一、目的
　　
　　熟練掌握瓊脂糖凝膠電泳法。
　　
　　利用瓊脂糖凝膠電泳測DNA分子量和質粒dna分子純度，并熟悉各種核酸分子在瓊脂糖凝膠電泳中的位置分布和某些特性。
　　
　　二、原理
　　
　　瓊脂糖是一種直鏈多糖。它是由B—D吡喃半乳糖和3，6—脫水半乳糖以1，3—β糖苷鍵相連的雙糖聚合物，鏈狀瓊脂糖分子之間相互以氫鍵交聯。形成網絡系統。瓊脂糖帶有親水性，不含有帶電荷的基因，也不會引起核酸分子的變性，而且不吸附被分離的物質，因此成為基因工程上的凝膠劑。
　　
　　當核酸分子在瓊脂糖凝膠電場中時，分子上帶電基團在pH8.0條件下帶負電荷，在電場作用中移向正數，至使核酸分子在瓊脂糖凝膠電泳中有其遷移率。遷移率與下列因素有關：
　　
　　1.核酸分子的大小：在相同的條件下，不同大小的核酸分子的遷移率不同，小分子的遷移率大，大分子的遷移率小。其中線狀雙鏈DNA分子在一定濃度瓊脂糖上電泳的速度與線狀雙鏈DNA分子的分子量對數成反比（圖3－1）；所以根據遷移率大小可測定DNA分子的大小。
　　
　　不過實際應用時，通常將待測定的DNA和已知分子量大小的標準dna片段進行電泳對照，觀察其遷移距離，就可知該樣品的分子量大小。
　　
　　2、遷移率與核酸構象有關,瓊脂糖凝膠電泳可以鑒別分子量相同但構型不同的DNA分子。在依常規方法抽提的質粒DNA通常具有三種不同的構象:超螺旋型（SC）、線形（L）和開環型（OC）。這三種構型分子有不同的遷移率。在一般情況下,超螺旋型（SC）遷移速度zui快，其次為線狀（L）分子,zui慢的為開環型（OC）分子。若提取到的質粒DNA樣品中,還有染色體DNA或RNA,在瓊脂糖凝膠電泳上也可以分別觀察到電泳區帶,由此可分析樣品的純度(圖3－2)。
　　
　　圖3－2凝膠電泳，DNA移動距離和分子量關系（緩沖液0.5×TBE,0.5ug/ml溴化乙錠電泳條件1v/cm16小時）
　　
　　DNA的純度和分子量的測定
　　
　　圖3－3提純和未提純質粒DNA電泳圖