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在生命科學進入AI驅動時代的jīntiān,人工智能(AI)正在重塑dànbáizhì測序的技術版圖。從結構預測到de novo測序、從修飾位點識別到序列重構,AI正逐步滲透到dànbáizhì分析的各個層面,提升效率、降低錯誤率,并助力科研人員應對大規模復雜樣本帶來的挑戰。本文將帶你系統了解AI在dànbáizhì測序中的zuì新應用方向、技術原理與主流算法,實現更高質量的蛋白組學數據交付。
一、AI正在改寫的dànbáizhì測序三大核心環節
在傳統dànbáizhì測序流程中,主要挑戰集中在以下三個環節,而AI技術的引入正好在這些關鍵節點發揮出巨大優勢:
1、De novo序列預測
基于質譜的dànbáizhì測序高度依賴數據庫檢索,而AI模型的引入,特別是深度學習神經網絡,使得無需參考數據庫即可進行高置信度de novo預測成為可能。
(1)代表算法:
DeepNovo:基于LSTM模型的de novo肽段預測工具,可自動學習碎裂離子的組合模式。
PointNovo:利用transformer架構提升預測精度,在高復雜背景中仍能保持>80%的氨基酸準確率。
(2)應用價值:
用于未知物種、新蛋白、抗體輕重鏈的序列解析
彌補傳統數據庫比對無法涵蓋全部變異的不足
2、翻譯后修飾(PTM)識別與預測
AI模型可訓練質譜碎片圖譜與特定修飾之間的關聯,從而提高修飾位點的識別準確度,尤其在多種修飾共存或信號弱的樣本中表現尤為突出。
(1)代表算法:
pDeep/PTM-Shepherd:利用CNN模型識別磷酸化、乙?;?、糖基化等修飾特征圖譜;
DeepPhospho:可直接預測磷酸化位點并輸出保守性評分。
(2)應用價值:
在抗體藥、信號通路研究中jīngzhǔn解析修飾位點
縮短修飾鑒定時間,提高自動化程度
3、dànbáizhì序列重構與功能注釋
AI不僅能預測氨基酸排列,還能輔助構建dànbáizhì全長序列,并在結構層面進行功能推斷,特別適用于蛋白異構體識別、單體聚合物追蹤等復雜任務。
(1)代表算法:
AlphaPept:自動化質譜數據處理平臺,集成序列識別、定量與注釋
Prosit:利用深度神經網絡預測肽段碎裂圖譜,提高鑒定準確率和定量一致性
(2)應用價值:
jīngzhǔn識別抗體CDR區、蛋白突變位點
加速蛋白數據庫自動注釋流程
二、AI在蛋白測序中的核心優勢
AI不僅提升了分析性能,更重要的是推動dànbáizhì組學邁向智能化、高通量、自動化的未來。
三、AI + 質譜平臺:百泰派克的智能dànbáizhì測序實踐
作為優質的dànbáizhì組學服務商,百泰派克生物科技前瞻性地將AI技術融入蛋白測序全流程,打造出更高置信度、更快交付速度的智能化測序平臺,廣泛應用于基礎科研、抗體藥物開發、疫苗研發及生物標志物挖掘等項目中。我們的AI賦能策略包括:
1、自研AI數據分析管線:基于Prosit、DeepNovo和AlphaPept算法優化碎裂圖譜解讀與肽段重建流程;
2、多模型集成判斷機制:融合傳統打分機制與AI預測評分,提高鑒定置信度,尤其適用于低豐度蛋白或異構體;
3、抗體測序專用AI模塊:專為CDR區識別與輕重鏈配對開發的模型,適配雜交瘤與人源化抗體;
4、全流程自動化系統對接:從原始RAW文件上傳到報告生成全程智能監控,節省>60%分析時間。
AI在dànbáizhì測序領域的發展才剛剛開始,未來將呈現以下幾大趨勢:
1、端到端dànbáizhì結構解析:AlphaFold等工具的推廣將與質譜數據深度融合,實現從序列到三維結構的自動建模。
2、跨組學智能整合:AI將成為蛋白組+轉錄組+代謝組等多組學數據融合的核心引擎,推動系統生物學研究。
3、單細胞dànbáizhì測序突破:隨著AI算法優化與信號放大技術進步,單細胞水平蛋白組分析將成為現實。
4、個性化藥物開發提速:基于患者特異蛋白圖譜的AI分析,將助力靶點篩選、免疫原性預測和新藥設計。
AI并非要替代傳統質譜分析方法,而是在保留實驗科學嚴謹性的基礎上,提升數據的可解釋性、處理速度與分析深度。對于科研人員而言,AI的價值在于更快、更準、更系統地還原dànbáizhì的真實世界。在百泰派克生物科技,我們不僅掌握前沿dànbáizhì測序技術,更致力于將AI能力切實落地,為客戶提供可信賴的科研支持。如果你正計劃開展dànbáizhì序列測定、修飾識別或抗體序列確認項目,歡迎聯系我們開啟AI賦能的jīngzhǔn測序之旅。
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百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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