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離子色譜儀雖然市場上種類繁多，但是其結構主要包括泵液系統、進樣系統、色譜分離柱、檢測器、數據處理五個部分組成。
離子色譜儀工作原理：充分利用固定相與流動相間的交換作用，固定相中離子交換樹脂上可離解的離子與流動相中具有相同電荷的溶質離子在分離色譜柱中滯留時間長短不同，分析物溶質與交換劑之間親和力的差異性進行分離。
離子色譜儀測定常見陰離子效果比較好，比較適用于親水性陰、陽離子的分離。色譜儀便于檢測的常見陰離子包括：F-, Cl-, Br-, NO2-, PO43-, NO3-,SO42-等；
檢測的陽離子主要包括:Li+, Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+, Cu2+, Zn2+,
Fe2+, Fe3+等。
離子色譜儀具有快速、高效、準確等優點，對于高濃度樣品的檢測，檢測結果不太理想，只有把高濃度樣品進行稀釋，然后再進行測定分析。而且離子色譜儀測定的范圍也比較有限，設備使用過程需要經常維護，才能確保其性能良好。
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