當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> 蛋白全長測序:高精度、低樣本量的完整序列
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在生命科學研究與生物醫藥開發中,dànbáizhì的結構與功能密切相關,而蛋白的全長序列信息則是解析其功能、突變位點修飾及翻譯后加工等過程的關鍵數據基礎。傳統質譜方法往往依賴酶解將蛋白“打碎"成肽段進行識別,可能導致序列信息缺失。蛋白全長測序(Full-Length Protein Sequencing, FLPS)通過多酶組合和高精度質譜平臺,致力于獲取dànbáizhì的完整序列信息,已成為dànbáizhì組學研究中逐步興起的補充技術路線。
1、什么是蛋白全長測序?為何它如此重要?
蛋白全長測序旨在解析蛋白分子的完整氨基酸序列,涵蓋N端、C端及中間區域,避免了傳統酶解方法可能遺漏的結構域或修飾位點。這項技術在以下研究場景中展現出bùkětìdài的價值:
(1)抗體序列解析與zhuānlì申報:jīngquè獲取輕鏈與重鏈全序列,支持抗體人源化設計與知識產權保護
(2)生物藥質量控制:識別突變、異構體、剪切變體等產品一致性問題
(3)新蛋白功能研究:探索天然蛋白的新型翻譯變體、修飾模式和信號肽保留區段
2、技術挑戰:全長測序為何難以實現?
與基因組測序相比,dànbáizhì全長測序面臨三大難點:
(1)肽段覆蓋不足:傳統酶切法依賴酶解模式,難以全面覆蓋蛋白全長
(2)翻譯后修飾復雜:如磷酸化、糖基化等修飾影響碎片離子特征,干擾序列解析
(3)分子異構體共存:同分異構體(如異構肽)造成數據庫搜索歧義,增加序列不確定性
3、高精度蛋白全長測序策略:多酶組合與串聯質譜平臺
為了應對上述挑戰,百泰派克生物科技采用了一套集多酶切割策略、多級質譜采集(MSn)與de novo解析算法于一體的高覆蓋度測序流程:
(1)多酶切割+多模式建庫
我們綜合使用Trypsin、Chymotrypsin、Glu-C等多種酶切方式,zuì大程度打破結構域限制,提高覆蓋度。同時支持非酶解策略(top-down或middle-down),用于保留蛋白天然修飾狀態。
(2)高分辨串聯質譜平臺
采用Orbitrap Eclipse、timsTOF等高分辨質譜設備,結合HCD+ETD雙碎裂模式,有效識別PTMs(翻譯后修飾)并提高低豐度肽段檢測靈敏度。
(3)de novo+database雙模式解析
結合數據庫檢索與de novo算法交叉驗證,提升新型突變或未知蛋白序列的準確性與完整性。
(4)低樣本起始量,適配多種樣品類型
百泰派克生物科技的全長蛋白測序服務支持從低至1µg蛋白樣本起始,適配血清、細胞裂解液、純化蛋白、組織勻漿等多種樣品來源。特別適合臨床樣本和zhēnxī樣本的研究需求。
4、總結:從蛋白肽段走向完整序列
蛋白全長測序技術正逐步從探索性研究走向高通量與高重現性的標準化應用。它不僅拓展了dànbáizhì組學的邊界,更為抗體藥物開發、生物制劑質控、以及基礎生命科學研究提供了全新的數據維度。在百泰派克生物科技,我們專注于提供高質量、可交付全長序列的定制化測序服務,助力科研人員深入解析蛋白功能的每一個氨基酸位點。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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