質譜已成為蛋白zhìzǔxué研究中的一種核心技術,廣泛應用于癌癥研究、藥物篩選、細胞信號通路分析、疾病機制研究等多個領域。通過該技術,研究人員不僅能夠定量分析不同樣品中dànbáizhì的豐度變化,還能夠了解在不同生物條件下細胞內dànbáizhì的動態變化和相互作用,揭示生命活動背后的分子機制。這項技術的核心思想是通過在細胞培養過程中,使用含有穩定同位素的氨基酸(如氮-15或碳-13標記的氨基酸)替代普通氨基酸,使得細胞中合成的dànbáizhì在質譜分析中具有不同的質量。這些標記的氨基酸不會影響dànbáizhì的功能和結構,因此能夠無偏地反映生物體內的真實情況;隨后,采用質譜儀對標記的dànbáizhì進行分析,基于同位素的質量差異進行jīngquè定量,進而對不同樣品中dànbáizhì的表達差異進行比較。SILAC質譜憑借其高靈敏度、高準確性以及無標記物干擾等優勢已經成為dànbáizhì定量分析中的重要工具,通過jīngzhǔn的定量分析,SILAC技術幫助科研人員揭示dànbáizhì的動態變化,深入理解生物機制。
一、SILAC質譜技術的原理
SILAC質譜技術的基本原理是通過在細胞培養過程中,分別使用不同的穩定同位素標記氨基酸進行標記,常見的標記氨基酸包括賴氨酸(Lys)和jīngānsuān(Arg)。在實驗設計中,研究人員會將目標細胞分別培養在含有標記氨基酸和普通氨基酸的培養基中,這樣在細胞合成dànbáizhì時,含有標記氨基酸的dànbáizhì會與未標記的dànbáizhì在質量上有所區別。這些含有穩定同位素標記的dànbáizhì和未標記的dànbáizhì在質譜分析時表現出不同的質荷比(m/z),使得它們能夠在同一實驗中被同時檢測和定量。
在SILAC實驗中,通常會使用兩種或三種不同的標記組分進行實驗對比。例如,在一種實驗中,細胞被培養在普通培養基中,合成的dànbáizhì未經過標記;在另一個實驗中,細胞則被培養在含有標記氨基酸的培養基中,合成的dànbáizhì帶有穩定同位素標簽。通過質譜分析,不同樣品中相同的肽段會因為標記氨基酸的存在而在質譜圖上形成具有不同質荷比的兩個峰,研究人員通過對比這兩個峰的強度來定量不同樣品中該dànbáizhì的表達差異。
二、SILAC質譜的關鍵步驟
SILAC質譜技術通常包括以下幾個關鍵步驟:
1、細胞培養與標記
首先,將目標細胞分別培養在含有穩定同位素標記氨基酸和普通氨基酸的培養基中,常見的標記氨基酸有氮-15(15N)標記的賴氨酸和jīngānsuān,或碳-13(13C)標記的氨基酸。這些氨基酸將被細胞用來合成dànbáizhì,確保所有新合成的dànbáizhì都包含標記的氨基酸。
2、dànbáizhì提取與消化
在細胞培養后,收集并提取細胞中的總dànbáizhì。dànbáizhì提取后,通常通過yídànbáiméi或其他酶類對dànbáizhì進行酶解,切割成肽段。由于不同肽段的分子量不同,它們在質譜分析中會表現出不同的質荷比,因此能夠根據這些信息定量每種肽段的豐度。
3、肽段分離
使用高效液相色譜(HPLC)或其他分離技術對酶解后的肽段進行分離,這一過程可以有效減少樣品中的復雜性并為后續的質譜分析提供更高的解析度。
4、質譜分析
通過質譜儀(如LC-MS/MS)對分離得到的肽段進行分析。質譜儀可以準確測量不同肽段的質荷比(m/z)并通過串聯質譜(MS/MS)進一步分析肽段的氨基酸序列。通過比較不同樣品中肽段的信號強度,研究人員可以定量分析不同樣本中dànbáizhì的表達差異。
5、數據分析與定量
質譜數據通常需要使用專門的軟件(如MaxQuant、Mascot等)進行分析,比較標記組和對照組中相同dànbáizhì肽段的信號強度,進而推算出dànbáizhì在不同樣品中的相對豐度。數據分析不僅可以幫助識別差異蛋白,還可以揭示dànbáizhì在不同生物條件下的動態變化。
三、SILAC質譜的優勢
1、高準確性和高靈敏度
SILAC質譜技術可以高精度地定量dànbáizhì的表達差異,即使是在復雜的生物樣品中也能夠準確區分不同樣品中dànbáizhì的豐度變化。
2、無需外源性標記物
與傳統的dànbáizhì定量方法不同,SILAC技術使用的穩定同位素標記氨基酸是天然的氨基酸衍生物,因此不會對細胞的生物學功能造成干擾,這使得SILAC技術在活細胞環境中非常適用。
3、高通量分析
通過SILAC質譜,研究人員可以在一個實驗中同時分析多個樣品,進行高通量的dànbáizhì定量。它能夠同時識別和定量數千個dànbáizhì,極大地提高了實驗效率。
4、動態分析
SILAC技術能夠用于研究dànbáizhì在不同生物學狀態下的動態變化,如細胞周期、藥物處理、疾病狀態等;這使得SILAC技術不僅適用于靜態的dànbáizhì定量,也適合于動態監測dànbáizhì的調控。
四、SILAC質譜的應用
1、癌癥研究
在癌癥研究中,SILAC質譜可以幫助研究人員比較癌細胞與正常細胞之間dànbáizhì表達的差異,識別可能的癌癥標志物或治療靶點。通過對腫瘤微環境中dànbáizhì變化的分析,SILAC技術有助于揭示癌癥的發生機制及其發展的分子路徑。
2、藥物篩選與靶點發現
SILAC技術在藥物篩選中發揮著重要作用。通過比較藥物處理前后細胞中dànbáizhì的表達變化,研究人員可以識別藥物的作用靶點并了解其作用機制;此外它還能用于藥物效果的定量評估,推動新藥開發。
3、細胞信號通路分析
SILAC技術能夠定量分析細胞內dànbáizhì的動態變化,揭示細胞信號通路的激活狀態。在研究細胞如何響應外部信號(如生長因子、激素等)的過程中,SILAC技術提供了寶貴的定量數據,幫助科學家深入理解細胞內的調控機制。
4、疾病機制研究
SILAC質譜可用于比較健康組織和病變組織中dànbáizhì的表達差異,幫助識別與特定疾病相關的差異dànbáizhì;例如在神經退行性疾病、免疫疾病等研究中,它有助于發現潛在的疾病生物標志物,為早期診斷和治療提供依據。
百泰派克生物科技采用guójìxiānjìn的SILAC質譜分析技術,結合豐富的項目經驗和jīngzhàn的技術支持,為您的研究提供從實驗設計、數據分析到結果解讀的quánfāngwèi服務。我們的服務不僅具備高靈敏度和高準確性,還能有效應對復雜的樣品分析需求,確保為您的研究提供可靠、全面的支持。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白zhìzǔxué
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!