基于質譜的蛋白質測序：原理與優勢檢測技術服務詳情介紹

在jīngzhǔn醫學、生物制藥、基礎研究不斷深化的當下，獲取高質量的dànbáizhì序列信息已成為生命科學研究bùkěhuòquē的一環。dànbáizhì作為生物體功能執行的直接承擔者，其一級結構（氨基酸序列）是理解蛋白功能、研究疾病機制、開發靶向藥物的基礎。隨著質譜技術的飛躍式發展，基于質譜的dànbáizhì測序（Mass Spectrometry-based Protein Sequencing）已逐步成為研究人員解析蛋白序列的核心工具。

一、dànbáizhì測序的演進與挑戰

早期的dànbáizhì測序主要依賴Edman降解法，該方法通過順序地切除N端氨基酸并加以識別來確定蛋白序列，雖然準確性高，但適用于較短、多肽純度高的樣本，不適合高通量分析。隨著組學時代的到來，dànbáizhì樣本復雜性迅速提升，需要更高效、自動化的技術平臺加以應對。質譜技術的興起改變了dànbáizhì測序的格局。通過將蛋白樣品轉化為帶電離子的方式，質譜能夠提供肽段或蛋白的分子質量（mass）和結構信息（fragmentation pattern），配合高精度的數據分析算法，可以重構蛋白的氨基酸序列，并識別翻譯后修飾、序列變異等關鍵信息。

二、基于質譜的dànbáizhì測序原理

質譜dànbáizhì測序過程通常包括以下關鍵步驟：

1、蛋白樣品預處理與酶切

dànbáizhì樣品首先需要經歷標準化的預處理流程，包括變性（打破空間結構）、還原（切斷二硫鍵）、烷基化（防止重組）、以及酶切。zuì常使用的酶為yídànbáiméi（Trypsin），其可在賴氨酸（K）或jīngānsuān（R）殘基后切割蛋白，得到一系列適宜質譜分析的肽段。

2、液相色譜-質譜聯用（LC-MS/MS）分析

經過酶解的肽段通過高效液相色譜（HPLC）分離后，依次進入質譜儀進行檢測。電噴霧電離（ESI）將液相中的肽段轉化為帶電離子，這些離子隨后被導入質譜儀的質量分析器中檢測其質量-電荷比（m/z）。在串聯質譜（MS/MS）模式下，一級質譜（MS1）用于檢測所有肽段的jīngquè質量信息，隨后選擇特定離子進行碎裂（通常通過碰撞誘導解離CID或高能碰撞HCD），形成一組具有代表性的二級碎片離子（b離子與y離子系列），用于重建肽段的氨基酸序列。

3、數據解析與序列識別

獲取的MS/MS譜圖可通過兩種主要策略解析：

• 數據庫匹配（Database Search）：通過比對質譜數據與已知蛋白數據庫（如UniProt、Swiss-Prot），確定匹配的dànbáizhì與肽段。

• de novo測序：對于未知蛋白或數據庫缺失的樣本，通過算法直接從MS/MS譜圖中推導出肽段序列，無需依賴已有數據庫，特別適用于抗體測序、新物種研究或突變蛋白識別。

三、基于質譜的dànbáizhì測序的核心優勢

1、高通量、快速、自動化

質譜平臺可在單次實驗中分析上千種肽段，實現大規模dànbáizhì序列的快速獲取，適用于大規模項目如dànbáizhì組定性、抗體譜分析、功能蛋白篩選等。質譜無需逐位識別，極大縮短實驗周期。

2、高靈敏度，支持低豐度蛋白檢測

現代高分辨率質譜儀（如Orbitrap、Q-TOF）具備jígāo的靈敏度和動態范圍，可識別生物樣本中低豐度、微量蛋白，尤其在信號通路研究、疾病標志物發現等領域具有明顯優勢。

3、能解析翻譯后修飾（PTMs）

質譜不僅能提供dànbáizhì的氨基酸序列，還可識別并定位多種翻譯后修飾，如磷酸化、乙?；⒓谆?、糖基化等。這些修飾在調控蛋白功能、細胞信號轉導、表觀遺傳調控等方面具有重要生物學意義。

4、應對復雜樣本的能力強

質譜可處理各類復雜生物樣本，如全細胞裂解物、組織勻漿、血漿等，結合前端富集、分離策略（如強陽離子交換、離子遷移譜IMS、納升液相色譜等）可極大提升信噪比和檢測通量，適用于復雜背景下的高質量蛋白序列獲取。

四、技術發展趨勢與未來方向

當前，質譜dànbáizhì測序的研究焦點正從單純的序列解析向更高覆蓋率、更深度修飾識別、更高自動化水平轉變。包括以下幾個方向：

• 單細胞dànbáizhì測序：結合微流控和超靈敏MS平臺，正在突破分析靈敏度瓶頸；

• AI輔助譜圖解析：新一代算法（如AlphaPept、Prosit）正推動譜圖自動解讀向更高準確率發展；

• 原位測序與空間蛋白組學：結合成像質譜，實現蛋白序列與空間信息的協同獲??；

• 跨平臺多組學融合：將質譜dànbáizhì測序與轉錄組、代謝組等整合，構建更全面的生命過程圖譜。

基于質譜的dànbáizhì測序以其高通量、jīngzhǔn度高、可識別修飾等顯著優勢廣泛應用于基礎研究、疾病機制解析、生物藥開發、抗體工程、功能蛋白篩選等多個領域。隨著儀器硬件與算法軟件的不斷升級，質譜測序的邊界還在不斷被拓展。百泰派克生物科技將持續關注并推動蛋白測序技術的創新與轉化，助力科研人員更高效、更深入地探索蛋白世界的奧秘。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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