優(yōu)化PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)，實(shí)現(xiàn)高靈敏度低豐度蛋白檢測(cè)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在疾病早篩、生物標(biāo)志物驗(yàn)證及藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)等研究中，低豐度蛋白的jīngzhǔn檢測(cè)一直是dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域的核心挑戰(zhàn)。并行反應(yīng)監(jiān)測(cè)（Parallel Reaction Monitoring, PRM）技術(shù)，憑借其出色的定量準(zhǔn)確性和特異性，正在成為靶向dànbáizhì組學(xué)研究的主流策略。通過系統(tǒng)優(yōu)化PRM策略，科學(xué)家們正不斷突破檢測(cè)靈敏度的極限，推動(dòng)低豐度蛋白的高質(zhì)量定量分析。

一、PRM技術(shù)原理

PRM是一種基于高分辨率質(zhì)譜（如Orbitrap）平臺(tái)的靶向定量方法，與多反應(yīng)監(jiān)測(cè)（MRM）相比，其無需預(yù)先選擇碎片離子，可同時(shí)監(jiān)測(cè)目標(biāo)肽段的所有產(chǎn)物離子，極大提升了定量的特異性與通量。

二、PRM的核心優(yōu)勢(shì)

→ 高選擇性：借助高分辨率、高精度的質(zhì)譜平臺(tái)，有效區(qū)分同分異構(gòu)體或背景干擾信號(hào)；

→ 高通量兼容性：支持多靶點(diǎn)并行監(jiān)測(cè)，適用于復(fù)雜樣本的多標(biāo)志物分析；

→ 簡(jiǎn)化方法開發(fā)：不同于MRM需優(yōu)化多個(gè)過渡離子，PRM方法建立更為高效、穩(wěn)定。

然而，在應(yīng)用PRM檢測(cè)低豐度蛋白時(shí)，依舊面臨諸如信號(hào)弱、離子抑制效應(yīng)、肽段選擇不當(dāng)?shù)戎T多技術(shù)難題。

優(yōu)化策略一：前處理流程精細(xì)化，提升靶肽富集效率

低豐度蛋白常常埋藏在高豐度背景（如白蛋白、免疫球蛋白）中，前處理效率直接決定其能否被成功捕獲。當(dāng)前，提升樣本準(zhǔn)備環(huán)節(jié)的富集效果，已成為優(yōu)化PRM定量的關(guān)鍵前提。

※ 常見優(yōu)化手段包括：

→ 高豐度蛋白去除（HAP depletion）：采用免疫親和柱或磁珠法選擇性去除血清/血漿中的高豐度成分；

→ 目標(biāo)蛋白富集技術(shù)：如免疫沉淀（IP）、親和捕獲或磁珠結(jié)合肽段選擇技術(shù)（SISCAPA）；

→ 微量樣本預(yù)處理平臺(tái)：利用微流控芯片、自動(dòng)化平臺(tái)減少樣本損耗，提升靶標(biāo)回收率。

優(yōu)化策略二：肽段篩選與標(biāo)準(zhǔn)品設(shè)計(jì)的科學(xué)性

PRM定量依賴于對(duì)特異性肽段的jīngzhǔn識(shí)別與監(jiān)測(cè)。若靶肽在酶切效率、離子化能力或保留時(shí)間等方面表現(xiàn)欠佳，容易導(dǎo)致定量偏差。

※ 優(yōu)化肽段選擇的原則包括：

→ 肽段應(yīng)wéiyī對(duì)應(yīng)目標(biāo)蛋白，無同源性干擾；

→ 應(yīng)避免含有修飾位點(diǎn)、易氧化的氨基酸（如Met、Cys）；

→ 應(yīng)具備良好的MS響應(yīng)、穩(wěn)定的保留時(shí)間和酶切效率。

此外，采用穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽段（SIS peptides）作為內(nèi)標(biāo)，可顯著提升定量準(zhǔn)確性，尤其是在復(fù)雜背景下的低豐度蛋白分析中發(fā)揮作用。

優(yōu)化策略三：質(zhì)譜參數(shù)調(diào)優(yōu)與儀器平臺(tái)選擇

質(zhì)譜參數(shù)設(shè)置是決定PRM靈敏度的“zuì后一公里"。合理優(yōu)化采集窗口、碰撞能量（CE）和離子積累時(shí)間（IT），有助于強(qiáng)化目標(biāo)信號(hào)、抑制背景干擾。

※ 常見優(yōu)化方向包括：

→ 采集窗口精細(xì)化：縮短或錯(cuò)開監(jiān)測(cè)窗口，避免信號(hào)重疊；

→ 增強(qiáng)離子聚集時(shí)間：適度延長(zhǎng)IT以增強(qiáng)信號(hào)，但需平衡采樣周期；

→ 多級(jí)篩選精度調(diào)節(jié)：在Orbitrap平臺(tái)上調(diào)節(jié)分辨率與掃描速度的權(quán)衡，提升數(shù)據(jù)質(zhì)量。

優(yōu)化策略四：數(shù)據(jù)分析算法賦能，jīngzhǔn挖掘低信號(hào)

對(duì)于低豐度信號(hào)的提取與判別，傳統(tǒng)分析軟件易受干擾峰影響而產(chǎn)生假陽(yáng)性或漏報(bào)。借助人工智能與深度學(xué)習(xí)算法的新一代數(shù)據(jù)處理平臺(tái)，正在為PRM數(shù)據(jù)賦予更強(qiáng)的靈敏度與可重復(fù)性。

※ 例如：

→ Skyline軟件支持自定義靶點(diǎn)、校準(zhǔn)線繪制及多批次對(duì)比；

→ DIA-NN、Spectronaut等AI工具提升背景建模能力，優(yōu)化信噪比；

→ 多指標(biāo)數(shù)據(jù)整合：將肽段豐度、保留時(shí)間穩(wěn)定性與多肽冗余信息綜合打分，提升定量置信度。

PRM定量dànbáizhì組學(xué)正在成為jīngquè醫(yī)學(xué)研究的關(guān)鍵技術(shù)之一。通過在樣本準(zhǔn)備、肽段設(shè)計(jì)、質(zhì)譜采集及數(shù)據(jù)處理等環(huán)節(jié)的系統(tǒng)優(yōu)化，科學(xué)家正不斷拓展低豐度蛋白的檢測(cè)邊界。百泰派克生物科技致力于為科研客戶提供高靈敏、高準(zhǔn)確、高重現(xiàn)性的PRM定量解決方案。無論是早期標(biāo)志物驗(yàn)證，還是靶向蛋白通量監(jiān)測(cè)，我們都能提供從項(xiàng)目設(shè)計(jì)到交付的全流程一站式服務(wù)。歡迎聯(lián)系百泰派克，獲取定制化靶向dànbáizhì組學(xué)項(xiàng)目方案，讓jīngzhǔn定量更進(jìn)一步！

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

優(yōu)化PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)，實(shí)現(xiàn)高靈敏度低豐度蛋白檢測(cè)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹