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BS-Assem001 微生物基因組組裝及注釋分析系統(tǒng)

具體成交價(jià)以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 公司名稱 杭州柏熠科技有限公司
  • 品牌 其他品牌
  • 型號(hào) BS-Assem001
  • 產(chǎn)地 浙江省杭州市濱江區(qū)濱安路688號(hào)天和高科技產(chǎn)業(yè)園2E幢1單元654室
  • 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)廠家
  • 更新時(shí)間 2023/9/8 14:46:25
  • 訪問(wèn)次數(shù) 1027
產(chǎn)品標(biāo)簽

基因組組裝注釋分析軟件微生物

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杭州柏熠科技有限公司成立于2020年,是一家基于測(cè)序技術(shù)進(jìn)行自動(dòng)化設(shè)備、智能分析系統(tǒng)、配套試劑研發(fā)以及轉(zhuǎn)化的高新技術(shù)企業(yè),為用戶提供全自動(dòng)智能化整體解決方案。

多年的潛心研發(fā)和應(yīng)用實(shí)踐,公司成功開(kāi)發(fā)上市產(chǎn)品超40余款,其中包括多款自動(dòng)化工作站設(shè)備、分析軟件、各類測(cè)序前處理試劑盒等,產(chǎn)品通過(guò)ISO9001&1SO13485雙質(zhì)量管理體系認(rèn)證。

柏熠科技持續(xù)創(chuàng)新,不斷加強(qiáng)研發(fā)投入,成功申報(bào)浙江省科技廳“尖兵”、“領(lǐng)雁”項(xiàng)目以及“上海市科技創(chuàng)新計(jì)劃”項(xiàng)目。柏熠科技深耕測(cè)序技術(shù)領(lǐng)域,潛心研究、篤行不怠,致力于讓測(cè)序技術(shù)進(jìn)入每個(gè)生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室。





微生物測(cè)序試劑盒,生信分析軟件,高通量測(cè)序自動(dòng)化建庫(kù)儀

應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,環(huán)保,食品/農(nóng)產(chǎn)品,生物產(chǎn)業(yè),制藥/生物制藥

簡(jiǎn)介

微生物基因組組裝及注釋分析系統(tǒng),是由杭州柏熠科技有限公司開(kāi)發(fā)的一款提供圖形操作界面的測(cè)序數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。組裝模塊的提供可以更好的對(duì)測(cè)序的物種信息進(jìn)行評(píng)估,相較于傳統(tǒng)微生物培養(yǎng)和熒光定量PCR技術(shù),全基因測(cè)序技術(shù)能夠高效獲得物種基因組信息、變異信息、物種差異等,克服檢測(cè)周期長(zhǎng)、操作繁瑣、通量低等問(wèn)題。本系統(tǒng)兼容三代Nanopore和二代原始測(cè)序數(shù)據(jù),可實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)快速分析,提供三代有參組裝、無(wú)參組裝、混合組裝、二代單雙端組裝模式。可以使用戶快速得到組裝結(jié)果、覆蓋度、統(tǒng)計(jì)信息、耐藥和毒力分析、基因注釋、MLST等結(jié)果。本系統(tǒng)提供從下機(jī)數(shù)據(jù)到結(jié)果報(bào)告一鍵式操作,與常規(guī)linux shell命令行調(diào)用多種程序測(cè)序數(shù)據(jù)分析相比,解決了操作難度大、分析可視化復(fù)雜等問(wèn)題。通過(guò)高度優(yōu)化的集成分析流程與完善的數(shù)據(jù)庫(kù),最終實(shí)現(xiàn)一鍵式圖形界面分析,分析時(shí)間可縮短至10分鐘內(nèi)。


功能介紹

本系統(tǒng)同時(shí)支持Nanopore、Pacbio等三代測(cè)序數(shù)據(jù)和Illumina、MGI、Ion Torrent等二代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,具體功能如下:
1.支持主流二代和三代測(cè)序下機(jī)數(shù)據(jù)的分析;
2.提供從下機(jī)數(shù)據(jù)到分析結(jié)果一鍵式操作;
3.支持多個(gè)主流組裝軟件選擇,提供無(wú)參,有參和混合組裝三種組裝方式;
4.支持多樣本和不同格式數(shù)據(jù)輸入;
5.提供樣本全基因組的覆蓋度圖和組裝完成的一致性序列;
6.有參組裝提供變異分析;
7.支持基因組組裝結(jié)果注釋,提供gff,gbk等注釋文件;
8.提供耐藥元件鑒定、耐藥機(jī)理和耐藥藥物鑒定等分析;
9.提供毒力元件鑒定、毒力機(jī)理等分析;
10.支持MLST分析;
11.可輸入樣本的具體信息,包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息;
12.提供結(jié)果數(shù)據(jù)做圖、統(tǒng)計(jì)功能以及圖表輸出功能;
13.提供樣本管理系統(tǒng),支持輸入樣本的具體信息,包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息,支持樣本信息和數(shù)據(jù)分析管理關(guān)聯(lián)等;
14.支持一鍵輸出可打印的分析報(bào)告,支持圖形和表格等結(jié)果的下載和輸出;
15.分析系統(tǒng)能夠提供國(guó)家認(rèn)可的計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)登記證書(shū)或其他知識(shí)產(chǎn)權(quán)證明。

 



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