從頭測序的優(yōu)勢與應用領域檢測技術服務詳情介紹

在dànbáizhì組學研究中，大多數(shù)質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析依賴于數(shù)據(jù)庫搜索法（Database Search），即通過已知dànbáizhì序列對實驗質(zhì)譜圖譜進行匹配。從頭測序（De novo Sequencing）作為wánquán不依賴參考數(shù)據(jù)庫的序列解析方法，成為了解鎖未知dànbáizhì結構與功能的重要工具。

一、從頭測序的核心優(yōu)勢

1、wánquán獨立于數(shù)據(jù)庫

從頭測序基于質(zhì)譜儀采集的串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）數(shù)據(jù)，直接解析肽段的氨基酸序列，無需借助數(shù)據(jù)庫對照。對于非模式生物、環(huán)境樣本、古生物材料等缺乏注釋信息的樣本，具有天然優(yōu)勢。

2、可發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中未收錄的新肽段

在腫瘤、感染或基因突變等生物學背景下，dànbáizhì表達譜可能與標準數(shù)據(jù)庫顯著不同。從頭測序可識別出新生肽段、剪接變異產(chǎn)物、融合蛋白等結構信息，為機制研究和靶點發(fā)現(xiàn)提供基礎。

3、對突變和修飾具有高度敏感性

從頭測序能夠識別非同義突變、氨基酸替換和微小插入缺失，同時支持對多種翻譯后修飾（PTMs）的解析，如磷酸化、乙酰化、糖基化等。

4、啟用多種算法提升準確率

現(xiàn)代從頭測序流程通常融合多種計算算法，如譜圖匹配（Tag-based）與圖論算法（Graph-based），結合機器學習輔助判讀，使得在復雜背景下的序列還原更加jīngzhǔn與高效。

二、從頭測序的主要應用領域

從頭測序廣泛應用于生命科學研究、臨床轉化、工業(yè)生物技術等多個領域。

1、基礎生命科學研究

• 用于功能未知dànbáizhì的結構解析

• 支持系統(tǒng)進化研究中非模式物種間的序列對比

• 輔助信號通路重建與功能注釋，尤其在物種特異性dànbáizhì上具有dútè價值

2、疾病機制研究與jīngzhǔn醫(yī)學

• 揭示突變相關的新生肽段，為個性化診療提供生物標志物基礎

• 識別疾病相關dànbáizhì的修飾狀態(tài)變化，如腫瘤細胞中tèyǒu的磷酸化圖譜

• 幫助發(fā)現(xiàn)潛在新抗原，支持個體化miǎnyìzhìliáo策略開發(fā)

3、抗體開發(fā)與結構確認

• 應用于雜交瘤或自然來源抗體序列解析，支持結構優(yōu)化與zhuānlì規(guī)避

• 在抗體人源化與親和力成熟中，提供jīngquè序列模板

• 可用于雙特異抗體、多特異抗體的結構域識別與驗證

4、生物技術與工業(yè)蛋白分析

• 適用于合成多肽、重組蛋白等產(chǎn)品的序列驗證

• 評估生產(chǎn)過程中的微小變異或突變風險，增強質(zhì)量控制能力

• 在仿制藥一致性評價中應用廣泛，尤其在蛋白結構比較環(huán)節(jié)中價值顯著

5、微生態(tài)與環(huán)境樣本研究

• 分析微生物群落表達的未知dànbáizhì，挖掘潛在酶資源與代謝通路

• 監(jiān)測環(huán)境樣本中的生物標志物蛋白或外源污染物響應蛋白

• 輔助解析jíduān環(huán)境生物適應機制

三、從頭測序的潛在挑戰(zhàn)

盡管從頭測序在多個領域表現(xiàn)出強大能力，但仍面臨一些技術性挑戰(zhàn)：

1、譜圖質(zhì)量要求高

從頭測序嚴重依賴高分辨率、高信噪比的MS/MS譜圖。質(zhì)譜數(shù)據(jù)質(zhì)量直接決定解析的準確性與覆蓋度，尤其對低豐度肽段較為敏感。

2、修飾與異構體判讀困難

部分修飾位點（如異構磷酸化、糖基化）具有相同質(zhì)量信息，解析難度大。且多修飾共存情況下，肽段碎裂譜圖更為復雜，提升算法性能成為未來關鍵方向。

3、缺乏標準驗證手段

由于不依賴參考數(shù)據(jù)庫，從頭測序結果難以直接比對驗證，依賴轉錄組對照、同位素標記或人工合成驗證等方式，驗證流程復雜度較高。

從頭測序不僅是一項分析技術，更是突破數(shù)據(jù)庫壁壘、探索未知dànbáizhì結構與功能的戰(zhàn)略路徑。在dànbáizhì組學研究日益向個性化、多樣化、非標準化方向發(fā)展的趨勢下，從頭測序的重要性將愈加突出。百泰派克生物科技圍繞質(zhì)譜組學技術不斷拓展，從平臺建設到算法優(yōu)化，為科研人員和企業(yè)研發(fā)團隊提供高質(zhì)量、高置信度的從頭測序服務，助力解析更廣闊的生物世界。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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