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一、技術簡介
Pull-down實驗,又稱拉下實驗,是一種體外親和純化技術。
二、技術原理
將一種蛋白質固定于某種基質上(如Sepharose),但細胞抽提液經過該基質時,可與該固定蛋白相互作用的配體蛋白被吸附,而沒有被吸附的“雜質"則隨洗脫液流出。被吸附的蛋白可以通過改變洗脫液或洗脫條件而回收下來。
三、應用場景
1.驗證已知蛋白相互作用:通過將已知的誘餌蛋白與可能相互作用的獵物蛋白進行Pull-down實驗,若能檢測到獵物蛋白的存在,則可驗證兩者之間的相互作用關系。
2.篩選未知蛋白相互作用:將誘餌蛋白與細胞裂解液或其他蛋白質混合物進行Pull-down實驗,然后對結合的蛋白質進行鑒定,可篩選出與誘餌蛋白相互作用的未知蛋白。
3.研究蛋白質復合物組成:通過Pull-down實驗分離出蛋白質復合物,然后對復合物中的蛋白質進行鑒定,可確定蛋白質復合物的組成成分。
4.研究蛋白質與核酸相互作用:利用DNA Pull-down和RNA Pull-down技術,可研究蛋白質與DNA、RNA之間的相互作用,如轉錄因子與啟動子的結合、RNA結合蛋白與RNA的結合等。
四、技術優勢
可以確定目的蛋白和檢測蛋白是否可以發生直接相互作用。
五、樣本類型
新鮮細胞(貼壁細胞/懸浮細胞)、凍存細胞、凍存組織、裂解液樣本。
六、樣本需求
細胞樣本:約5×10^6個(可以是2個6cm皿,或以懸浮細胞形式存儲于離心管中,或2個T25瓶);
凍存組織:約40mg;
裂解液樣本:蛋白濃度不低于2mg/mg,蛋白總量不低于3mg。
七、樣本準備&運輸
活細胞樣本:距離較近的可提供新鮮樣本,將培養在皿/T25瓶/離心管內的新鮮細胞樣本常溫快遞(最遲次日達)運輸,本市內可閃送或親自遞送,距離較遠的,可-80℃凍存細胞干冰運輸;
組織樣本&裂解液樣本:-80℃凍存干冰運輸。
八、需提供的試劑
如進行WB檢測,需提供相應抗體。
九、實驗周期
3-4周(不包含質譜)
十、其他
RNA-Pull-down、DNA-Pull-down、GST-Pull-down,具體需告知種屬及目標蛋白,后續檢測Western blot/蛋白質譜,融合蛋白體外表達費用需根據具體目標蛋白單獨評估計算。
的轉錄因子,部分實驗亦可使用重組表達的蛋白。
六、樣本需求
細胞樣本:約1×10^7個(可以是1個10cm皿,或以懸浮細胞形式存儲于離心管中,或1個T75瓶);
凍存組織:約400mg;
植物組織:約2g;細胞核蛋白、純化轉錄因子、重組表達蛋白等:每張膜至少提供50ul,濃度不低于0.5mg/ml。
七、樣本準備&運輸
活細胞樣本:距離較近的可以將養在皿/T75瓶/離心管內的新鮮細胞樣本常溫快遞(最遲次日達)運輸,本市內可閃送或親自遞送,距離較遠的,可-80℃凍存細胞干冰運輸;
組織樣本&其他液體樣本:-80℃凍存干冰運輸。
八、需提供的試劑
結合蛋白特異性抗體50ul以上,濃度大于0.5mg/ml。
九、實驗周期
2-3周
十、其他
探針序列,如無探針序列,請提供DNA結合蛋白相關信息或相關文獻。
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