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生物顯微鏡是一種用來觀察生物切片、生物細胞、細菌以及活體組織培養、流質沉淀等也可以觀察其他透明或者半透明物體以及粉末、細小顆粒等物體的精密光學儀器。生物顯微鏡用來供醫療衛生單位、高等院校、研究院所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。其光學技術參數包括：數值孔徑、分辨率、放大率、焦深、視場寬度、覆蓋差、工作距離等。這些參數并不都是越高越好，它們之間既相互聯系又相互制約的，實際應用中應當在保證分辨率的基礎上根據鏡檢的目的和實際情況來協調參數間的關系。
按成像原理分：光學顯微鏡，電子顯微鏡。按類型分：生物顯微鏡、金相顯微鏡、體視顯微鏡(解剖鏡)、偏光顯微鏡、相差顯微鏡、熒光顯微鏡、工具測量顯微鏡。按結構和用途分：透射式電子顯微鏡、掃描式電子顯微鏡、反射式電子顯微鏡和發射式電子顯微鏡。
生物顯微鏡保養
1、加用蓋玻片后，標本表面勻平，光線得以集中，便于檢查。
2、顯微鏡在從木箱中取出或裝箱時，右手緊握鏡臂，左手穩托鏡座，輕輕取出。不要只用一只手提取，以防顯微鏡墜落，然后輕輕放在實習臺上或裝入木箱內。
3、生物顯微鏡放到實習臺上時，先放鏡座的一端，再將鏡座全部放穩，切不可使鏡座全面同時與臺面接觸，這樣震動過大，透鏡和微調節器的裝置易損壞。
4、顯微鏡須經常保持清潔，勿使油污和灰塵附著。如透鏡部分不潔時，用擦鏡紙輕擦，如有油污，先將擦鏡紙蘸少許二甲苯拭去。
5、生物顯微鏡應放在干燥的地方，以防生霉。
顯微鏡用完后，取下標本片，經聚光器降下，再將物鏡轉成“八”字形，轉動粗調節器使鏡筒下降，以免接物鏡與聚光器相碰。
6、顯微鏡不能在陽光下暴曬和使用。
接目鏡和接物鏡不要隨便抽出和卸下必須抽取接目鏡時，須將鏡筒上口凈用布遮蓋，避免灰塵落入鏡筒內。更換接物鏡時，卸下后應倒置在清潔的臺面下，并隨即裝入木箱的置放接物鏡的管內。
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