FDH 在細胞甲醛代謝與癌癥耐藥研究中被高頻引用,實驗成敗往往取決于操作細節而非試劑本身。下面把一份 96 孔板實驗拆成 6 個關鍵節點,每個節點給出可落地的動作指令與常見故障排查,照著做能把板間 CV 壓到 5% 以下。
樣本制備:裂解液離子強度決定回收率
RIPA 高鹽配方(150 mM NaCl)會抑制 FDH 活性 20–30%,改用 50 mM Tris-HCl + 0.1% Triton X-100 可把回收率拉回 95%。細胞刮下來后先 PBS 洗兩遍,去掉培養基殘留的甲醛,再按 10? cells/mL 加入裂解液,冰上 15 min 后 12 000 g 離心 10 min,取上清立即上機或液氮速凍。裂解液里加 1 mM DTT 可穩定酶活 48 h,但不要加 EDTA,它會螯合 FDH 所需的 Zn2?。
反應體系:乙醛替代甲醛為何更穩
試劑盒說明書常寫“底物甲醛終濃度 5 mM”,實際操作中 37 °C 下甲醛揮發損失 10–15%,導致吸光度漂移。改用乙醛 2 mM 做替代底物,Km 值與甲醛接近,揮發可忽略,線性窗口從 10 min 延長到 30 min。NAD? 濃度固定在 1 mM,pH 9.0 的甘氨酸-NaOH 緩沖液能把 Vmax 推高 1.4 倍,適合低表達樣本。
板布局:空白孔、標準孔、抑制孔如何排布
空白孔:裂解液 + 緩沖液 + NAD?,無乙醛,用來扣背景
標準孔:純化 FDH 梯度 0–0.2 U/mL,做標曲
抑制孔:樣本 + 5 mM 甲酸鈉,驗證信號特異性
每塊板至少留出 4 個空白孔,分布在四角,避免邊緣效應。標準孔做雙列排布,一條用于實驗當天,另一條封膜 4 °C 保存 24 h 內復測,驗證板間穩定性。
讀板參數:振蕩延遲與雙波長校正
酶標儀設 340 nm 檢測 NADH 生成,動力學模式讀 5 min,間隔 15 s。加乙醛啟動反應后延遲 30 s 再開始讀數,讓液體表面張力穩定。開啟 405 nm 參比波長,扣除氣泡或纖維蛋白造成的散射。若使用 384 孔小體系,把振蕩幅度降到 1 mm,防止液體飛濺。
故障排查:信號漂移與負值出現
信號漂移 90% 由揮發或溫度不均導致。把板蓋換成透氣膜,37 °C 預熱 5 min 再上機。出現負值通常是空白孔 OD 高于樣本孔,檢查空白孔是否誤加乙醛,或裂解液里混入了細胞碎片。重新離心 5 min 可解決。
數據換算:蛋白歸一與細胞歸一并用
一張 96 孔板跑完,先用 BCA 測每孔總蛋白,把 U/mL 轉成 U/mg。再用同一孔的細胞計數儀讀數,得到 U/10? cells。兩者比值可判斷樣本裂解效率:比值 <0.5 提示裂解不全,需延長裂解時間或加大 Triton 濃度。
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