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單細(xì)胞測序“加速器“:瑞孚迪,讓功能基因組學(xué)研究更快一步!

來源:上海瑋馳儀器有限公司   2024年10月16日 17:09  

單細(xì)胞測序技術(shù)被廣泛的應(yīng)用于功能基因組學(xué)研究中,為了探究基因組的動(dòng)態(tài)表達(dá)、調(diào)控機(jī)制以及這些機(jī)制如何影響生物體的表型,通過單細(xì)胞測序更深入地了解細(xì)胞間的異質(zhì)性,揭示在生物體發(fā)育、疾病進(jìn)展過程中單個(gè)細(xì)胞所扮演的關(guān)鍵角色,對(duì)于理解人類疾病的發(fā)生機(jī)制、開發(fā)新的治療方法以及推動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展具有重要意義。


然而單細(xì)胞測序技術(shù)作為工具去使用并不容易,要經(jīng)過單細(xì)胞懸液制備,細(xì)胞活力質(zhì)控,單細(xì)胞標(biāo)簽,mRNA逆轉(zhuǎn)錄,cDNA擴(kuò)增、文庫制備等一系列操作后才能進(jìn)入測序環(huán)節(jié),這些過程且相當(dāng)復(fù)雜,對(duì)操作人員的專業(yè)水平要求高,如何建立自動(dòng)化標(biāo)準(zhǔn)化流程、穩(wěn)定輸出高質(zhì)量文庫仍然是個(gè)難題。





瑞孚迪(Revvity)專注于自動(dòng)化技術(shù)30余年,在測序樣本前處理全流程自動(dòng)化的解決方案上已大有所成。現(xiàn)在我們進(jìn)一步結(jié)合公司在細(xì)胞成像、核酸檢測、文庫構(gòu)建等優(yōu)勢(shì)產(chǎn)品,為功能基因組研究中的單細(xì)胞測序領(lǐng)域貢獻(xiàn)力量。


單細(xì)胞懸液制備


Omni Bead Ruptor珠磨均質(zhì)儀可以解決單細(xì)胞測序制備程的第一步---單細(xì)胞懸液制備。它是一個(gè)多功能的臺(tái)式設(shè)備,其載架運(yùn)動(dòng)模式設(shè)計(jì)有助于樣本解離。加上優(yōu)化的解離管,樣本可被均勻地分解成高活力的單細(xì)胞懸浮液。


組織樣本可簡單的放入組織解離管中進(jìn)行分解,該解離管經(jīng)優(yōu)化設(shè)計(jì)。

設(shè)備可同時(shí)容納多達(dá)12個(gè)解離管,組織分解方法經(jīng)過充分的技術(shù)驗(yàn)證。




通過使用我們的樣品分解技術(shù)優(yōu)化您的單細(xì)胞分離方案,以取代傳統(tǒng)的手動(dòng)制備方法,不僅提高了通量和速度,更關(guān)鍵的,提高您獲得優(yōu)質(zhì)結(jié)果的信心!


細(xì)胞質(zhì)控


精確的細(xì)胞計(jì)數(shù)和活率評(píng)估對(duì)于單細(xì)胞測序至關(guān)重要。瑞孚迪細(xì)胞計(jì)數(shù)儀以其先進(jìn)的硬件設(shè)計(jì)、智能化的軟件識(shí)別,結(jié)合定制試劑與耗材,為細(xì)胞定量提供快速有效的方法,可從復(fù)雜混亂的樣本中精準(zhǔn)識(shí)別和定量目標(biāo)細(xì)胞群,用于單細(xì)胞測序文庫制備前對(duì)細(xì)胞的質(zhì)量控制。





Cellaca MX和Cellometer Ascend細(xì)胞計(jì)數(shù)儀特點(diǎn):

精確定量細(xì)胞

排除無核雜質(zhì)

低樣品量消耗

靈活通量選擇

瑞孚迪細(xì)胞計(jì)數(shù)平臺(tái)配套有全面的試劑、耗材和標(biāo)準(zhǔn)微珠。


文庫制備


瑞孚迪擁有一套測序前樣本制備與質(zhì)控的全流程解決方案。在文庫制備環(huán)節(jié),我們最新開發(fā)了一款專屬機(jī)型---Fontus NGS,專門應(yīng)用于NGS文庫制備。在單細(xì)胞測序的文庫構(gòu)建工作中,自動(dòng)化建庫儀發(fā)揮舉足輕重的作用,無論是形成微滴法 (Droplet) 還是微孔法 (Microwell) ,單細(xì)胞被標(biāo)簽后,都是要進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄、cDNA擴(kuò)增與純化、文庫構(gòu)建等制備操作,這些既關(guān)鍵又費(fèi)時(shí)費(fèi)力的工作都可以在單細(xì)胞文庫構(gòu)建儀上輕松完成。





Fontus單細(xì)胞文庫構(gòu)建儀為不同通量要求提供兩個(gè)機(jī)型,24通量和96通量,均可實(shí)現(xiàn)全流程自動(dòng)化,包括溫控、PCR擴(kuò)增純化等。

不同的單細(xì)胞測序平臺(tái)的樣本制備流程也不同,F(xiàn)ontus預(yù)置了幾大主流單細(xì)胞測序平臺(tái)的自動(dòng)化程序方案(經(jīng)廠家驗(yàn)證),實(shí)現(xiàn)了開箱即用,同時(shí)強(qiáng)大的廠家技術(shù)服務(wù)可支持新自動(dòng)化方法開發(fā)。


DNA和RNA質(zhì)控


LabChip GX Touch 核酸分析儀使用基于芯片的微流控技術(shù),DNA和RNA的定量和片段大小可以在幾秒鐘內(nèi)完成。小于150 nL的樣品用于片段尺寸和濃度分析,生成高分辨率的、可重復(fù)的數(shù)據(jù)。


LabChip微流控技術(shù)使凝膠電泳現(xiàn)代化。

全自動(dòng)樣本檢測分析最快可達(dá)30秒。

提供RNA和DNA樣本完整性量化指標(biāo),質(zhì)量評(píng)分。



數(shù)字化數(shù)據(jù)格式,便于分析、審查、共享和存檔。

不同通量選擇:處理通量1-24個(gè)樣品的型號(hào)使用靈活,節(jié)約時(shí)間;處理通量1-384個(gè)樣品的型號(hào)適用于高通量工作流程。


我們以Fontus單細(xì)胞建庫儀為例詳細(xì)說明其特點(diǎn)








我們以市面上常見的微滴法 (Droplet) 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序工作流程舉例展示瑞孚迪的組合產(chǎn)品





文庫結(jié)果表現(xiàn)


表1:使用瑞孚迪建庫儀對(duì)24個(gè)單細(xì)胞油包水后樣本進(jìn)行建庫的濃度結(jié)果






使用瑞孚迪建庫儀構(gòu)建的文庫用LabChip質(zhì)控儀檢測片段大小


瑞孚迪產(chǎn)品組合加速單細(xì)胞測序流程,助力功能基因組學(xué)研究。每個(gè)工作環(huán)節(jié)皆有多款設(shè)備可供選擇,其中自動(dòng)化建庫儀有幾個(gè)款式可選,均可實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞測序從RNA反轉(zhuǎn)錄開始到文庫建好的自動(dòng)化流程。不同配置的選擇、不同通量的選擇,讓用戶可以自由的選擇適合自身需求的設(shè)備,標(biāo)準(zhǔn)化的操作精準(zhǔn)度、均一穩(wěn)定的結(jié)果輸出,讓您在解放雙手的同時(shí)建立實(shí)驗(yàn)保障的信心。


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