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動植物樣品的采集及DNA樣品的提取

來源:上海士鋒生物科技有限公司   2015年12月28日 07:48  

7.1.動物樣品的采集及處理方法
遺傳學數據在野生動物和圈養動物的保護和管理中變得日益重要。在本文中,我們總結了一些能簡便而有效地獲得樣品及數據的方法。
我們在采集樣品之前,對將要進行的遺傳學分析有所了解。然而,采集者并非都是研究者,當采集地與實驗室有相當距離時,采集者常常要保存好樣品直到有合適的接受者或存放地,這就要求采集者應具備一定的經驗。
首先,所有樣品均應以個體序號進行標注,并且應寫上種名、性別、采樣者姓名以及采集日期,越詳盡越好,以便同一個體的不同類數據可以相互引用,另外,地理來源的標注也很重要,需要注明。對于野外捕獲的動物,有條件者在地圖上標明捕獲地及其經緯度。對圈養動物的每個野外捕獲種源都要有同樣的記錄和詳盡的譜系圖,因為譜系圖可用于計算近交系數。
總之,背景資料越詳細越好,即使不能得到這里所列的全部信息,也要盡可能詳盡。
7.l.1 樣品的測量方法
在一定數量的分類群中采用的標準測量方法可用于以下四個方面:
(1)分類學上:一套理想的測量方法應能大致上重建機體每個主要硬件部分的形狀和大小。
(2)不對稱性分析:機體各部分的起伏不對稱,也許表明進化過程在一定程度上正在變得不穩定,這可能是環境壓力或近交的結果。測量不對稱時機體左右兩部分均應考慮在內。
(3)遺傳變異:在科級水平上,如果對同一年齡的個體采用同樣的測量方法,就有可能對所選特征中的遺傳成分變異進行粗略的估計。雖然并非總是能做到這樣,但能使遺傳學家對所選特征(如生殖特征方面遺傳變異的任何丟失)進行監視。
(4)生理檢測或記錄:采用標準測量方法得到的記錄,也許會有助于與用其他手段得到的數據起來分析。例如,如果有了精子形態的記錄,或是特殊寄生物的感染記錄,遺傳學家就能因此尋找在不同群體中這些因素與變異水平的相關性。
7.1.2 組織樣品的采集和保存
表7-1 列出了常用的組織在遺傳學研究中的用途。下面詳細給出針對不同研究目的的適當方法。當然,每個實驗室都有各自習慣的組織處理方法,因此,本文僅給出快速保存的有關要求,但對每種組織的可用性都有所評述,以便在用途有沖突時,能對潛在數據的可能應用作出迅速判斷。

注:表中數字代表正文中敘述的方法。數字“1”即代表正文7.1.2.1 中的方法,數字“2”即代表正文7.1.2.2中的方法。其余依此類推。
使用腫瘤、毛發及精子樣品,保存時應特別注意。使用細胞培養樣品可減少對活體或新殺動物的依賴,如果培養物來源于腫瘤組織細胞,則可大量減少對同種動物組織的進一步需求。組織材料必須在數小時內送到有關實驗室或用于其他的細胞培養。如果已經知道DNA 序列的一小部分,就可利用PCR 技術從很少一部分組織中擴增DNA,從而使極其的樣品(如一根毛發或單個精子)具有更高的利用價值和更大的可信度。
組織必須取自活體動物或死后1~2 分鐘內的動物,并且要快速保存起來,除非出現下述情況:在野外條件或是匆忙安排的活體取樣,因此沒有時間同實驗室。此時要有目的地擴大采集和儲存量。如果已經詳細知道樣品的確切用途,則有時條件可以放寬。例如,對血液樣品來說,有些酶是不要求立即凍存的。
每一種組織的制備和保存方法均列在表7-1 中,表中同時列出了每種樣品的用途。快速凍存時樣品可放人液氮、干冰中或直接放入-70℃冰箱。凍存樣品可在—70℃液氮、冰箱、干冰或-20℃冰箱中保存和運輸。樣品凍存及運輸均以放入液氮中效果較好。非凍結冰箱是不能用的。

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