簡介

廣譜微生物及耐藥分析系統(tǒng)，是由杭州柏熠科技有限公司開發(fā)的一款面向于微生物病原檢測一線工作人員的一鍵式易操作圖形界面分析系統(tǒng)。本分析系統(tǒng)同時支持Nanopore、Illumina、MGI、Ion torrent以及Pacbio等主流三代、二代高通量測序數(shù)據(jù)輸入，可實(shí)現(xiàn)快速簡單分析，系統(tǒng)提供微生物物種組成及豐度信息鑒定、病原知識庫信息注釋及中文說明、目標(biāo)物種測序數(shù)據(jù)提取、組裝與溯源、耐藥與毒力等分析功能，同時內(nèi)置超過40000種基因組數(shù)據(jù)及對應(yīng)病原注釋信息，幫助用戶進(jìn)行本地化病原微生物分析。

功能介紹

廣譜微生物及耐藥分析系統(tǒng)同時支持Nanopore、Pacbio等三代測序數(shù)據(jù)和Illumina、MGI、Ion torrent等二代測序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析，具體功能如下：
1.支持用戶樣本臨床信息批量上傳和管理。
2.支持 fast5、fastq 、Pod5及fastq.gz等多種格式的測序數(shù)據(jù)。
3.支持混樣Nanopore測序數(shù)據(jù)拆分分析。
4.支持同一任務(wù)多個樣本同時分析。
5.支持從下機(jī)數(shù)據(jù)上傳到輸出結(jié)果報告一鍵式操作。
6.支持一鍵式生成 PDF 格式分析報告。
7.分析系統(tǒng)分析結(jié)果包含：物種分類、序列數(shù)統(tǒng)計、病原微生物注釋、目標(biāo)物種測序數(shù)據(jù)提取、耐藥元件分析（新建任務(wù)時可選，包含基因組覆蓋度、支持序列數(shù)、序列一致性、耐藥機(jī)理、對應(yīng)藥物、物種信息等）、毒力因子分析（新建任務(wù)時可選，包含基因組覆蓋度、支持序列數(shù)、序列一致性、毒力元件分析、致病機(jī)理、對應(yīng)物種信息等）。
8.支持分析數(shù)據(jù)及結(jié)果下載、圖表輸出、病例信息關(guān)聯(lián)等。
9.系統(tǒng)內(nèi)置微生物數(shù)據(jù)庫支持超過 40000 條物種信息條目。
10.分析系統(tǒng)能夠提供國家認(rèn)可的計算機(jī)軟件著作權(quán)登記證書或其他知識產(chǎn)權(quán)證明。