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士鋒生物SDS-PAGE檢測外源蛋白的表達實驗步驟

來源:上海士鋒生物科技有限公司   2013年09月11日 07:17  

 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS—PAGE)是蛋白分析中zui經常使用的一種方法。它是將蛋白樣品同離子型去垢劑十二烷基硫酸鈉(SDS)以及巰基乙醇一起加熱,使蛋白變性,多肽鏈內部的和肽鏈之間的二硫鍵被還原,肽鏈被打開。打開的肽鏈靠疏水作用與SDS結合而帶負電荷,電泳時在電場作用下,肽鏈在凝膠中向正極遷移。不同的大小的肽鏈由于在遷移時受到的阻力不同,在遷移過程中逐漸分開,其相對遷移率與分子量的對數間成線形關系。

pGLO是將綠色熒光蛋白(GFP)的基因克隆在阿拉伯糖啟動子之后的一種表達載體。攜帶有pGLO的大腸桿菌在含有相應誘導物和抗菌素的條件下培養,可以表達GFP,這比不加誘導物的同樣的大腸桿菌在SDS—PAGE凝膠上要多出一條明顯的條帶。表達的蛋白也可用非變性的聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,紫光燈下可以看到誘導后的樣品在凝膠上有綠色熒光條帶出現。還可以通過免疫印跡染色(Western—blotting)的方法,用GFP的抗體檢測表達的外源蛋白。

[儀器、材料和試劑]

儀器

1.垂直板電泳槽及配套的玻璃板,梳子

2.電泳儀

3.干式恒溫培養器

4.微波爐

材料

1. pGLO表達質粒轉化的大腸桿菌的培養物:用阿拉伯糖誘導的和沒有加阿拉伯糖誘導的

試劑

1.1.5mo1/L Tris-HCl pH 8.8 (已加SDS )

2.0.5mo1/L Tris-HCl pH 6.8 (已加SDS)

3.10%SDS

4.30%Acr/Bis 29.2g Acr + 0.8gBis,用雙蒸水定容至100mL,過濾備用,4存放。

5.10%Ap (-20存放

6.2x樣品緩沖液

0.5mo1/L Tris-HCl pH6.8 2mL

甘油 2mL

20%SDS 2mL

0.1%溴酚藍 0.5mL

2—?—巰基乙醇 l.0mL

雙蒸水 2.5mL

7.5x電極緩沖液

Tris 7.5g

G1y 36 g

SDS 2.5g

雙蒸水溶解,定容至500mL,使用時稀釋5倍使用

8.染色液:0.2g考馬斯亮藍R250 + 84mL 95%乙醇 + 20mL冰醋酸,定容至200mL,過濾備用。

9.脫色液: 酒精:冰醋酸:水=7.57.585

[實驗步驟]

1.裝配做膠用的玻璃板"三明治":做1.0mm厚的膠。選擇兩側的玻璃夾條為1mm的玻璃板,將其夾條面朝上平放在桌面上,把灰色的U形硅膠夾條在上面擺好,然后把帶兩個耳朵的凹玻璃放在上面,使U形硅膠夾條平整、服帖地夾在兩塊玻璃板之間。小心地把這玻璃板三明治放到提籃架子上,用塑料的楔子夾緊,注意底部的U形硅膠夾條在夾緊的過程中依然保持平整、服帖。在玻璃板三明治的夾縫加滿蒸餾水,檢驗是否漏,如果漏水必須重裝。

2.配制濃度為12%的分離膠凝膠濃度應根據被分離蛋白的分子量進行選擇,配方如下:

雙蒸水 3.3 mL

1.5mo1/L Tris-HCl (pH 8.8) 2.5 mL

Acr/Big(30%) 4.0 mL

10% SDS 100 μL

TEMED 10 μL

10%AP 100 μL

總體積 10 mL (剛好灌制兩塊膠

混勻后加入兩玻璃夾縫中,并小心在膠面上加入1cm蒸餾水在膠面上加蒸餾水稱水封,目的是保持膠面平整,并防止膠與空氣接觸,影響膠的聚合,室溫放置,等膠自然凝聚后此時在膠面與水封之間可見清晰的界限,將水封傾去。這時可以開始配制4%的濃縮膠,配方如下:

雙蒸水 1.8 mL

0.5mo1/L Tris-HCl pH 6.8 0.75mL

Acr/Bis (30%) 0.4 mL

10% SDS 30 μL

TEMED 5μL

10%Ap 30μL

總體積 3.0 mL (夠做兩塊板的濃縮膠

混勻后加入到"三明治"玻璃板的夾縫中,然后在把1mm的梳子插進濃縮膠中,注意在梳子和濃縮膠之間不要留有氣泡。如果發現有較大的氣泡,一定要想法去掉可以插拔梳子或指彈氣泡處的玻璃等,否則會影響電泳結果。待濃縮膠凝固后,小心拔出梳子。如果發現拔出梳子后形成的加樣孔之間的間隔發生扭曲,用注射器的針頭小心加以整理,使之齊整。

3.細菌培養物SDS-PAGE樣品的制作:同時做L-阿拉伯糖誘導的和未加L-阿拉伯糖的兩個大腸桿菌樣。取細菌培養物1.5mL加到1.5mL小離心管中,12000r/m離心3分鐘,去上清。在離心沉淀中加約等體積的蒸餾水,用槍頭小心地吹打,使細菌充分懸浮,直到沒有明顯的小團塊,然后加入等體積的樣品緩沖液,在100沸水浴或干式培養器中保溫5min。此時如用槍頭吸取樣品,會發現非常粘稠,呈鼻涕狀,這是因為有樣品中含有大量DNA的結果。要用胰島素注射器將樣品從極細的針頭中打出,反復多次才能將DNA分子打斷,使樣品變得不再粘稠為止。將樣品14000r/m離心5分鐘,使不溶物沉淀下來,小心吸取上清加樣。電泳樣品的處理直接關系到電泳結果的好壞,一定要認真做樣,否則跑不出好膠來。

4.瓊脂封底:做好膠后,把玻璃板三明治從架子中取出,將兩玻璃板之間的硅膠夾條去掉。去掉夾條后在凝膠的底部會留下一空隙,此空隙要用2%融化的瓊脂填滿,否則在玻璃板浸到電極緩沖液后空隙中的空氣將很難*排除掉,電泳時會明顯影響導電,嚴重時會使整個電泳失敗。瓊脂封底時注意不要產生氣泡。

5.電泳槽組裝:封底后將玻璃板三明治凹玻璃面向內重新裝到提籃架子上,固定好后,將整個部件放到電泳槽的外殼中,然后加電極緩沖液。加液時要使內外槽中的液面基本等高,內槽液的液面要高出玻璃板三明治的凹玻璃至少5mm,以保證能夠導電,且電場均勻。

6.加樣:按事先設計好的順序與加樣量依次加樣。在樣品的濃度未知的情況下,同一樣品可加一梯度,即每一泳道的加樣量依次減半。這樣,在做第二次電泳時可以其作為參考,正確加樣。蛋白分子量標準可以加在靠中間的加樣孔中,也可加在離邊的第2道處zui靠邊的一道樣品往往會明顯跑斜。

7.電泳:將電泳槽的蓋子蓋上,把電泳槽的兩個電極接到電泳儀上注意電極不要接錯,然后接通電源。先將電壓調到80V,當樣品進入分離膠時,調節電壓使恒定在150V。當溴酚藍移動到離底部約0.5cm時,關掉電源,停止電泳。將玻璃板從電泳槽中取出,小心地用舊的卡撬開兩玻璃板,暴露出膠面。將濃縮膠部分去掉不要,分離膠放到塑料盒中染色。

8.染色和脫色:凝膠在考馬斯亮藍染色液中染色20分鐘搖床上緩慢振蕩,然后傾去染色液染色液回收,可反復用數十次,用自來水洗幾下,去掉凝膠上和塑料盒中的染色殘液,加脫色液脫色搖床上緩慢振蕩,1小時后換一次脫色液,振蕩脫色。*脫色后的凝膠蛋白條帶清晰,背景透明干凈。這時可以將凝膠拍照或用掃描儀進行掃描,作為*記錄。

 

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