在已發現的昆蟲病原菌中，真菌約占60% 。已知有800多種真菌能寄生在昆蟲和螨類體 內，導致它們發病而死亡。主要的殺蟲真菌分屬于蟲霉屬、曲霉屬、白僵菌屬、綠僵菌屬和擬青霉菌屬中，其中以白僵菌、綠僵菌、擬青霉的應用范圍，效果。 真菌殺蟲劑在昆蟲的病原微生物中，種類最多的是真菌。目前，世界上有記載的殺蟲真菌約有100個屬、800多個種，分屬于真菌的5個亞門中。真菌是最早被發現引起昆蟲疾病的微生物，也是首先被研制成殺蟲劑的微生物。主要有白僵菌(Beauveria)、綠僵菌(Metarrhizim)、蟲霉(Entomophthora)、雕蝕霉(Coelomomyces)、擬青霉(Paecilomyces)等。其中以白僵菌、綠僵菌和擬青霉的應用范圍最大。

　　利用真菌防治蟲害時，可以通過采用固體發酵法或液體深層發酵法，大量收獲真菌菌體或分生孢子，將其制成菌劑，進行大面積噴灑。一般真菌殺蟲劑有較寬的宿主范圍，可使多種昆蟲致病。

　　白僵菌(Beauveria)是半知菌類真菌，屬絲孢綱、絲孢目、叢梗孢科、白僵菌屬。可在鱗翅目、直翅目、半翅目和雙翅目的700多種幼蟲體內寄牛，對多種農林害蟲有致死作用。白僵菌感染蟲體后，其分生孢子萌發，并產生幾丁質酶溶解昆蟲表面，侵入蟲體內生長繁殖，分泌白僵菌素(beauvericin)毒素和草酸鈣結晶殺死寄主，并在其上生出白色的絮狀菌絲和大量的分生孢子，死蟲僵直，并呈白茸毛狀。目前已成為真菌中治蟲效果的農藥之一，廣泛應用于殺滅農林害蟲，如玉米螟、大豆食心蟲、棉花紅蜘蛛、馬鈴薯甲蟲、甘薯象鼻蟲、稻飛虱、稻葉蟬、松毛蟲等。但是白僵菌對家蠶也有毒害作用，人在生產過程中若接觸和吸收了較多的白僵菌孢子，可產生短時的類似于感冒的癥狀。

　　半知菌類真菌綠僵菌(Metarrhizium)也是一種廣譜殺蟲真菌，與白僵菌同綱，瘤座孢日、瘤座孢科、綠僵菌屬。其侵染昆蟲的途徑、致病機理和生產方式都與白僵菌相似，但要求培養溫度、濕度較嚴格。用其制成殺菌劑，可防治地下害蟲、玉米鉆心蟲、甘蔗金龜子、天牛、飛蝗、蚊幼蟲等。

　　半知菌類真菌擬青霉(Paeciomyces)中某些種能感染昆蟲并使其致病死亡。如用粉擬青霉(Paecilomyces farinosus )防治松毛蟲，用丁香擬青霉(Paecilomyces  lilacinus)防治大豆孢囊線蟲、馬鈴薯孢囊線蟲和煙草根結線蟲，并可促進植物生長。

　　蟲霉菌(Entomophthora)是接合菌亞門的真菌，它所產生的孢子抗逆能力強、易于傳播、傳染快，在合適條件下能引起宿主害蟲的大規模流行病。用其中的蝗蟲霉(Entomophthora grylli)、蚜蟲霉(Entomophthora  aphidis)、圓孢蟲霉(Entomophora sphaerosperma)等制成殺蟲劑，可分別防治蝗蟲、蚜蟲及螨、蚧類和蝶蛾類害蟲。

　　鞭毛菌業門中的雕蝕霉(Coelomomyces)是專性水生病原菌，多數種寄生于孑孓。在野外的孑孓中，90％以上被它們寄生，起著控制蚊蟲種群的作用。