SWATH-MS無標記蛋白質定量技術解析檢測技術服務詳情介紹

在后基因組時代，系統性地識別和定量dànbáizhì成為理解生物過程和疾病機制的關鍵步驟。dànbáizhì組學發展迅速，從二維凝膠電泳到高分辨率質譜技術的興起，定量策略也逐漸演化為更jīngzhǔn、可重復性更高的形式。其中，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）作為一種無標記定量方法，正成為dànbáizhì組定量分析的重要工具。

一、SWATH-MS技術概述

SWATH-MS是基于數據獨立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）的質譜方法，它將質譜分析過程劃分為一系列特定的m/z窗口，對每個窗口內的所有離子進行并行碎裂。在SWATH-MS中，質譜儀按照預設m/z區間順序掃描樣本中所有的前體離子，每個窗口內的所有離子幾乎同時被碎裂并記錄。這一策略大大提高了數據采集的全面性與重現性，使得對復雜生物樣本中dànbáizhì的全面無偏識別與定量成為可能。

二、SWATH-MS的工作原理詳解

SWATH-MS的核心流程可分為以下幾個關鍵步驟：

1、m/z窗口的劃分與采集

儀器將整個m/z范圍劃分為若干個固定寬度的窗口（例如25 m/z寬度），在質譜采集過程中，每個窗口中的所有離子被碎裂。與DDA相比，SWATH不依賴實時離子選擇，而是系統性地對所有窗口進行采集，因此被稱為無偏全掃描模式。

2、全掃描MS/MS數據的獲取

每個m/z窗口的所有前體離子碎裂產生大量MS/MS譜圖，記錄了特定時間段內的碎片離子信息。由于信息密度高且復雜，原始數據需要借助已有的光譜庫進行解析。

3、參考光譜庫進行識別與定量

SWATH-MS的dànbáizhì識別依賴于事先構建的光譜庫（通常來自DDA數據），通過匹配保留時間、碎片離子m/z和強度等特征，實現目標肽段的識別與定量。這一過程需要借助zhuānyè軟件，如OpenSWATH、Spectronaut、DIA-NN等。

三、SWATH-MS的優勢分析

1、無需標記，降低實驗成本與復雜性

SWATH-MS不依賴于iTRAQ、TMT等同位素標記策略，避免了標記效率偏差與樣本通量限制。尤其適用于臨床樣本、動物組織等不易進行標記的材料。

2、高重現性，適合大規模隊列研究

由于其基于固定掃描窗口的全覆蓋式采集，SWATH-MS在重復性方面表現優異。其跨批次、一致性強的數據特性，非常適合應用于疾病隊列研究、生物標志物篩選等需要高穩定性的場景。

3、定量動態范圍廣，識別低豐度蛋白

SWATH-MS通過對所有前體離子的全面掃描，顯著提升了低豐度蛋白的檢出率。結合高分辨質譜儀器，可以實現較廣泛的動態范圍覆蓋，有助于深入解析信號通路中關鍵但不易被檢測的蛋白因子。

4、可重分析性強，利于數據挖掘

SWATH-MS數據保留了所有碎片離子的原始信息，后期可基于新的光譜庫重復進行數據解析。這種“可重用性”在生物信息分析與數據庫建設中具有重要意義。

四、SWATH-MS在科研與轉化醫學中的應用

SWATH-MS的應用場景正在迅速擴展，涵蓋從基礎研究到臨床轉化的多個領域。

1、生物標志物發現

在腫瘤、神經退行性疾病、代謝疾病等研究中，SWATH-MS憑借其高通量和定量準確性，廣泛用于尋找疾病特異性蛋白表達模式。例如，在癌癥dànbáizhì組研究中，SWATH-MS成功鑒定出多個與復發風險相關的差異蛋白。

2、藥物作用機制研究

SWATH-MS可用于比較藥物處理前后樣本的dànbáizhì表達譜，幫助揭示藥物作用靶點及信號通路變化。其高重現性的特點特別適合劑量梯度與時間梯度實驗設計。

3、跨物種蛋白表達比較

在模式生物（如小鼠、斑馬魚）與人類組織的dànbáizhì表達譜對比中，SWATH-MS提供了穩定而全面的數據支持，為功能保守性研究提供重要線索。

4、多組學集成分析

SWATH-MS可與轉錄組、代謝組數據協同分析，構建多層次調控網絡。例如在免疫研究中，通過整合dànbáizhì組與轉錄組信息，可以發現炎癥反應中蛋白翻譯后修飾的關鍵節點。

SWATH-MS作為無標記、數據獨立采集的dànbáizhì定量技術，已逐步發展為dànbáizhì組學研究的中堅力量。在科研需求日益精細化的當下，SWATH-MS不僅是技術選擇，更是驅動科學發現與臨床轉化的引擎。歡迎關注百泰派克生物科技。我們致力于提供高質量、高覆蓋率的SWATH定量蛋白組學服務，為您的科學研究注入新動力。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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