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生物顯微鏡是用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養、流質沉淀等的觀察和研究，同時可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體。
生物顯微鏡是一種用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養、流質沉淀等也可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體的精密光學儀器。生物顯微鏡用來供醫療衛生單位、高等院校、研究院所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。其光學技術參數包括：數值孔徑、分辨率、放大率、焦深、視場寬度、覆蓋差、工作距離等。這些參數并不都是越高越好，它們之間既相互聯系又相互制約的，實際應用中應當在保證分辨率的基礎上根據鏡檢的目的和實際情況來協調參數間的關系。
用途：用于生物學、細菌學、組織學、藥物化學等研究工作以及臨床度驗之用。具有粗微動同軸的調焦機構，滾珠內定位轉換器，亮度可調的照明裝置，并帶有攝影、攝像接口。
生物顯微鏡的使用步驟：
取鏡和安放。右手握住鏡臂，左手托住鏡座，將顯微鏡放在實驗臺上略偏左的位置，距邊緣約7厘米。
對光。轉動轉換器，使低倍物鏡對準通光孔，確保物鏡前端與載物臺保持2至5厘米的距離；調節光圈和反光鏡，使光線通過通光孔反射到鏡筒內，通過目鏡可以看到白亮的圓形視野。
觀察。放置玻片標本于載物臺上，用壓片夾固定，確保標本正對通光孔中心；轉動粗準焦螺旋，使鏡筒緩緩下降，直到物鏡接近玻片標本；左眼通過目鏡觀察，同時逆時針轉動粗準焦螺旋使鏡筒緩緩上升，直到看清物像為止；略微轉動細準焦螺旋，使物像更清晰。
換用高倍物鏡。先用低倍物鏡找到觀察的物象，并將其調整到視野中央；然后轉動轉換器，換用高倍物鏡；由于換用高倍物鏡后視野會變暗，可能需要調整光圈大小和反光鏡角度以獲得合適的光亮。
整理。實驗結束后，用干凈的布擦拭顯微鏡外表，轉動轉換器將物鏡偏轉到兩旁，將鏡筒緩慢下降到*低處，反光鏡豎直放置，最后將顯微鏡放回鏡箱中。
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