輔助生殖行業背景
我國不孕及不育率逐年攀升,根據《柳葉刀中國婦幼健康特邀 重大報告》預測數據,2023年我國不孕率18.2% ,預計2025年將接近20%。不孕及不育率的快速上升意味著輔助生殖服務潛在需求人數 增長,從而驅動輔助生殖市場擴容。輔助生殖(ART)由三種手段組成:人工授精、配子移植技術、體外受精-胚胎移植(IVF-EF)。其中體外受精-胚胎移植即試管嬰兒,是指將不孕夫婦的卵子和精子通過人工方式取出,在體外培育受精并完成早期胚胎發育后,再移植回母體子宮內實現妊娠。
圖1.輔助生殖診療過程(來源:艾瑞咨詢)
輔助生殖技術:從“盲選”到“優選”的生育革命
中國每年新增出生缺陷兒約90萬例,其中單基因遺傳病占比高達22.2%。隨著基因檢測技術的突破,PGT(胚胎植入前遺傳學檢測)技術為這些家庭提供了從源頭阻斷遺傳病的新選擇。迄今為止,全球已經有數萬例家庭通過試管技術助孕,順利圓夢→獲得健康寶寶!誠然一個個試管寶貝的誕生也見證了輔助生殖技術從無到有,從有到優的過程;該技術的不斷更新升級更幫助人們有效解決“生不出”難題,且致力于化解“生不好”的困擾。
什么是第三代試管嬰兒PGS和PGD技術?
第三代試管嬰兒即胚胎植入前遺傳學篩查診斷技術(PGS/PGD),主要是對胚胎的遺傳物質進行檢測。PGS即胚胎植入前遺傳學篩查,是對胚胎的染色體數目和結構進行檢測,分析對比是否有重復、缺失或易位等異常情況;PGD即胚胎植入前遺傳學診斷,是對染色體上的基因進行檢測,診斷胚胎有沒有攜帶導致某種特定疾病的基因突變。
根據世界衛生組織的定義,PGD\PGS有了新的命名,統一稱PGT,包括PGT-A,PGT-M,PGT-SR;PGT技術通過在體外受精后對胚胎進行基因檢測,篩選出無遺傳缺陷的胚胎進行移植,將遺傳病防控從產前診斷提前至胚胎階段。這一技術被譽為“第三代試管嬰兒”。
圖2.PGT的工作流程
PGT 的分類
表1.PGT的分類
分類 | 定義 | 臨床意義 | |
PGT(Preimplantation Genetic Testing)胚胎植入前遺傳學檢測 | PGT-A(PGT for Aneuploidies) | 胚胎植入前染色體非整倍體檢測 | 檢測胚胎染色體是否存在非整倍體現象,目的在于提高胚胎活產率,降低不良妊娠率,以及預防染色體數目異常,相當于原有的PGS技術。 |
PGT-M(PGT for Monogenic/Signle gene) | 胚胎植入前單基因遺傳病檢測 | 檢測胚胎是否攜帶某些可導致單基因疾病的突變基因,目的在于靶向阻斷單基因遺傳疾病,相當于原有的PGD技術中的一部分。 | |
PGT-SR(PGT for Chromosomal Structural Rearrangement) | 胚胎植入前染色體結構異常檢測 | 檢測胚胎是否存在倒位、平衡易位和羅氏易位等染色體結構異常問題,目的是阻斷染色體結構異常的遺傳,相當于原有PGD技術中檢測胚胎染色體結構異常的部分。 |
PGT-A
利用單細胞擴增技術和NGS技術對輔助生殖過程中體外培養的卵裂期或囊胚期胚胎進行檢測,既單細胞測序全基因組擴增(WGA),該技術可檢測全部的23對染色體非整倍體、≥4Mb的染色體片段缺失和重復、≥10Mb且比例≥30%的嵌合和夫婦一方或雙方已知1-4 Mb遺傳型CNVs。測序數據量1-2 M左右。
目前存在的主要三種擴增方法有:簡并寡核苷酸引物PCR擴增(DOP-PCR)、多重置換擴增(MDA)、多次退火環狀循環擴增(MALBAC),三種方法各有優缺點。
表2.單細胞擴增技術的三種方法對比
原理 | 優點 | 缺點 | |
DOP-PCR | 用隨機引物進行指數擴增 | MALBAC和DOP-PCR相比于MDA,覆蓋的均一度更好,從而對檢測大于1Mb的拷貝數變異(CNVs)的靈敏度和特異性更強。 | 起始模板量低時擴增偏差大 |
MALBAC | 多次退火環狀循環擴增技術 | 起始模板量極低時擴增難度加大。 | |
MDA | 利用隨機引物和鏈置換的?29聚合酶,在DNA的多個位點同時開始復制,既多重置換擴增 | MDA相比于MALBAC有更高的覆蓋度,從而可以檢測更多的單核苷酸變異(SNVs) | MDA是非線性的擴增,依然存在較大的擴增偏好性。 |
DOP-PCR
采用隨機引物或者部分隨機引物,通過熱循環實現指數擴增,具體來說DOC-PCR(Degenerate Oligonucleotide Primed PCR),即退化寡核苷酸引物PCR,是隨機擴增得到全基因組序列的;這不同于一般的PCR,一般的PCR只能擴增特定的DNA片段。該技術需要使用簡并配對引物,即類脫氧肌苷引物,它可以結合到DNA任何部位。引物的3’端為6bp退化寡核苷酸,5’端為正常的堿基。3’端和DNA鏈隨機結合,最初幾個循環退火溫度要低(30℃左右),然后延伸直到5’端引物配對處。但該技術容易造成堿基對突變、短串聯重復( short tandem repeat,STR)增加或減少。
圖3.DOP-PCR原理
多次退火環狀循環擴增技術
技術原理:擬線性的擴增過程降低了指數擴增的序列偏好性。擴增引物,5’含有27 bp的共同序列,3’是8 bp的隨機序列。利用特殊的隨機引物,使擴增產物能首尾互補形成環,進行近乎線性的全基因組預擴增,再通過PCR技術進行指數式擴增,從而降低擴增過程中錯誤累積。擴增偏好性可重復,適合CNV檢測;聚合酶保真性一般,不適合SNV檢測。
圖4.MALBAC原理圖
多重置換擴增
采用隨機6堿基引物,在恒溫條件下,由Phi29 DNA聚合酶引導,與模板DNA結合,進而置換模板的互補鏈,而后循環擴增。Phi29 DNA聚合酶相對傳統的DNA聚合酶具備更高的擴增效率和保真性。具體來說MDA擴增原理是使用隨機的六聚體引物和phi29DNA聚合酶進行反應,在恒溫條件下進行擴增。該聚合酶具有很強的鏈置換特性,可擴增產生50~200 kb的DNA片段,可用于構建大片段文庫,同時該酶還能以新合成的DNA子鏈為模板,繼續合成新的DNA子鏈,擴增產量高,同時由于其3’-5’核酸外切酶活性和校對活性,phi29 DNA聚合酶具有很高的復制保真性,準確性更高、基因組覆蓋度更高,適用于SNV分析。雖然產物產量高和擴增產物長度可達100 Kb左右,覆蓋度好,但是對樣本質量要求高且指數擴增的偏好性重復性不好,不適合CNV類檢測。
圖5.MDA單細胞基因組測序流程
生育健康NGS檢測產品選擇指南
產品應用 | 產品類別 | 產品名稱 | 產品貨號 |
NIPT | cfDNA提取 | MolPure® Magnetic Cell-Free DNA Kit 磁珠法游離DNA提取試劑盒 | 18382ES |
機械法建庫 | Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 2.0全能型DNA建庫試劑盒2.0 | 12927ES | |
機械法建庫 | Hieff NGS® DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫試劑盒 | 13577ES | |
遺傳病檢測 (WES/CNV-seq) | 血液gDNA提取 | MolPure® Magnetic Blood DNA Kit 磁珠法血液 DNA 提取試劑盒 | 18504ES |
酶切法建庫 | Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3一步法DNA建庫試劑盒V3 | 12194ES | |
PGT-A | 單細胞全基因組擴增 | Hieff NGS® Single Cell/Low Input WGA Kit 單細胞或低投入量全基因組擴增試劑盒 | 12510ES |
酶切法建庫 | Hieff NGS® C169P1 OnePot Pro DNA Library Prep Kit 一步法DNA建庫試劑盒 | 13570ES |
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