超凈臺使用壽命的長短與空氣的潔凈程度有關。 在溫帶地區超凈臺可在一般實驗室使用，然而在熱帶或亞熱帶地區，由于大氣中含有高量的花粉，或多粉塵的地區，超凈臺則宜放在較好的有雙道門的室內使用。
        任何情況下都不應將超凈臺的進風罩對著開敞的門或窗，以免影響濾清器的使用壽命。 調整各腳的高度，以保證穩妥和操作面的水平。
超凈工作臺的供電應采用一條專門電路，以避免電路過載造成空氣流速的改變。 檢查紫外線殺菌燈、照明用日光燈和鼓風機提供空氣流動的動力。 空氣濾板及其密封性：采用營養瓊脂平板法。
        每次使用超凈工作臺時，實驗人員應先開啟超凈工作臺上的紫外燈，紫外照射20分鐘后使用。
        開啟超凈工作臺工作電源，關閉紫外燈，并用75％的酒精或0.5％過氧乙酸噴灑擦拭消毒工作臺面。
        接種室內力求簡潔，凡與本室工作無直接關系的物品一律不能放入，以利保持無菌狀態。 整個實驗過程中，實驗人員應按照無菌操作規程操作。
        實驗結束后，用消毒液擦拭工作臺面，關閉工作電源，重新開啟紫外燈照射15分鐘。 首先要保持室內的干燥和清潔，潮濕的空氣既會使制造材料銹蝕，還會影響電氣電路的正常工作，潮濕空氣還利于細菌、霉菌的生長。清潔的環境還可延長濾板的使用壽命。 另外，定期對設備的清潔是正常使用的重要環節。清潔應包括使用前后的例行清潔和定期的熏蒸處理。熏蒸時，應將所有縫隙*密封。清潔應包括使用前后的例行清潔和定期的熏蒸處理。熏蒸時，應將所有縫隙*密封，如操作口設有可移動擋板封蓋的類型超凈工作臺，可用塑料薄膜密封。超凈工作臺的濾板和紫外殺菌燈都有標定的使用年限，應按期更換。 無菌室應定期用70%酒精或0.5%苯酚噴霧降塵和消毒，用2%新潔爾滅抹拭臺面和用具（70%酒精也可），用福爾馬林（40%甲醛）加少量高錳酸鉀定期密閉熏蒸，配合紫外線滅菌燈（每次開啟15分鐘以上）等等消毒滅菌手段，以使無菌室經常保持高度的無菌狀態。