中國在主要學科方面全部進入前25名，科學論文的計量分析是對基礎研究狀況評價的重要參考。SCI科學引文索引數據庫）收錄我國科學家發表的論文總數從1991年的第15位上升到2004年的第5位（2005年繼續堅持第5位）所占份額穩步快速增長；論文被引用次數從2002年的第19位上升到2005年第13位。對主要學科領域1992-2003年論文數、引文數、高被引論文數和熱點論文數等指標的綜合分析標明。其進展往往難以預測，基礎研究厚積薄發。需要臨時積累。政府將為基礎研究提供穩定支持，以實現基礎研究繼續快速發展，顯著提升我國原始性創新能力，為建設創新型國家發揮基礎性和先導性作用。

　　其中數學、資料科學、化學、工程技術、物理學在基準線水平之上，地學和計算機科學處于基準線水平，生命科學整體上還處于基準線水平之下，但已出現強勁增長勢頭。例如，對細胞生物學和遺傳學領域17個重要研究方向發展態勢的分析標明，2001-2005年共有16個研究方向的論文總量進入世界*名，絕大多數研究方向的被引次數開始進入世界前15名。特別值得一提的寂靜了25年之后，2005年中國學者在生命科學雜志Cell上以作者身份發表論文5篇，加上參與合作的論文，共計有9篇，今年截至目前已在該雜志合作發表了7篇論文。另外，許多有應用價值的原始性研究效果已經形成重要。

　　近年來，國學者在獲得重要獎勵、組織和刊物任職方面一直是單薄環節。這種情況已有所改善。例如，近兩年我國又有14位科學家榮獲了歐洲物理學會菲涅爾獎、薩拉姆科技獎、杰出女科學家獎等科學獎，有4人當選為重要科學組織如科學院委員會主席、發展中國家科學院副院長等要職，有40人次當選為重要學術組織或其他國家科學院的院士（會士）有多人出任著名期刊重要職務，包括*出任Scienc周刊評審編輯。

　　十五"期間，基礎研究隊伍不時發展壯大。據統計。國基礎研究人員全時當量從2001年的7.88萬人年增長到2005年的11.54萬人年，增長了46.45%2005年，R&D人員全時當量為136.48萬年，其中基礎研究人員的全時當量占8.46%

　　國正在運行的國家重點實驗室約200個，國注重基礎研究基地建設。截至到目前。國家野外科學觀測研究站網絡不時發展完善，一批大科學工程裝置已經建成并取得重要研究效果，中國科學院知識創新工程和教育部985工程在科研平臺方面也給予高強度投入。通過這些基地的建設，使我國科學研究實驗設施和研究環境得到明顯改善。

　　國基礎研究近年來發展加速，總體而言。大大縮短了與水平的差異，正在從量的擴張向質的提升轉變，某些領域已進入前列。基礎研究的快速發展無疑將大幅度提升我國的科技創新能力。

　　基礎研究經費總投入年均增長19.4%，十五"期間。973計劃和四個重大科學研究計劃2006年立項工作已基本完成。

　　發展國家重點實驗室體系的同時，基地建設方面。開展了國家實驗室試點；為落實《規劃綱要》精神，還探索在若干企業建立國家重點實驗室，促進企業自主創新能力的提高。科學數據共享工程等國家科技基礎條件平臺建設方面，加強共享機制研究與實踐。