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siRNA轉(zhuǎn)染標(biāo)準(zhǔn)操作流程

來(lái)源:北京百奧創(chuàng)新科技有限公司   2025年07月16日 11:34  

以下是經(jīng)過(guò)優(yōu)化的 siRNA轉(zhuǎn)染標(biāo)準(zhǔn)操作流程,整合了關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化與避坑指南,適用于絕大多數(shù)哺乳動(dòng)物細(xì)胞系(貼壁/懸浮),分為 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、操作步驟、質(zhì)控要點(diǎn)三部分:

一、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)關(guān)鍵點(diǎn)(轉(zhuǎn)染前必看)

要素

推薦方案

避坑提示

siRNA濃度

終濃度10-50nM(預(yù)實(shí)驗(yàn)梯度測(cè)試)

100nM易致脫靶效應(yīng)

細(xì)胞密度

貼壁細(xì)胞:30-50%匯合度
懸浮細(xì)胞:2-5×10?/mL

過(guò)密毒性;過(guò)低效率

轉(zhuǎn)染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
jetPRIME®(原代/難轉(zhuǎn)細(xì)胞)

避免含血清培養(yǎng)基稀釋試劑

對(duì)照設(shè)置

- 陰性對(duì)照:Scrambled siRNA
- 陽(yáng)性對(duì)照:GAPDH siRNA
- 空白對(duì)照:僅轉(zhuǎn)染試劑

缺一不可!












二、標(biāo)準(zhǔn)操作流程(以24孔板為例)

 Day 0:細(xì)胞鋪板

1. 消化細(xì)胞 用wanquan培養(yǎng)基 調(diào)整密度 每孔接種 0.5mL(貼壁細(xì)胞數(shù):5-8×10?;懸浮細(xì)胞數(shù):2×10?)  

2. 37℃培養(yǎng)箱放置 16-24h(目標(biāo):轉(zhuǎn)染時(shí)匯合度≈40%)  

關(guān)鍵細(xì)節(jié):  

- siRNA工作液濃度 = 儲(chǔ)存濃度×30(例:20μM儲(chǔ)存液工作液終濃度≈33nM)  

- 轉(zhuǎn)染試劑用量參考說(shuō)明書(shū)(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)  

 Day 2:換液與檢測(cè)  

1. 轉(zhuǎn)染后 6h 更換wanquan培養(yǎng)基(高毒性細(xì)胞如原代神經(jīng)元需4h內(nèi)換液)  

2. 繼續(xù)培養(yǎng) 24-72h(基因沉默峰值時(shí)間需預(yù)實(shí)驗(yàn)確定)  

 三、質(zhì)控關(guān)鍵步驟(決定成敗!)

 1. 轉(zhuǎn)染效率驗(yàn)證(必做)

- 方案1:轉(zhuǎn)染 FAM標(biāo)記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)  

- 方案2:共轉(zhuǎn)染 EGFP質(zhì)粒 計(jì)算綠色細(xì)胞占比(成本低但間接)  

 2. 沉默效果檢測(cè)

 3. 細(xì)胞毒性評(píng)估

- MTT法:轉(zhuǎn)染后24h檢測(cè),存活率應(yīng)>85%  

- 形態(tài)觀察:懸浮細(xì)胞聚團(tuán)、貼壁細(xì)胞空泡化提示毒性過(guò)強(qiáng)  

 四、高頻問(wèn)題解決方案

問(wèn)題

原因

優(yōu)化方案

效率低

siRNA降解/試劑失效

新解凍siRNA;更換轉(zhuǎn)染試劑批次

細(xì)胞死亡率高

復(fù)合物局部濃度過(guò)高

轉(zhuǎn)染前混勻培養(yǎng)基;懸浮細(xì)胞用旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)法

沉默效果不穩(wěn)定

基因半衰期長(zhǎng)

延長(zhǎng)檢測(cè)至72h;轉(zhuǎn)染兩次(間隔24h

脫靶效應(yīng)

siRNA種子區(qū)匹配非靶基因

更換siRNA序列;使用化學(xué)修飾siRNA(如Stealth™

五、特殊細(xì)胞優(yōu)化方案

1. 原代細(xì)胞:  

   - 轉(zhuǎn)染試劑:選 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

   - 方案:轉(zhuǎn)染前饑餓處理2h(無(wú)血清培養(yǎng)基)復(fù)合物孵育時(shí)間縮短至5min  

2. 懸浮細(xì)胞:  

   - 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

   - 步驟:離心收集細(xì)胞 重懸于復(fù)合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)  

3. 難轉(zhuǎn)細(xì)胞(如神經(jīng)元):  

   - 專(zhuān)用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)  

   - 轉(zhuǎn)染后不換液 直接補(bǔ)等體積wanquan培養(yǎng)基  

六、試劑耗材推薦表

類(lèi)型

推薦產(chǎn)品

適用場(chǎng)景

通用轉(zhuǎn)染試劑

Lipofectamine™ RNAiMAX

293T/HeLa等常見(jiàn)細(xì)胞

難轉(zhuǎn)細(xì)胞試劑

jetPRIME®

原代/干細(xì)胞/懸浮細(xì)胞

陽(yáng)性對(duì)照siRNA

Silencer™ GAPDH siRNA

體系驗(yàn)證

陰性對(duì)照

AllStars Neg. siRNA

排除非特異效應(yīng)

> 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn):合格實(shí)驗(yàn)需滿(mǎn)足——轉(zhuǎn)染效率>80% + 沉默效率>70% + 細(xì)胞存活>85%

避雷總結(jié):  

1. 勿用含抗生素或血清的培養(yǎng)基稀釋復(fù)合物(滅活試劑)  

2. 轉(zhuǎn)染后換液時(shí)間寧早勿晚(超8h毒性飆升)  

3. 凍存siRNA避免反復(fù)凍融>3次(分裝儲(chǔ)存-80℃)  

按照此流程操作,可穩(wěn)定獲得可重復(fù)的基因沉默數(shù)據(jù)!

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