生化培養箱是生物體從環境中取得物質，轉化為體內新的物質的過程，也叫同化作用；后者是生物體內的原有物質轉化為環境中的物質，也叫異化作用。
同化和異化的過程都由一系列中間步驟組成。中間代謝就是研究其中的化學途徑的。如糖元、脂肪和蛋白質的異化是各自通過不同的途徑分解成葡萄糖、脂肪酸和氨基酸，然后再氧化生成乙酰輔酶A，進入三羧酸循環，zui后生成二氧化碳。

    在物質代謝的過程中還伴隨有能量的變化。由于結構分析技術的進展，使人們能在分子水平上深入研究它們的各種功能。酶的催化原理的研究是這方面突出的例子。生化培養箱結構域是個較緊密的具有特殊功能的區域，連結各結構域之間的肽鏈有一定的活動余地，允許各結構域之間有某種程度的相對運動。蛋白質的側鏈更是*不在快速運動之中。蛋白質分子內部的運動性是它們執行各種功能的重要基礎。