微生物的生物安全分級多種不同的方法和體系，但差別不大。國際上大多數國家對微生物生物安全分級情況如下：一級指對人或動物無明顯致病性的，對環境危害程度微小的，特性清楚的病原微生物；二級是指對人或動物致病性低的，對環境有輕微危害的病原微生物的生物安全水平；三級是指有可能經呼吸道傳播以及引起嚴重的或致死性疾病的、對人引發的疾病具有有效的預防和治療措施的病原微生物；四級是指能通過氣溶膠傳播，實驗室感染高度危險，嚴重威脅人和或動物生命和危害環境的，沒有預防和治療方法的微生物。對轉基因微生物的危害性評估更為困難，需要考慮轉基因微生物對于菌株提供和接收者的影響[4]。

　　我國根據微生物菌（毒）種的危害性，分為四類：一類病原微生物，是指能夠引起人類或者動物非常嚴重的疾病的微生物，以及我國尚未發現或者已經宣布消滅的微生物；二類病原微生物，是指能夠引起人類或者動物嚴重的疾病的微生物，比較容易直接或間接在人與人、動物與人、動物與動物間傳播的微生物；第三類病原微生物，是指能夠引起人類或者動物疾病，但一般情況下對人、動物或者環境不構成嚴重危害，傳播風險有限，實驗室感染后很少引起嚴重疾病，并且具備有效治療和預防措施的微生物；第四類病原微生物，是指在通常情況下不會引起人類或者動物疾病的微生物[5]。

　　微生物材料的遵照國際航空運輸協會、萬國郵政聯盟、聯合國危險品運送專家委員會等對微生物有機制品運送的相關規定。材料包裝運輸遵照國際航空運輸協會危險品規則“危險傳染物需用干冰保存于冷凍箱中運輸，必須附有發貨人說明"的字樣。英國的UKNCC規定在運送、包裝、檢驗隔離環節上遵循《英國微生物學會安全操作和傳遞微生物有機體規則》[3]。我國的微生物菌種資源平臺項目組制定了《一、二類微生物菌（毒）種包裝、運輸和開啟技術規程》和《三、四類微生物菌（毒）種包裝、運輸和開啟技術規程》對規范微生物菌（毒）種材料的規范包裝、運輸，進行了詳細的規定[6]。

　　我國對生物危害安全等級較高的微生物菌種規定較為嚴格，如《獸醫微生物菌種保藏管理試行辦法》規定“一、二類菌種應嚴格控制供應范圍，經省、市、自治區畜牧（農業）局審定，認為符合本辦法規定的使用條件者，經農業部批準，方可供給。"“不能郵寄的菌種及一、二類菌種，必須派專人領取"；“使用單位必須制定使用、保存菌種的制度，專人負責保管"；“使用一、二類菌種的單位，應有隔離設備和措施，嚴防散毒。試驗結束時，應由單位領導監督銷毀，并將情況以正式公函報管理中心備查" [7]。《中國醫學微生物菌種保藏管理辦法》的規定如下,“索取一、二類菌種時，需經當地省、自治區、直轄市衛生局同意，部隊系統需經省級*（或軍級）衛生主管部門同意。索取一類菌種并需經衛生部批準"；“使用菌種的單位，需有一定從事微生物工作的條件和設備。菌種應有專人負責管理，建立必要的制度。使用一類菌種的單位，需經衛生部批準，使用二類菌種的單位需經省、自治區、直轄市衛生局批準。使用單位要有嚴格的專用隔離實驗室和專用下水、消毒、排氣過濾及嚴格的防鼠、防蟲設施。進行有關的昆蟲試驗時，應有相應的防蟲及殺蟲裝置。進行一類菌種實驗時，應設有單獨隔離區，經上級主管部門檢查符合要求后，由經過專門訓練，有經驗的技術人員操作，工作時應有嚴格防護措施。凡有疫苗者，工作人員應進行免疫接種，未經免疫接種人員不得進入隔離區及進行菌種操作。任務完成后應在本單位領導監督下，將菌種銷毀。凡進行菌種的動物實驗時，都相應地升一級進行管理，二類按一類，三類按二類管理。"“索取一、二類菌種應事先與供應單位聯系，經同意后，一類菌種及二類菌種中的馬鼻疽假單胞菌、麻風分枝桿菌，狂犬病病毒（街毒）及出血熱病毒等，應派可靠人員向供應單位領取（一類應派二人領取），不得郵寄[8]。"