MS/MS多肽測序的優勢與局限檢測技術服務詳情介紹

多肽測序（Peptide Sequencing）技術，是指通過實驗手段確定多肽分子中氨基酸的排列順序（即一級結構）以及可能存在的翻譯后修飾（PTMs）的關鍵技術。通過該項技術，科研人員可確定多肽中氨基酸的線性順序（一級結構）；定位翻譯后修飾（PTMs），揭示蛋白功能調控機制；而 MS/MS（串聯質譜）通過選擇性母離子碎片化，MS/MS不僅提供氨基酸序列信息，還能定位翻譯后修飾（PTMs）及區分復雜樣品中的同分異構體，已成為這一領域的關鍵工具，為實現研究目的，MS/MS多肽測序的優勢與局限成為了研究重點。

一、MS/MS多肽測序技術原理概述

MS/MS多肽測序的基本原理是利用高分辨質譜技術，將dànbáizhì酶解后的多肽段離子化后進行質量檢測（MS1），隨后選定母離子（前體肽段）進行選擇性碎片化（MS2），記錄碎片離子的質量信息，推導氨基酸序列及翻譯后修飾信息。

核心步驟：

（1） 蛋白酶解：采用yídànbáiméi、Lys-C等特異性酶將dànbáizhì分解成多肽。

（2） 離子化與檢測：通過ESI（電噴霧電離）或MALDI（基質輔助）實現離子化，MS1檢測肽段質量。

（3） 選擇性碎片化（MS2）：母離子在碰撞室中通過CID（碰撞誘導解離）、HCD（高能碰撞解離）或ETD/ECD（電子轉移/俘獲解離）生成b、y離子系列。

（4） 數據解析：比對實驗碎片譜與理論肽段（數據庫搜索），或采用de novo算法直接推導序列，定位翻譯后修飾（PTMs）信息。

二、MS/MS多肽測序的優勢詳解

1、高靈敏度與分辨率

MS/MS結合高分辨質譜（Orbitrap、FTICR），可實現亞ppm級質量精度，靈敏度可探測低豐度、多修飾、多異構的肽段，顯著優于傳統PMF（肽指紋圖譜）。

2、 提供氨基酸序列與修飾定位信息

通過b、y離子系列碎片譜，直接解析肽段氨基酸排列順序。jīngzhǔn定位PTMs（如磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化），揭示功能調控機制。

3、高通量解析復雜樣品

結合LC（液相色譜），可解析血漿、組織、細胞裂解液等復雜樣品中上千種多肽，適用于蛋白zhìzǔxué和臨床標志物研究。

4、多解離模式與AI算法加持

ETD/ECD解離保留修飾信息，適用于磷酸化、糖基化等易失修飾。HCD/CID解離適用于高能碎裂和常規多肽分析。結合AI算法（如Prosit、deepNovo）及深度學習，顯著提高碎片譜解析效率和準確度。

5、支持未知蛋白與新抗原發現

通過de novo測序，無需數據庫即可推導未知蛋白或非模式物種肽段序列，適用于新抗原發現、疫苗設計、疾病標志物篩選。

三、MS/MS多肽測序的局限性剖析

1、對儀器和操作要求高

需要高分辨、高靈敏度質譜平臺（如Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X），設備投資大、操作復雜。對樣品離子化效率要求高，需嚴格控制樣品純度與處理流程。

2、數據量大、解析復雜

MS/MS碎片譜數據龐大，需zhuānyè數據庫搜索（Mascot、MaxQuant、Byonic）和算法比對。大規模數據處理需高性能計算資源和算法優化，耗時較長。

3、樣品準備與酶解挑戰

蛋白酶解效率低、肽段提取困難、鹽污染均會影響測序質量。疏水肽段（如膜蛋白）難提取、電離效率低，需優化樣品處理。

4、特殊修飾識別難度大

某些修飾（如O-糖基化）易在CID/HCD中脫落，導致修飾信息丟失。需采用ETD/ECD解離、化學標記等輔助策略。

5、同分異構體分辨能力有限

含相同氨基酸組成但不同順序的同分異構體肽段，碎片譜相似，難以區分。需結合保留時間、同位素分布和AI輔助判別。

四、MS/MS多肽測序的科研應用與前沿趨勢

1、應用領域

（1）蛋白zhìzǔxué：高通量解析蛋白表達、相互作用網絡，揭示生命過程機制。

（2）翻譯后修飾研究：定位磷酸化、乙酰化、糖基化等修飾位點，解析功能調控機制。

（3）新抗原發現：應用于腫瘤miǎnyìzhìliáo、疫苗設計、疾病標志物挖掘。

（4）臨床診斷與jīngzhǔn醫學：篩選特異性肽段，用于早篩、診斷及療效監測。

（5）生物制藥質量控制：驗證蛋白藥純度、一致性、結構完整性。

2、發展趨勢

（1）多維質譜與單細胞測序：推動從單肽到空間、單細胞層次解析。

（2）AI與深度學習輔助：提升復雜樣本肽段解析與修飾定位精度。

（3）多技術融合平臺：結合質譜成像（MSI）、原位質譜（DESI-MS），構建多維蛋白組學圖譜。

MS/MS多肽測序以其高分辨率、序列解析能力與修飾識別優勢，已成為現代蛋白zhìzǔxué與生命科學研究中bùkětìdài的核心技術。作為蛋白zhìzǔxué與多肽測序領域的lǐngxiān企業，百泰派克生物科技依托*質譜平臺（Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X、MALDI-TOF/TOF、ETD/ECD模塊）及自主研發的樣品制備與數據解析流程，提供從樣品到數據全流程多肽測序解決方案；高靈敏度檢測低豐度、多修飾肽段，提升數據質量與解析深度；多引擎與AI算法加持，提高復雜樣本的準確率和效率；zhuānyè團隊與定制化支持，為科研與企業客戶量身定制測序方案，解決從樣品制備到數據解讀全鏈路需求，繼續致力于為全球科研人員與企業客戶提供高質量、定制化的多肽測序解決方案，共同推動生命科學與生物醫藥創新發展。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上*的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白zhìzǔxué

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術*，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋蛋白zhìzǔxué、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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