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超20萬個計算模型 打造全球最大數(shù)字微生物寶庫！
2025年02月19日 10:47:38
來源：化工儀器網(wǎng) 點擊量：4289
全球最大的數(shù)字微生物庫——“阿波羅”包含了247092個計算模型，其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計算模型。
來自愛爾蘭、法國和意大利的科研人員合作，共同創(chuàng)建了全球規(guī)模最大的數(shù)字微生物數(shù)據(jù)庫——“阿波羅”(APOLLO)。該數(shù)據(jù)庫包含了247092個計算模型，其中包括迄今為止最為完整的人體微生物組計算模型。
研究團(tuán)隊主要關(guān)注了細(xì)菌微生物組，即存在于人體內(nèi)外的細(xì)菌群落。他們根據(jù)實際樣本，構(gòu)建了14451個微生物群落的計算模型，每個模型都展示了這些群落內(nèi)不同微生物的代謝過程如何因身體部位、年齡和健康狀況的不同而發(fā)生變化。
這些計算模型涵蓋了身體的不同部位，跨越了不同的年齡段，是迄今為止最為全面的人類微生物組計算模型集合。“阿波羅”項目還預(yù)測了與克羅恩病、帕金森病和兒童營養(yǎng)不良相關(guān)的關(guān)鍵代謝物，為開發(fā)新的診斷和治療方法提供了寶貴的線索。
研究團(tuán)隊表示，這一數(shù)據(jù)庫將成為科學(xué)家探索微生物在人體內(nèi)功能、微生物與健康和疾病相互作用的新利器，降低對繁瑣的活體生物實驗的依賴。
這一成就源自團(tuán)隊長達(dá)十年的專業(yè)積累，從最初涉及數(shù)百種微生物的“腸道微生物代謝重建與分析”(AGORA)項目，到后續(xù)擴(kuò)展至數(shù)千種微生物的AGORA2，直至今日的“阿波羅”項目。
研究團(tuán)隊指出，借助“阿波羅”系統(tǒng)，科學(xué)家能夠通過識別微生物代謝標(biāo)志物來開發(fā)非侵入性的診斷工具，從而實現(xiàn)更早且更準(zhǔn)確的疾病診斷。這些模擬實驗不僅能預(yù)測個體的微生物組與飲食、藥物和健康狀況之間的相互作用，還能為精準(zhǔn)醫(yī)療提供依據(jù)，例如定制化的益生菌、益生元以及基于微生物組的個性化療法。這將有助于每個人更好地管理腸道健康，并針對特定疾病進(jìn)行更有效的治療。
此項技術(shù)進(jìn)步無疑為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域帶來了新的希望，尤其是對于那些依賴于早期診斷和個性化治療方案的慢性疾病患者而言。同時，這也提示我們未來醫(yī)療的發(fā)展方向可能更加注重個體化和精準(zhǔn)化，以期達(dá)到更好的治療效果。相關(guān)論文發(fā)表于最新一期《細(xì)胞系統(tǒng)》雜志。
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