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如何用ABPP實現(xiàn)酶活性定量分析?

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百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務(wù)。

l 公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

l 獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

l 業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

l 7大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

l 服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

l 致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!






業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務(wù)。

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如何用ABPP實現(xiàn)酶活性定量分析?檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在生物學(xué)研究中,我們常通過蛋白組學(xué)測定酶的表達水平來判斷其功能狀態(tài)。然而,酶的表達豐度≠活性狀態(tài)。酶可能以失活形式存在,受到抑制劑調(diào)控,或通過翻譯后修飾調(diào)節(jié)其功能。因此,“酶活性”才是反映其真實功能狀態(tài)的關(guān)鍵指標(biāo)。ABPP(Activity-Based Protein Profiling,基于活性的dànbáizhì剖析)是一種利用化學(xué)探針選擇性地標(biāo)記活性酶的方法,提供了一種特異性強、功能相關(guān)性高的酶活性定量手段,用于檢測和定量分析復(fù)雜樣本中酶的活性狀態(tài),而不僅僅是表達水平,尤其適用于腫瘤代謝、免疫調(diào)控、藥物靶點發(fā)現(xiàn)等研究場景。因此,用ABPP實現(xiàn)酶活性定量分析成為功能蛋白組學(xué)研究的核心需求。


一、ABPP技術(shù)原理簡述:活性探針的“jīngzhǔn打擊”

ABPP依賴于一種叫做“活性位點探針(Activity-Based Probes, ABPs)”的分子。這些探針通常具備三大核心結(jié)構(gòu):

1、反應(yīng)基團(warhead):能與靶酶活性位點(如sīānsuān、半guāngānsuān等)形成共價鍵

2、識別基團:賦予探針酶類選擇性(如磷酸酶、蛋白酶等)

3、報告基團:用于后續(xù)的熒光檢測或富集標(biāo)記(如shēngwùsù、疊氮基等)

只有活性的酶才能與探針發(fā)生反應(yīng),實現(xiàn)從全蛋白中選擇性標(biāo)記“功能性蛋白”


二、ABPP定量酶活性分析流程

1、樣本處理與探針標(biāo)記

將活細(xì)胞裂解液或組織樣本與ABPP探針共孵育,使探針特異性標(biāo)記活性酶。與傳統(tǒng)蛋白組不同,這一步強調(diào)生理條件下酶活性的原位捕獲。


2、富集與蛋白消化

使用探針自帶的標(biāo)簽(如biotin)富集已標(biāo)記酶,隨后通過yídànbáiméi消化為肽段,進入質(zhì)譜分析階段。


3、LC-MS/MS分析與定量

質(zhì)譜儀(如Orbitrap Fusion或Q Exactive系列)用于檢測活性酶的特異肽段,并通過“biāojìdìng量(如TMT)或標(biāo)簽自由定量(Label-free)”方法實現(xiàn)各組間比較。


4、數(shù)據(jù)解析

結(jié)合生物信息學(xué)工具,可繪制出差異酶活性熱圖、KEGG通路富集、靶酶功能注釋等。


三、ABPP定量分析的優(yōu)勢與局限

1、優(yōu)勢亮點

(1)專注功能蛋白組:只檢測“功能狀態(tài)”而非“總表達”

(2)動態(tài)響應(yīng)監(jiān)測:適合藥物處理、應(yīng)激反應(yīng)等時序研究

(3)與質(zhì)譜深度整合:高通量、可拓展性強

(4)可結(jié)合化學(xué)遺傳學(xué)策略:用于驗證酶類靶點的特異性抑制


2、局限挑戰(zhàn)

(1)探針開發(fā)門檻高:需針對不同酶系設(shè)計特異性強的ABPs

(2)難以覆蓋非共價活性機制:如部分金屬酶

(3)可能存在非特異標(biāo)記背景:需要嚴(yán)格對照組設(shè)計與數(shù)據(jù)過濾


四、應(yīng)用場景舉例:ABPP助力多領(lǐng)域jīngzhǔn研究

1、藥物靶點篩選

通過ABPP技術(shù)可捕捉藥物處理前后酶活性的動態(tài)變化,jīngzhǔn定位潛在靶點或脫靶效應(yīng)。例如,利用半guāngānsuān反應(yīng)探針分析新型癌癥治療靶點。


2、疾病標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)

與傳統(tǒng)dànbáizhì組相比,ABPP篩選出的差異酶活性具有更強的功能相關(guān)性,有望用于疾病早期診斷。


3、微生物功能研究

ABPP技術(shù)能用于微生物菌群中活性蛋白的定量捕捉,助力環(huán)境代謝通路分析、抗生素作用機制等研究。


在百泰派克生物科技,我們提供從探針篩選、樣本處理、質(zhì)譜檢測到數(shù)據(jù)解讀的一站式ABPP服務(wù),核心優(yōu)勢包括:高通量Orbitrap平臺支持TMT/Label-free定量;定制化探針庫適配不同酶類(sīānsuān酶、金屬酶等);生信團隊深度參與數(shù)據(jù)功能挖掘與通路注釋;適配多種樣本類型:細(xì)胞、動物組織、人源臨床樣本。想進一步了解ABPP質(zhì)譜定量分析?歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技,我們將為您的研究提供高質(zhì)量、定制化的技術(shù)支持。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上先進的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白zhìzǔxué分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)先進,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

如何用ABPP實現(xiàn)酶活性定量分析?




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



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