(1)平衡時的轉速和工作轉速不一致、造成平衡精度下降。例如：有不少轉子屬于二階臨界轉速的擾性轉子，由于平衡機本身轉速有限，這些轉子若是采用工藝平衡，那么是無法有效的防止轉子在高速下發生變形而造成的不平衡。
 

　　(2)平衡機(特別是高速立式平衡機)價格昂貴。
 

　　(3)在動平衡機上平衡好的轉子，裝機后其平衡精度難以保證。因為動平衡時的支承條件不同于轉子在實際工作條件下的支承條件，且轉子同平衡裝置之間的配合也不同于轉子與其自身轉軸之間的配合條件，即使出廠前已在動平衡機上達到高精度平衡的轉子，經過運輸、再裝配等過程，平衡精度在使用前難免有所下降，當處于工作轉速下運轉時，仍然可能產生不允許的振動情況。
 

　　(4)有些轉子由于會受到尺寸和重量上的限制，很難甚至無法在平衡機上平衡。例如：對于大型發電機及透平一類的特大轉子，由于沒有相應的特大平衡裝置，那么往往會造成無法平衡；而對于大型的高溫汽輪機轉子，一般是易發生彈性熱翹曲，并且停機后會自動進行消失，這類轉子需要進行熱動態平衡，這用平衡機顯然是無法平衡的。
 

　　(5) 轉子要拆下來才能進行動平衡，停機時間長、平衡速度慢、經濟損失大。