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詳細介紹
SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒
本產(chǎn)品是一步法RT-qPCR檢測新-型-冠-狀-病毒（SARS-CoV-2）Omicron毒株（B.1.1.529）中N區(qū)存在的特征性突變del31-33的試劑盒。del31-33 是指N區(qū)第31~33位中E、R 和 S三個氨基酸缺失的突變。Omicron毒株是在南非shǒu次發(fā)現(xiàn)的變異株，在刺突蛋白中含有30多個突變。它比傳統(tǒng)的變異株具有更高的傳染性，因而被世界衛(wèi)生組織（WHO）列為“關切變異株"（Variant of Concern；VOC）。
本產(chǎn)品針對的是突變位點少的N區(qū)突變，并非突變位點多的S區(qū)。因此引物探針不會與其他突變位點產(chǎn)生反應、干擾測試，即可特異性、高靈敏度檢測Omicron。
經(jīng)證實，本產(chǎn)品不與Alpha變異株、Beta變異株、Gamma變異株產(chǎn)生反應，只與Omicron毒株產(chǎn)生特異性反應。
SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒【281-37703】
◆試劑盒組成
20 Reactions | |
RT 酶混合物（20×） | 20 μL×1 |
一步反應混合物（2×） | 200 μL×1 |
| 野生型引物＆探針混合物（Wild Type Primer & Probe Mixture） | 10 μL×1 |
| N del31-33突變型引物＆探針混合物（N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture） | 10 μL×1 |
◆特點
● 容易判斷
● 使用突變型和傳統(tǒng)型的引物/探針套裝時，可通過比較Ct值進行判斷
● 一步法RT-qPCR法快速檢測突變
● 約70 min 即可完成
● 使用獨立研發(fā)的引物探針進行高靈敏突變檢測
● 當與其他突變體檢測試劑盒組合使用時，所有變異株均可于同一反應條件下在1塊96孔板上進行檢測
● N501Y、E484K、L452R、E484Q、del247-253、N del31-33試劑盒的所有PCR反應條件相同，因此可在
● 1塊96孔板上進行檢測
◆檢測原理
采用TaqMan® 探針的1-step RT-qPCR。
▼使用前 在病毒RNA量多的情況下，使用傳統(tǒng)（非突變）型檢測用的Wild Type Primer / Probe，也能在變異株中觀察到擴增信號。 請務必使用傳統(tǒng)（非突變）型檢測用的Wild Type Primer/Probe 和突變型檢測用的Mutant Type Primer/Probe兩種進行檢測。比較兩種Ct值，若突變型檢測用Mutant Type Primer/Probe的Ct值較小，則判斷該病毒為變異株。 |
◆實驗案例
變異株檢測的應用數(shù)據(jù)
用以下5種新-型-冠-狀-毒株的純化RNA對本試劑盒進行測試：
● Omicron毒株（B.1.1.529）：TY38-873P1，由日本國立傳染病研究所提供
● alpha毒株（B.1.1.7）：QHN001，N501Y突變，由日本國立傳染病研究所提供
● Beta毒株（B.1.351）：TY8-612，N501Y突變，E484K突變，由日本國立傳染病研究所提供
● gamma毒株（P.1）：TY7-501，N501Y突變，E484K突變，由日本國立傳染病研究所提供
● 傳統(tǒng)毒株（VR-1986HK）：從ATCC購買的熱滅活新-型-冠-狀-病毒株
樣本拷貝數(shù)：5000拷貝/孔
循環(huán)數(shù)：45
① Omicron株（B.1.1.529）：TY38-873P1
Omicron毒株在N區(qū)含有del31-33突變，因此N del31-33 Mutant type Primer / Prob的擴增曲線（紅色）比Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）更早起峰。
② alpha株（B.1.1.7）：QHN001
alpha毒株在N區(qū)中不含del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe（藍色）的擴增曲線比 N del31-33 Mutant type Primer / Probe（紅色）的擴增曲線更早起峰。雖然alpha毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變，但經(jīng)確認本產(chǎn)品不與alpha毒株產(chǎn)生反應。
③ Beta株（B.1.351）：TY8-612
Beta毒株在N區(qū)中不含有del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。雖然Beta毒株與Omicron毒株均含有N501Y突變，但經(jīng)確認本產(chǎn)品不與Beta毒株產(chǎn)生反應。
④ gamma毒株（P.1）：TY7-501
gamma毒株在N區(qū)中不含del31-33，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線更早起峰。雖然gamma毒株與Omicron毒株均有N501Y突變，但經(jīng)確認本產(chǎn)品不與gamma毒株產(chǎn)生反應。
⑤ 傳統(tǒng)毒株（VR-1986HK）：從ATCC購買的熱滅活新-型-冠-狀-病毒株
傳統(tǒng)毒株在N區(qū)中不含del31-33突變，因此Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。
對照RNA的檢測數(shù)據(jù)
使用本試劑盒測定合成Omicron菌株的對照ssRNA。
在不含N del31-33突變的對照ssRNA（Wild Type Control RNA）中，Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）更早起峰。
在含N del31-33突變的對照ssRNA（N del31-33 Mutant Type Control RNA）中，N del31-33 Mutant type Primer / Probe的擴增曲線（紅色）比Wild type Primer / Probe的擴增曲線（藍色）更早起峰。
PCR反應條件
將板置于qPCR儀板，按以下流程設定。
◆變異株一覽表
變異株 | N501Y突變 | E484K突變 | L452R突變 | E484Q突變 | del247-253 突變 | N del31-33 突變 |
傳統(tǒng)毒株 | － | － | － | － | － | － |
Alpha毒株 （B.1.1.7） | ＋ | － | － | － | － | － |
Beta毒株 （B.1.351） | ＋ | ＋ | － | － | － | － |
Gamma毒株 （P.1） | ＋ | ＋ | － | － | － | － |
Epsilon毒株（B.1.427/B.1.429） | － | － | ＋ | － | － | － |
Kappa毒株（B.1.617.1） | － | － | ＋ | ＋ | － | － |
Delta毒株 （B.1.617.2） | － | － | ＋ | － | － | － |
Lambda毒株 （C.37） | － | － | － | － | ＋ | － |
Omicron毒株（B.1.1.529） | ＋ | －※ | － | －※ | － | ＋ |
※含E484A突變
| 產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品規(guī)格 |
| 281-37703 | SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit SARS-CoV-2 N del31-33 突變檢測試劑盒 | 20 Reactions |
※ 本頁面產(chǎn)品僅供研究用，研究以外不可使用。
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