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454(GS FLX系統)超高通量測序服務|實驗技術服務

來源:上海乾思生物科技有限公司   2015年06月02日 13:01  

關鍵詞:454(GS FLX系統)超高通量測序服務|實驗技術服務
簡介:世界*品牌454(GS FLX系統)超高通量測序服務|實驗技術服務原裝,質量保證,*。
454(GS FLX系統)超高通量測序服務|實驗技術服務——pCzn1質粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。在獲得重組蛋白產品的同時,我們也會提供相應的原始數據和原始圖片,不需要再額外花費精力重復實驗。另一方面,我們所有的實驗數據真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質粒,客戶可以依據我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產品品牌:454(GS FLX系統)超高通量測序服務|實驗技術服務   http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
實驗描述               
測序實驗流程:
1、文庫制備:根據樣品的種類和實驗目的,將基因組DNA/cDNA段化處理至400-800bp間,經末端修復與特異性接頭連接等修飾后變性處理回收單鏈的DNA(sstDNA);
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
2、Emulsion  PCR:特定比例的單鏈DNA文庫被固定在特別設計的DNA捕獲磁珠上,使大部分磁珠磁珠攜帶了一個*的單鏈DNA斷。磁珠結合的文庫被擴增試劑乳化,形成油包水的混合物,每個*的片斷在自己的微反應器里進行獨立的擴增,而不受其他的競爭性或者污染性序列的影響。整個片段文庫的擴增平行進行。擴增后產生了幾百萬個相同的拷貝。隨后,乳液混合物被打破,擴增后仍結合在磁珠上的段既可被回收純化用于后續的測序實驗;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
3、測序反應:攜帶DNA的珠子與其他反應物混合物,隨后放入PTP板中進行后繼的測序。PTP孔的直徑(29um)只能容納一個珠子(20um)。然后將PTP板放置在GS FLX中,測序開始。每一個與模板鏈互補的核苷酸的添加都會產生化學發光的信號,并被CCD照相機所捕獲;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
4、數據分析:GS FLX系統在10小時的運行當中可獲得100多萬個讀長,讀取超過4-6億個堿基信息,通過GS FLX系統提供兩種不同的生物信息學工具對測序數據進行分析。
技術特點:
? 速度快,一個測序反應耗時10個小時,獲得4-6億(400-600M)個堿基對。比傳統的Sanger測序的方法快100倍;
? 讀長長,單個序列的讀長更長,平均可達到450個堿基左右;
? 通量高,每個反應可以得到超過100萬個序列讀長,成本大大降低;
? 準確度高,讀長超過400bp時,單一讀長的準確性可以超過99%;
? 一致性好,測序結果一致性超過99.99%;
? 可以進行Pair-End測序研究;
? 簡便,不需要進行建庫、克隆挑取、質粒提取等工作,一個人可以在一天內完成一個微生物物種的測序工作。
GS FLX系統的應用
全基因組測序
多達120 Mb的未知基因組的測序
-生成基因組結構概圖
-研究DNA序列的組織,分布和信息
-基因篩查:尋找新基因,定位和功能
-和其他基因組進行比較研究
全基因組進行測序,例如微生物基因,BAC和YAC克隆測序。
比較基因組研究
-識別單堿基突變
-識別突變熱點和保守區域
-識別插入或者缺失的基因
-斷定基因型和表型之間的相關關系(比如,研究藥物抗性的遺傳基礎)
- 基于基因測序變化進行毒性預測
-進行流行病學分析
-了解工業生產菌株和它們的親代菌株序列上的差異作為進行工業生產菌株開發的遺傳基礎
-進行宏基因組 (metagenomics)研究
-古代化石DNA 測序研究
利用配對末端方法(Pair-End Tag)將Contigs拼接成Scaffolds。
轉錄組和基因調節研究
基于短Tags,ESTs, ChIP,或者GIS-PET序列的高通量轉錄組分析,或者miRNA 序列的基因組范圍識別,小分子和非編碼RNA的測序。
研究DNA的甲基化模式來進行基因調節的研究。
擴增產物分析
PCR產物的超精細測序(應用于醫學研究的重測序)
-在混合的腫瘤樣本中識別體細胞突變
-在群體水平上發現高可信度的SNP位點

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