基因組測(cè)序證實(shí)，慢性肝炎感染和炎癥可能對(duì)肝臟腫瘤中發(fā)現(xiàn)的基因突變，產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響，從而為更好理解慢性肝炎導(dǎo)致癌癥的機(jī)制，鋪平了道路。
原發(fā)性肝癌是*癌癥死亡的第三大原因，zui近的研究表明，特別是在亞洲，感染乙型或丙型肝炎病毒，往往與這類(lèi)癌癥有關(guān)。肝癌從細(xì)胞來(lái)源角度可分為三種：肝細(xì)胞型、膽管細(xì)胞型和混合型。
在這項(xiàng)研究中，研究小組對(duì)30份被歸類(lèi)為有膽管表型的肝癌腫瘤樣本，進(jìn)行了全基因組測(cè)序。這種類(lèi)型的癌癥起源于肝臟，但是卻不同于肝細(xì)胞癌——原發(fā)性肝癌的主要形式，通常更具有侵襲性，預(yù)后較差。他們將數(shù)據(jù)與60個(gè)更為常見(jiàn)的肝細(xì)胞癌腫瘤進(jìn)行了對(duì)比。為了研究基因表達(dá)，隨后他們檢測(cè)了來(lái)自25份膽管型肝癌和44份肝細(xì)胞癌樣本的RNA測(cè)序數(shù)據(jù)。
肝細(xì)胞癌和膽管表型肝癌之間是不同的，并取決于組織學(xué)類(lèi)型，但是細(xì)胞中的總體突變模式，在感染丙型或乙型肝炎病毒的患者所顯現(xiàn)的腫瘤之間實(shí)際上是相似的，不同于沒(méi)有這種感染的患者腫瘤。這種相同的聚類(lèi)，在病因?qū)W充分理解的癌癥中也曾發(fā)現(xiàn)，癌癥——甚至不同組織學(xué)類(lèi)型的癌癥，可能來(lái)自于相同的細(xì)胞，也許是肝臟祖細(xì)胞。在沒(méi)有感染肝炎的患者當(dāng)中，我們沒(méi)有發(fā)現(xiàn)任何聚類(lèi)，這表明他們的癌癥可能具有非常不同的細(xì)胞來(lái)源。
通過(guò)分析，研究人員還能夠確定更具侵襲性的膽管型肝癌相關(guān)的突變變化。具體地說(shuō)，他們發(fā)現(xiàn)，KRAS和IDHs（與更具侵襲性癌癥有關(guān)的基因）突變，在具有慢性肝炎的患者腫瘤中不太常見(jiàn)。
通過(guò)我們的分析，我們能夠鑒定一些具有膽管表型的肝癌，它們接近于肝癌，以及其他類(lèi)似于膽管癌的癌癥。我們希望，在未來(lái)這將使我們能夠?yàn)槊糠N類(lèi)型的癌癥定制個(gè)性化療法。我們也希望，我們所發(fā)現(xiàn)的新基因突變，可以用作未來(lái)治療的靶標(biāo)。
這項(xiàng)研究是癌癥基因組協(xié)會(huì)（ICGC）項(xiàng)目的一部分，該項(xiàng)目旨在對(duì)50多種不同的腫瘤類(lèi)型或/和亞型的基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組變化，進(jìn)行一個(gè)全面的描述，這在具有重要的臨床和社會(huì)意義。RIKEN負(fù)責(zé)其中一個(gè)項(xiàng)目，研究與病毒感染有關(guān)的肝癌。