雖然一個長時間運行的干細胞研究慘敗，但日本理化學研究所(RIKEN)另一個調查委員會近日在東京發布了新報告。報告稱，所謂的刺激觸發采集功能(STAP)干細胞以及可能衍生自這些細胞的嵌合體小鼠和畸胎瘤，“都來源于受污染的(胚胎干)細胞培養，這個真相駁斥了兩篇論文的主要結論”。1月29日，這兩篇論文在線發表于《自然》雜志。

該委員會斷定，3個假設的STAP干細胞系實際可能是3個預先存在的胚胎干(ES)細胞系。報告總結道：“不可能是被3種不同的ES細胞意外污染，人們懷疑污染是人為造成的。”但該委員會并沒有發現人為污染的決定性證據，或者誰是責任人。“因此，我們無法推斷是否存在學術不端行為。”

但該委員會發現，論文的兩張圖片確實存在偽造等不端行為，它們并沒有實驗數據支撐。該委員會認為兩篇論文的*作者小保方晴子應為偽造負主要責任。

12月19日，另一個調查小組宣布，即便在小保方晴子的幫助下也未能重復STAP干細胞研究。同一天，小保方晴子從神戶RIKEN發育生物學中心(CDB)辭職。

論文丑聞曝出后不久，RIKEN發起了一項調查，并在4月份總結稱小保方晴子涉及科研不端行為。《自然》在7月份撤銷了這兩篇論文。但小保方晴子等人依然堅持STAP細胞的真實性。之后，RIKEN決定依照論文中描述的方法重新進行試驗。在中期報告中，調查小組報告未能制作出STAP細胞。同時，該小組邀請小保方晴子參與實驗，以驗證實驗技術是否有細節未出現在發表論文中。

在指責小保方晴子存在學術不端行為的同時，該委員會認為兩位研究員負有監管松懈的責任。一位是小保方晴子工作的實驗室主任Teruhiko Wakayama;另一位是在論文撰寫中發揮重要作用的Yoshiki Sasai。現供職于山梨大學的Wakayama之前也承認他將因此次丑聞接受紀律處分，而Sasai則在今年8月份自殺身亡。另外，CDB也將被重組。