如何進行高精度抗體測序？檢測技術服務詳情介紹

抗體測序（Antibody Sequencing）作為抗體藥研發和抗體表征的重要工具，近年來受到廣泛關注。尤其在CDMO委托生產、抗體人源化、zhuānlì布局與一致性分析等場景中，對抗體序列的準確率、完整性和功能位點識別能力提出了更高要求。那么，如何實現高精度的抗體測序？測序中需要注意哪些關鍵步驟和技術細節？本文將全面解析抗體測序的基本原理、主流策略、技術難點與解決方案，助您掌握高質量抗體測序的核心要點。

一、什么是抗體測序？為什么這么重要？

抗體測序，指的是通過實驗手段解析抗體分子的氨基酸序列信息，尤其是其可變區（Variable region）中的CDR（互補決定區）序列。測序對象可以是純化抗體、雜交瘤表達產物、重組表達體系中的抗體，或者B細胞水平的天然抗體。

高精度抗體測序對于以下任務至關重要：

• 抗體藥物開發：構建表達系統、優化親和力或穩定性

• 抗體人源化：保留CDR，替換framework區域

• 抗體知識產權申請：確證序列wéiyī性

• 批次一致性分析：用于生物等效性驗證

• 單抗篩選與文獻再開發：復制已發表抗體或抗原驗證工具

二、抗體測序的主流技術路線

抗體測序技術主要分為兩大類：

1、基因測序法（Antibody Gene Sequencing）

通過RNA提取 → 反轉錄 → PCR擴增 → NGS測序 → 翻譯為氨基酸序列

（1）優勢：

靈敏度高，可追溯至單個B細胞克隆

適用于B細胞文庫、高通量篩選等場景

（2）局限：

僅能預測理論序列，無法識別翻譯后修飾或突變

對于無法獲取細胞來源的抗體（如純化產品）不適用

2、dànbáizhì質譜測序（Mass Spectrometry-Based De Novo Sequencing）

通過抗體酶解 → 質譜分析 → 肽段識別 → de novo重建蛋白全長序列

（1）優勢：

直接基于蛋白本體，不依賴細胞/核酸信息

可識別實際表達產物，包括修飾、突變、異構體

適用于商業抗體、文獻抗體、原液抗體等多種樣本

（2）局限：

對實驗平臺和算法要求高，部分結構（如N端阻斷）難以解析

在應用場景廣泛、高度依賴序列準確性的背景下，高精度dànbáizhì質譜測序法已成為行業shǒuxuǎn。

三、高精度抗體測序的關鍵技術要點

要實現>98%的準確率與>95%的序列覆蓋度，需在以下幾個技術環節做到jízhì：

1、多酶酶解策略

（1）使用多種特異性酶（如 Trypsin、Glu-C、Chymotrypsin、Asp-N）進行組合酶解

（2）產生多樣化的重疊肽段，避免肽段盲區

（3）有助于跨越結構域邊界，重建長序列片段

2、高分辨率串聯質譜分析

（1）采用高精度儀器（如 Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2）實現>120,000分辨率

（2）二級碎裂技術（HCD/ETD）用于精細獲取肽段碎片譜圖

（3）支持多電荷狀態與低豐度肽段檢測

3、AI輔助的de novo序列重建算法

（1）基于深度學習模型（如 DeepNovo、Novor、pNovo+）預測氨基酸順序

（2）與數據庫搜索結果融合，優化匹配精度

（3）可有效識別非典型片段、修飾或突變位點

4、抗體框架與CDR區域智能識別

（1）利用IMGT、Abysis、IgBlast 等數據庫比對框架區，jīngzhǔn定位CDR1、CDR2、CDR3

（2）區分輕鏈/重鏈并確認可變區完整性

（3）支持多抗樣本中的混合序列解析

四、抗體測序常見難點與解決方案

五、百泰派克生物科技的抗體測序平臺優勢

作為zhuānyè的dànbáizhì組學與抗體測序服務提供商，百泰派克生物科技構建了一套針對抗體樣本優化的高精度測序平臺，支持從原液、雜交瘤、表達產物等多種來源的一站式服務：

* 多酶測序標準流程：Trypsin + Glu-C + Asp-N 三重酶解方案

• AI算法輔助拼接：集成 DeepNovo 和數據庫比對雙引擎

• CDR識別與框架注釋：基于 IMGT 標準，自動標記抗原結合區

• 全套報告輸出：提供氨基酸序列圖譜、覆蓋率熱圖、CDR區域標注、置信度評分等

測序準確率 >98%，序列完整性 >95%，已支持上百家藥企、CRO和科研單位完成抗體分析、備案申報等多種項目。

隨著抗體藥物市場的持續擴張，抗體測序不再是“可選項"，而是實現分子溯源、優化設計、確保質量的基礎操作。高精度抗體測序不僅需要優良的質譜平臺，更依賴于深度算法融合 + 蛋白注釋能力 + 實驗標準化流程的協同優化。在百泰派克生物科技，我們不僅關注“測出"，更關注“測準"“測懂"“測得快"。如果您有抗體序列解析、研發轉化、zhuānlì驗證等方面需求，歡迎聯系我們獲取zhuānyè建議和定制方案。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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