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IL-2質(zhì)粒DNA探針制備的操作步驟

來源:上海雅吉生物科技有限公司   2016年09月20日 09:27  

實(shí)驗(yàn)步驟

 

1. 含IL-2質(zhì)粒DNA探針的提取

   1) 取含IL-2質(zhì)粒DNA的單個(gè)菌落置兩個(gè)25ml LB培養(yǎng)基(含100μg/ml Amp),37℃ 220r/min 振搖過液(約16h );

   2) 取10ml菌液加200ml LB培養(yǎng)液(含100μg/ml Amp),37℃ 150r/min振搖 4h;

   3) 加氯霉素(終濃度170μg/ml),37℃ 220r/min振搖3h;

   4) 菌液倒入300ml離心管中離心,4℃ 5000r/min×10min離心棄上清除去殘液(吸水紙無菌);

   5) 每管加40ml STE溶液(冰預(yù)冷)懸浮細(xì)菌后,用移液管轉(zhuǎn)入到50ml離心管中,4℃ 5000r×15min離心;

   6) 棄上清,加5ml溶液1(冰預(yù)冷)懸浮細(xì)菌,加1 ml新配制(pH8.0)的溶菌酶(10g/ml),輕搖,室溫靜置5min;

   7) 加10ml溶液II,蓋上蓋子,將離心管小心顛倒數(shù)次混合液體,不要用旋渦振蕩器,冰浴10min,且勿搖動(dòng);

   8) 加7.5ml溶液III(冰預(yù)冷)搖振蕩離心管數(shù)次使之混合,冰浴20-30min,使沉淀*,4℃ 12000r/min×20min離心;

   9) 取上清到另一50ml離心管中,加0.6體積異丙醇,混勻、室溫靜置15min,室溫5000r/min×15min離心棄上清;

   10) 用75%乙醇洗滌沉淀一次(不將沉淀懸浮),將乙醇倒置吸水紙上,使乙醇揮發(fā);

   11) 用1.5m1TE(pH8.0)將沉淀溶解加等體積冰預(yù)冷的5MLiCl,混勻后置冰溶10min,4℃12000r/min×10min離心;

   12) 取上清至新EP管,加等體積的異丙醇(約3ml)充分混合、室溫靜置15min,室溫12000rmin×10min離心(回收沉淀的核酸);

   13) 小心去上清,將管倒置以使zui后殘留的液滴流盡,用75%乙醇洗滌沉淀,流盡乙醇,用吸低吸去附于管壁的液滴,將管倒置在紙巾上數(shù)分鐘,以使zui后殘余的痕量乙醇蒸發(fā);

   14) 加入RNA酶(終濃度100μg/ml)用500u1TE溶解沉淀DNA,移至新EP管中,37℃水浴30min;

   15) 加等體積(500ul)含13%(W/V)PEG(800)的1.6mol/L NaCl,充分混合,4℃ 12000r/min×5min離心;

   16) 吸去上清用400u1TE(PH8.0)溶解質(zhì)粒DNA沉淀;

   17) 加等體積飽和酚(400ul)混合,12000r/min×10min離心;

   18) 吸上層水相移至另一EP管加入等體積酚::異戊醇(25:24:1)劇烈混勻至乳白狀,12000r/min×10min離心;

   19) 吸上層水相移至另一EP管,加等體積:異戊醇(24:1)混勻,12000r/min×10min離心;

   20) 吸上層水相移至新EP管(硅化)、加入0.1體積的3mol/L NaAC(pH5.2)和2體積的-20℃,預(yù)冷的無水乙醇、混勻(可見沉淀出現(xiàn)),置-20℃2h或0℃20min,4℃12000r/min×15min離心;

   21) 棄上清,加75%乙醇(4℃預(yù)冷)200u1,稍加振蕩,離心洗滌2次,4℃12000r/min×5min離心去上清;

   22) 敞開管口,將管置于實(shí)驗(yàn)桌上直到zui后可見的痕量與乙醇揮發(fā),溶沉淀于11μlTE溶液中;

   23) 取1μl電泳其余進(jìn)行酶切。

2. 經(jīng)0.7%瓊脂凝膠電泳,確定有質(zhì)粒DNA后,用XhoI進(jìn)行酶切。

酶切反應(yīng)體系:10μl質(zhì)粒DNA,6μl內(nèi)切酶XhoI,6μl 10 X酶切緩沖液,38μl蒸餾水,總體積為60μl;37℃消化過液。

3. IL-2 DN段的回收和純化

可以使用任何一種回收與純化DN段的方法,下面介紹的是用WizardTNPCR純化試劑盒回收IL-2 DN段。

   1) 將60μl酶切反應(yīng)體系經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳;

   2) 紫外燈下切下IL-2 DN段,挑出凝膠到EP管中,加1 ml Resin,使凝膠深化;

   3) 用5ml一次性注射器將Resin/DNAmix轉(zhuǎn)移到Wizard Minicolumn中,

   4) 用2ml80%異丙醇洗滌Minicolum;

   5) 12000g離心20min;

   6) 將Minicolumn轉(zhuǎn)移至新EP管中,加50ul滅菌雙蒸水到Minicolumn中,12000g離心20S,收集DNA。

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