儲存條件:
細胞裂解液R 4℃放置;溶菌酶(100ug/ul) -20℃保存;其他試劑室溫保存。另外,為了去除RNA 中少量殘存的DNA,客戶可根據需要購買DNase I。
產品簡介
本試劑盒可從細菌細胞中快速提取總RNA,可同時處理大量不同樣品。提取的總RNA 純度高,沒有蛋白和其它雜質的污染,可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、芯片分析、Northern blot、Dot blot、polyA 篩選、體外翻譯、RNase 保護分析和分子克隆等多種下游實驗。預防RNase污染,應注意以下幾方面:
1. 經常更換新手套。因為皮膚經常帶有細菌,可能導致RNase 污染。
2. 使用無RNase 的塑料制品和槍頭避免交叉污染。
3. RNA 在細菌細胞裂解液中時不會被RNase 降解。但提取后繼續處理過程中應使用不含RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 小時,塑料器皿可在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鐘,然后用水*清洗,再滅菌,即可去除RNase。
4. 配制溶液應使用RNase-free ddH2O。(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%( v/v),混勻后放置過夜,高壓滅菌。)
使用前注意事項
1. 裂解液在儲存時可能會形成沉淀,如果有沉淀出現,請加熱溶解后使用。
2. *次使用前應在漂洗液RW 中加入無水乙醇,加入量請參見瓶上標簽。
操作步驟
柱平衡步驟:向吸附柱中(吸附柱放入收集管中)加入500μl 平衡液,12,000 rpm(~13,400×g )離心1 分鐘,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱重新放回收集管中備用(請使用當天處理過的柱子)。
1. 4℃12,000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘收集菌體(收集菌體的zui大量不超過1×109),仔細去除所有培養基上清。
注:如果培養基上清去除不*,將對第二步中的細胞壁消化過程產生抑制。
2. 用含有溶菌酶的100 ul 細胞懸浮液(客戶自己配制,配制方法見下表)*重懸菌體,孵育時間如下。
細胞懸浮液中的溶菌酶終濃度 孵育時間(室溫)
G-細菌 400 ug/ ml 3-5 min
G+細菌 3 mg/ ml 5-10 min
3. 加入1ml 裂解液R,渦旋振蕩混勻,若出現不溶性沉淀,12000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘,將上清轉移至另一離心管中。
4. 每1ml 裂解液R加0.2ml氯仿。蓋緊樣品管蓋,劇烈振蕩15秒并將其在室溫下孵育3分鐘。
5. 于4℃ 12,000rpm 離心10分鐘,樣品會分成三層:下層有機相,中間層和上層無色的水相,RNA存在于水相中。水相層的容量大約為所加R體積的60%,把水相轉移到吸附柱中(吸附柱套在收集管內)。
6. 12,000rpm 離心45秒,棄掉廢液,將吸附柱重新套回收集管。
7. 加入500μl漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000 rpm 離心45秒,棄掉廢液。
8. 加入500μl漂洗液RW,12,000 rpm 離心45秒,棄掉廢液。
9. 將吸附柱放回空收集管中,13,000 rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應。
10. 取出吸附柱,放入一個新的RNase free離心管中,根據預期RNA產量在吸附膜的中間部位加60-100μl RNase free water, 室溫放置2分鐘, 12,000 rpm 離心1分鐘。得到RNA溶液。
(洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要RNA濃度較高,可以適當減少洗脫體積, 但是zui小體積不少于50μl,體積過小降低RNA洗脫效率,減少RNA產量。)
RNA純度及濃度檢測
完整性: RNA 可用普通瓊脂糖凝膠電泳 (電泳條件:膠濃度1.2%;0.5×TBE 電泳緩沖液;150v,15 分鐘)檢測完整性。由于細胞中70%-80%的RNA 為rRNA,電泳后UV 下應能看到非常明顯的rRNA 條帶。28S rRNA 的量約為18S rRNA 的兩倍,說明RNA 的完整性較好。
純度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白質污染程度的指標。高質量的RNA,OD260/OD280 讀數在1.8-2.1 之間,比值為2.0 是高質量RNA 的標志。OD260/OD280 讀數受測定所用溶液的pH 值影響。同一個RNA 樣品,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數1.8-2.1 之間,在水溶液中所測讀數則可能在1.5-1.9 之間,但這并不表示RNA 不純。
濃度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free ddH2O稀釋n 倍,用RNase-freeddH2O 將分光光度計調零,取稀釋液進行OD260, OD280 測定,按照以下公式進行RNA濃度的計算:
終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數n)×40
DNase I儲存液的配制
將DNase I 干粉(1500 U)溶解在550 μl RNase-free ddH2O 中,輕柔混勻,分裝后-20℃貯存(可保存9 個月)。
DNA reaction buffer:
100mM Tris-HCl( pH 7.5 )
25mM MgCl2
5 mM CaCl2
注意:從-20℃融化后的DNase I 儲存液保存于4℃(可保存6 周),不要再次凍存。
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