酶免疫試驗(yàn)之所以能成為臨床免疫檢驗(yàn)中的主導(dǎo)技術(shù)，是與它的方法上的特異性和靈敏性、操作上的簡(jiǎn)便性以及試劑的穩(wěn)定性分不開的，還有很重要的一點(diǎn)是，其對(duì)環(huán)境沒有污染威脅。
   盡管如此，作為一項(xiàng)免疫檢驗(yàn)技術(shù)，酶免疫試驗(yàn)還是有其局限性的，不但所檢測(cè)的生物學(xué)體液樣本如血清中有可能存在各種干擾實(shí)驗(yàn)的因素，而且在實(shí)驗(yàn)過程中，影響結(jié)果的因素也很多，尤其是進(jìn)行手工的ELISA測(cè)定時(shí)。
  此外，在定性ELISA測(cè)定中，陽(yáng)性判定值（CUT-OFF）的建立，是在一定的統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)上的，相對(duì)于某個(gè)具體的受檢者來說，其有可能并不具備正確性。例如，使用ELISA方法檢測(cè)抗HCV及抗HIV或HBsAg，有時(shí)候，檢測(cè)所得的陽(yáng)性結(jié)也許并不是真正的陽(yáng)性，而需要使用其他方法如重組免疫印跡（recombinant immunoblot as—say，RIBA）、蛋白印跡（Westernbl。t，WB）或中和試驗(yàn)來確認(rèn)，才能報(bào)告陽(yáng)性。這里抗HCV和抗HIV的檢測(cè)均使用病毒部分的基因工程抗原，其他一些病毒如流感病毒、腮腺炎病毒和水痘病毒等感染人體后，亦或一些自身抗體，也有可能會(huì)導(dǎo)致假陽(yáng)性反應(yīng)。