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五種不同的制備siRNA方法的比較

來源:上海士鋒生物科技有限公司   2015年12月16日 08:00  

比較項目化學合成體外轉錄RNAse III降解dsRNAsirna
表達載體PCR
表達框材料需求 21-mer RNA
oligos(一對)29-mer DNA oligos(一對)轉錄模版 (200-1000bp,兩側帶T7 啟動子)55-60-mer DNA oligos(一對) ~50-mer DNA oligos(一對)全部制備/合成時間所需時間4天—2周24 小時 + DNA oligo合成時間1 天 + 轉錄模版制備時間5天以上 + DNA oligo合成時間~ 6 小時 + DNA oligo合成時間個人所需操作時間幾乎不需要*中等中等多中等是否需要驗證和尋找zui有效siRNA需要需要不需要需要需要能否標記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進入細胞過程或者在細胞中的定位)能能能不能不能轉染的相對難易程度好好好差差可篩選性 (例如抗生素篩選) 不可以不可以不可以可以不可以能否用于長效抑制不可以不可以不可以可以(抗生素篩選)不可以能否大規模制備可以有限有限可以有限檢測總體轉染效率不可以不可以不可以可以不可以每個基因的相對費用(不包含人力)高中等低中等中等*取決于合成后是否包含純化、去保護,以及廠家提供的是已經退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈

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